TRAT1 (T cell receptor associated transmembrane adaptor 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TRAT1
locus group:
protein-coding gene
location:
3q13.13
gene_family:
alias symbol:
HSPC062|TRIM
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None
entrez id:
50852
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NM_016388
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HGNC:30698
approved reserved:
2004-11-03

基因染色体位置

基因染色体位置

3q13.13
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TRAT1（T细胞受体相关转录因子1）是一个在免疫系统中发挥重要作用的基因，主要参与T细胞受体（TCR）信号通路的调控。它编码的蛋白质是TCR信号转导复合物的关键组成部分，通过与CD3ζ链结合，帮助稳定TCR-CD3复合物的结构，从而促进T细胞激活。TRAT1在T细胞发育、增殖和功能调节中至关重要，特别是在免疫应答的早期阶段。如果TRAT1发生突变，可能导致T细胞信号传导异常，进而引发免疫缺陷或自身免疫性疾病。例如，某些研究表明TRAT1突变可能与T细胞功能紊乱相关的疾病有关。当TRAT1过表达时，可能增强T细胞活性，导致过度免疫反应或自身免疫疾病；而降低表达则可能削弱T细胞功能，增加感染风险或免疫抑制状态。TRAT1属于TRAT基因家族，该家族成员通常参与免疫信号传导，尤其是TCR相关通路。TRAT家族基因的共性包括编码与TCR信号复合物相互作用的适配蛋白，调节T细胞激活和免疫稳态。TRAT1的功能研究为理解免疫调节机制和开发相关疾病的治疗策略提供了重要线索。

None

无

OMIM数据库中对TRAT1基因的介绍     Wikipedia数据库中对TRAT1基因的介绍

基因序列

基因序列

TRAT1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TRAT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs951114       rs1348994       rs1374818       rs1374819       rs1374822       rs1447701       rs1447703       rs1447704       rs1447705       rs1447707       rs1447708       rs1447712       rs1447713       rs1449353       rs1597075       rs2121760       rs2218632      

基因表达

基因表达

TRAT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGAAGCATGTCAGGAATCTC
58
TGATATAACCAAAGCCAAGCC
59
CTAGCATTGTTGGGCTTGG
59
ATACTCATCAACCCTTGTCGT
59
GAACAAATGAAAGCCCGAC
58
GTGTTTCATTGGTTGCCTG
58
GCTTGGCTTTGGTTATATCAC
58
AATACTCATCAACCCTGGTG
57
GAACAAATGAAAGCCCGAC
58
GTGTTTCATTGGTTGCCTG
58
TGTCAGGAATCTCTGGGTG
58
ATAATACTCATCAACCCTGGTG
57
TGAACAAATGAAAGCCCGA
58
GTTTCATTGGTTGCCTGTG
58
AAAGAAGCATGTCAGGAATCTC
59
GATATAACCAAAGCCAAGCCC
60
TGTCAGGAATCTCTGGGTG
58
TACTCATCAACCCTGGTGTG
59
CTAGCATTGTTGGGCTTGG
59
TACTCATCAACCCTTGTCGT
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TRAT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRAT1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001920
Q6PIZ9 (UniProtKB)
IDA
GO:0002250
Q6PIZ9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005068
Q6PIZ9 (UniProtKB)
TAS
GO:0005622
Q6PIZ9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q6PIZ9 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q6PIZ9 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q6PIZ9 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q6PIZ9 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q6PIZ9 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q6PIZ9 (UniProtKB)
TAS
GO:0006968
Q6PIZ9 (UniProtKB)
TAS
GO:0007165
Q6PIZ9 (UniProtKB)
TAS
GO:0007169
Q6PIZ9 (UniProtKB)
IEA
GO:0014066
Q6PIZ9 (UniProtKB)
TAS
GO:0042101
Q6PIZ9 (UniProtKB)
IDA
GO:0046854
Q6PIZ9 (UniProtKB)
IEA
GO:0046934
Q6PIZ9 (UniProtKB)
TAS
GO:0048015
Q6PIZ9 (UniProtKB)
TAS
GO:0050850
Q6PIZ9 (UniProtKB)
IDA
GO:0050852
Q6PIZ9 (UniProtKB)
TAS
GO:0050862
Q6PIZ9 (UniProtKB)
IDA
GO:0051051
Q6PIZ9 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TRAT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
HIV Infections 0.001628651 6 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000814326 3 0 BeFree
Ataxia Telangiectasia 0.000271442 1 0 BeFree
Solid tumour 0.000271442 1 0 BeFree
Central neuroblastoma 0.000271442 1 0 BeFree
Retroviridae Infections 0.000271442 1 0 BeFree
Neuroblastoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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