TRAF3IP2-AS1 (TRAF3IP2 antisense RNA 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TRAF3IP2-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
6q21
gene_family:
alias symbol:
C6UAS|BetaFAAR
alias name:
Beta-cell function and apoptosis r…
entrez id:
643749
ensembl gene id:
ENSG00000231889
ucsc gene id:
uc063qri.1
refseq accession:
NR_034108
hgnc_id:
HGNC:40005
approved reserved:
2011-04-28

基因染色体位置

基因染色体位置

6q21
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TRAF3IP2-AS1是一个长链非编码RNA（lncRNA）基因，位于人类6号染色体上，是TRAF3IP2基因的反义转录本。它通过调控邻近基因TRAF3IP2的表达或独立发挥功能参与多种生物学过程。TRAF3IP2基因编码的蛋白参与NF-κB和JNK信号通路的激活，在免疫调节和炎症反应中起重要作用。TRAF3IP2-AS1作为其反义RNA，可能通过表观遗传修饰或转录干扰影响TRAF3IP2的表达水平。研究表明，TRAF3IP2-AS1的异常表达与自身免疫性疾病如银屑病和类风湿性关节炎相关，可能通过调节炎症因子释放或免疫细胞功能参与疾病发生。当TRAF3IP2-AS1过表达时，可能抑制TRAF3IP2的正常功能，导致NF-κB信号通路失调，加剧炎症反应；而表达降低则可能使TRAF3IP2过度激活，同样破坏免疫平衡。该基因属于长链非编码RNA家族，这类RNA通常不编码蛋白质，但可通过调控基因表达、染色质重塑或作为分子支架参与细胞过程。TRAF3IP2-AS1的具体作用机制仍在研究中，但已知lncRNA家族成员普遍具有组织特异性表达模式，并在发育、分化和疾病中发挥重要调控作用。针对TRAF3IP2-AS1的深入研究可能为自身免疫性疾病的治疗提供新靶点。

None

无

OMIM数据库中对TRAF3IP2-AS1基因的介绍     Wikipedia数据库中对TRAF3IP2-AS1基因的介绍

基因序列

基因序列

TRAF3IP2-AS1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TRAF3IP2-AS1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs9487649       rs17072723       rs17510346       rs17510353       rs17510360       rs17510374       rs17539093       rs17539114       rs36230529       rs36230530       rs56278902       rs61269242       rs74510204       rs75317579       rs78188923       rs138096836       rs140357312      

基因表达

基因表达

TRAF3IP2-AS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AACTTATGTATTCCCACGAGC
58
CATGCTCTCCATTTCCTTCTC
59
AGAGCATCATTTAGAAGAGGGA
59
CGTGGGAATACTCTAGATTTCCT
60
TGTGAGAGCTACTCGTTTGG
60
CAAAGCATGGTCACCAGTG
60
TGTGAGAGCTACTCGTTTGG
60
CAAAGCATGGTCACCAGTG
60
TTTCACATCCAGCAGAGGAG
60
GCAATATAGTGAGACCTCATCTC
58
AGAGCTACTCGTTTGGAACC
60
TCGTGGGAATACAGTGAGC
60
TTTCACAAGGTGACCATGC
59
GTCTTCTTTAACTCGCTGGG
59
TTTCACAAGGCTTTCTCCA
57
TAGAGACTGGAGCAAAGGT
58
GCTTAAGGAAATCTAGAGTATTCCC
59
TCTCCTCCAAATCTCACACG
60
GTTTCTGTCGCAACCTTCG
60
CTAACCACAGAGAAGAGGGTC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TRAF3IP2-AS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRAF3IP2-AS1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TRAF3IP2-AS1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Inflammatory Bowel Diseases 0.12 1 1 GWASCAT
Psoriasis 0.12 1 1 GWASCAT
Arthritis, Psoriatic 0.12 1 1 GWASCAT

基因相关服务

基因相关服务

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