TPBG (trophoblast glycoprotein)

symbol:
TPBG
locus group:
protein-coding gene
location:
6q14.1
gene_family:
alias symbol:
5T4-AG|5T4
alias name:
None
entrez id:
7162
ensembl gene id:
ENSG00000146242
ucsc gene id:
uc063ptt.1
refseq accession:
NM_001166392
hgnc_id:
HGNC:12004
approved reserved:
1990-10-16
6q14.1
基因染色体位置图

TPBG(Trophoblast Glycoprotein,滋养层糖蛋白)是一种跨膜糖蛋白,属于TGF-β(转化生长因子-β)超家族相关蛋白。它的生物学功能主要涉及细胞黏附、信号传导和胚胎发育调控,尤其在滋养层细胞(胎盘形成的关键细胞)中高表达。TPBG通过与其他细胞表面受体(如整合素)相互作用,参与细胞间通讯和组织结构维持。其表达产物具有免疫调节特性,可能通过抑制T细胞活性影响母体对胎儿的免疫耐受。主要作用位点包括胎盘、某些肿瘤组织(如结肠癌、乳腺癌)以及部分正常上皮细胞。TPBG基因突变可能导致胚胎着床障碍或胎盘功能异常,与复发性流产、子痫前期等妊娠并发症相关。在癌症中,TPBG的异常表达(通常过表达)与肿瘤进展、转移和不良预后相关,可能通过促进上皮-间质转化(EMT,一种使细胞获得迁移能力的生物学过程)增强侵袭性。该基因属于一个功能多样的跨膜糖蛋白家族,其成员通常具有细胞外糖基化修饰域和短胞内尾区,参与细胞-微环境相互作用。当TPBG过表达时,可能促进肿瘤细胞迁移并抑制免疫应答;而表达降低则可能影响胎盘发育或组织修复功能。研究还发现TPBG与Wnt/β-catenin(一条调控细胞增殖的重要信号通路)存在交叉作用,其过表达可能激活该通路促癌。目前针对TPBG的干预策略(如抗体靶向治疗)正在某些癌症类型中探索。需要注意的是,"Trophoblast Glycoprotein"在中文文献中有时也被直译为"滋养层糖蛋白",但TPBG作为标准符号更常用。

This gene encodes a leucine-rich transmembrane glycoprotein that may be involved in cell adhesion. The encoded protein is an oncofetal antigen that is specific to trophoblast cells. In adults this protein is highly expressed in many tumor cells and is associated with poor clinical outcome in numerous cancers. Alternate splicing in the 5' UTR results in multiple transcript variants that encode the same protein. [provided by RefSeq, Oct 2009]

此基因编码一种富含亮氨酸的跨膜糖蛋白,其可能参与细胞粘附。所编码的蛋白质是特定于滋养层细胞的癌胚抗原。在成年人这种蛋白质在许多肿瘤细胞中高表达,并与临床结果差了许多癌症相关。在5‘端非编码区替代剪接导致多个转录变异体,其编码相同的蛋白质。 [由RefSeq的,2009年10月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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TPBG基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs770896       rs770911       rs770912       rs1004020       rs1570140       rs4590314       rs6918724       rs62431319       rs62431320       rs73480019       rs75792646       rs76136947       rs80214961       rs113229038       rs116233429       rs138697276       rs138762928      

TPBG基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTTGCTCCAGTCCAAGGAG
60
CTGAGTTCCACCAGAGTAGC
60
ATTAAGCGGTCCCTCAGAG
59
TTCCCTCCAGAAAGTACGC
59
CTCAGAGTTGGTTCTGGAGG
60
TTCCCTCCAGAAAGTACGC
59
CTCAGAGTTGGTTCTGGAGG
60
TTCCCTCCAGAAAGTACGC
59
TCAGAGTTGGTTCTGGAGG
59
CTTCCCTCCAGAAAGTACG
57
TTTGCTCCAGTCCAAGGAG
60
TGAGTTCCACCAGAGTAGC
59
ATTAAGCGGTCCCTCAGAG
59
CCTTCCCTCCAGAAAGTACG
60
TCAGAGTTGGTTCTGGAGG
59
CTTCCCTCCAGAAAGTACG
57
TCAGAGTTGGTTCTGGAGG
59
TTCCCTCCAGAAAGTACGC
59
TTTGCTCCAGTCCAAGGAG
60
GAGTTCCACCAGAGTAGCG
60
      尚未收录相关数据

TPBG基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TPBG基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005783
Q13641 (UniProtKB)
IEA
GO:0005887
Q13641 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
Q13641 (UniProtKB)
NAS
GO:0009986
Q13641 (UniProtKB)
IDA
GO:0051965
Q13641 (UniProtKB)
IEA

可能调控 TPBG基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostatic Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Pre-Eclampsia 0.00272435 1 0 LHGDN
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Pancreatic Ductal Adenocarcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Gastrointestinal Stromal Tumors 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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