TP53TG1 (TP53 target 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TP53TG1
locus group:
non-coding RNA
location:
7q21.12
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
H_RG012D21.9|LINC00096|TP53LC12
alias name:
TP53 target gene 1|long intergen...
entrez id:
11257
ensembl gene id:
ENSG00000182165
ucsc gene id:
uc003uip.5
refseq accession:
NR_015381
hgnc_id:
HGNC:17026
approved reserved:
2003-08-12

基因染色体位置

基因染色体位置

7q21.12
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TP53TG1（TP53 Target 1）是一个由肿瘤抑制基因TP53调控的长链非编码RNA（lncRNA，long non-coding RNA，指长度超过200个核苷酸但不编码蛋白质的RNA分子）。它位于人类染色体20q11.22区域，最初被发现是TP53的直接转录靶标，在DNA损伤反应中发挥作用。TP53TG1的生物学功能主要涉及调控细胞周期、凋亡（程序性细胞死亡）和DNA修复。其表达产物通过结合特定蛋白质或RNA分子，影响下游信号通路，例如抑制癌基因MYC的活性，从而发挥抑癌作用。主要作用位点包括细胞核和细胞质，通过与蛋白质相互作用参与转录调控或mRNA稳定性调节。TP53TG1的突变或表达异常可能导致其功能丧失，削弱TP53介导的肿瘤抑制效应，促进肿瘤发生。研究发现，TP53TG1在多种癌症（如乳腺癌、肺癌、结直肠癌）中表达下调，与肿瘤进展和不良预后相关。若该基因过表达，可能增强细胞对DNA损伤的敏感性，诱导凋亡或周期阻滞；而降低表达则可能使细胞逃避生长抑制，促进增殖。TP53TG1属于TP53调控的lncRNA家族，该家族成员共性是被TP53转录激活，参与应激响应（如氧化应激、基因毒应激）和维持基因组稳定性。需要注意的是，TP53TG1在不同癌症中的作用可能存在组织特异性，例如在胶质瘤中可能通过竞争性结合miRNA发挥促癌作用，显示其功能的复杂性。目前尚无统一的中文译名，部分文献直译为“TP53靶基因1”，但建议保留英文名以避免歧义。

None

无

OMIM数据库中对TP53TG1基因的介绍     Wikipedia数据库中对TP53TG1基因的介绍

基因序列

基因序列

TP53TG1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TP53TG1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2373725       rs3032488       rs3032489       rs3032490       rs7458893       rs7807956       rs11973839       rs11973893       rs11983873       rs11983904       rs12667741       rs28708826       rs34183836       rs35985365       rs36101759       rs57585161       rs58807320      

基因表达

基因表达

TP53TG1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAACTCAGGTTTAACCACCA
58
TCATCAGCTGATGCATTGG
58
CCCTGGTAACAATTCTCTTCAC
59
GCAGTTTATTCTCCGCCAG
59
GAAGGTACCCAACCCTCTG
59
CTTGGTGGTTAAACCTGCG
60
AACCCTCTGGGATAGATGC
59
GTCCTTGGTGGTTAAACCTG
59
CCAACTCAGGTTTAACCACC
59
CATCAGCTGATGCATTGGT
59
CCTGGTAACAATTCTCTTCACC
59
GCAGTTTATTCTCCGCCAG
59
CAACTCAGGTTTAACCACCA
58
CATCAGCTGATGCATTGGT
59
ACCCTCTGGGATAGATGCA
60
GTCCTTGGTGGTTAAACCTG
59
CTGGTAACAATTCTCTTCACCT
58
GCAGTTTATTCTCCGCCAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TP53TG1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TP53TG1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003674
Q9Y2A0 (UniProtKB)
ND
GO:0006950
Q9Y2A0 (UniProtKB)
TAS
GO:0006974
Q9Y2A0 (UniProtKB)
NAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TP53TG1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Colorectal Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Hematocrit level 0.002367032 1 1 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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