TOX3 (TOX high mobility group box family member 3)

symbol:
TOX3
locus group:
protein-coding gene
location:
16q12.1
gene_family:
Trinucleotide repeat containing
alias symbol:
CAGF9
alias name:
None
entrez id:
27324
ensembl gene id:
ENSG00000103460
ucsc gene id:
uc002egw.3
refseq accession:
NM_001080430
hgnc_id:
HGNC:11972
approved reserved:
2000-01-27
16q12.1
基因染色体位置图

TOX3(Thymocyte selection-associated high mobility group box protein 3)是一种编码高迁移率族(HMG-box)转录因子的基因,属于TOX基因家族(包括TOX1/2/3/4)。该家族成员均含有保守的HMG结构域,能够结合DNA并调控染色质结构和基因表达,尤其在免疫系统发育(如T细胞分化)和神经系统功能中发挥关键作用。TOX3蛋白通过其HMG结构域与DNA结合,参与转录调控,主要作用位点包括神经元和乳腺组织,影响细胞增殖、凋亡和激素响应。TOX3的突变或表达异常与多种疾病相关,例如全基因组关联研究(GWAS)发现其单核苷酸多态性(SNPs)与乳腺癌风险显著相关,可能通过影响雌激素受体信号通路;此外,TOX3异常表达还涉及癫痫、双相情感障碍等神经系统疾病。若TOX3过表达,可能促进乳腺细胞异常增殖(如肿瘤发生),或导致神经元过度兴奋(如癫痫发作);而表达降低则可能影响神经发育或免疫功能。TOX基因家族的共性在于依赖HMG结构域参与DNA弯曲和转录调控,广泛影响细胞分化与器官发育。专业术语解释:HMG-box(高迁移率族盒)是一种能结合DNA并改变其结构的蛋白域;GWAS(全基因组关联分析)是通过大规模人群基因检测寻找疾病相关遗传变异的方法;SNPs(单核苷酸多态性)指个体间DNA序列的单碱基差异。目前中文对TOX3的翻译尚统一,部分文献保留英文原名。

The protein encoded by this gene contains an HMG-box, indicating that it may be involved in bending and unwinding of DNA and alteration of chromatin structure. The C-terminus of the encoded protein is glutamine-rich due to CAG repeats in the coding sequence. A minor allele of this gene has been implicated in an elevated risk of breast cancer. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Apr 2009]

由该基因编码的蛋白质包含HMG-框,表明它可能在弯曲和DNA和染色质结构的改变的退绕卷入。所编码的蛋白质的C末端是富含谷氨酰胺由于CAG重复在编码序列。此基因的较小的等位基因已牵涉在乳腺癌的风险升高。两个转录变异体的编码不同亚型也发现了这种基因。[由RefSeq的,2009年4月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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TOX3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs40839       rs40840       rs40841       rs40842       rs42198       rs42380       rs42396       rs42397       rs42542       rs43143       rs171765       rs187679       rs189851       rs189852       rs1075367       rs1076479       rs1111480      

TOX3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTTCATTGCAGTTTGTGCT
57
GTGTGGAATGTCTCACTGG
58
CCTCGTTTCTAAGGCTGCT
60
TTAGATTGGTCGACGCCAG
60
ACCTCCCTTCCATTACAATCTC
60
GCTCTGATCCATATGCAACC
59
GTTCATTGCAGTTTGTGCTC
59
GTGTGGAATGTCTCACTGG
58
CCTCCCTTCCATTACAATCTC
58
GCTCTGATCCATATGCAACC
59
CATTGCAGTTTGTGCTCAG
58
GTGTGGAATGTCTCACTGG
58
      尚未收录相关数据

TOX3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TOX3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003682
O15405 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
O15405 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
O15405 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
O15405 (UniProtKB)
IEA
GO:0006915
O15405 (UniProtKB)
IEA
GO:0034056
O15405 (UniProtKB)
IDA
GO:0042803
O15405 (UniProtKB)
IDA
GO:0043524
O15405 (UniProtKB)
IDA
GO:0045893
O15405 (UniProtKB)
IDA
GO:0051219
O15405 (UniProtKB)
IPI

可能调控 TOX3基因的相关microRNA:     

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of breast 0.170011451 46 21 BeFree_GAD_GWASCAT
Mammary Neoplasms 0.123181358 5 1 BeFree_CTD_human_GAD
Breast Neoplasms, Male 0.12 1 0 CTD_human
Breast Carcinoma 0.009771907 36 20 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0.002909916 2 4 BeFree_GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Restless Legs Syndrome 0.002367032 1 1 GAD
Bipolar Disorder 0.002367032 1 1 GAD
Amyotrophic Lateral Sclerosis 0.002367032 1 1 GAD
Animal Mammary Neoplasms 0.002367032 1 0 GAD

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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