TOX2 (TOX high mobility group box family member 2)

symbol:
TOX2
locus group:
protein-coding gene
location:
20q13.12
gene_family:
alias symbol:
dJ1108D11.2|GCX-1
alias name:
granulosa cell HMG box 1
entrez id:
84969
ensembl gene id:
ENSG00000124191
ucsc gene id:
uc010ggo.4
refseq accession:
NM_001098796
hgnc_id:
HGNC:16095
approved reserved:
2001-07-17
20q13.12
基因染色体位置图

TOX2(胸腺细胞选择相关HMG盒蛋白2)属于TOX基因家族,该家族包含TOX1、TOX3、TOX4等成员,共性是通过编码含有HMG(高迁移率族)盒结构域的转录调控蛋白,参与染色质重塑和基因表达调控。TOX2在免疫系统(如T细胞发育)、神经系统(神经元分化)及生殖系统中发挥关键作用,其表达产物通过结合DNA调控靶基因(如细胞周期或分化相关基因)的转录。主要作用位点包括胸腺、大脑皮层和卵巢。突变可能导致功能异常,例如TOX2失活突变与智力障碍或自闭症谱系障碍相关,而过表达可能促进癌症(如乳腺癌)进展,因它可激活促增殖信号通路。降低表达可能影响神经发育或免疫耐受,导致自身免疫疾病风险增加。TOX家族蛋白均依赖HMG盒与非序列特异性DNA结合,参与细胞命运决定。若TOX2过表达,可能通过干扰其他TOX成员(如TOX3)的功能导致基因调控网络失衡;表达不足则可能影响依赖其转录活性的下游基因(如CD4+ T细胞相关因子)。目前中文术语“胸腺细胞选择相关”是对英文"Thymocyte Selection-Associated"的直译,少数文献也采用“TOX高迁移率族盒蛋白2”以突出结构特征。

None

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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TOX2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs733748       rs733749       rs736992       rs742640       rs742641       rs743152       rs761919       rs764673       rs766622       rs868981       rs910907       rs910908       rs910909       rs916474       rs926599       rs944703       rs976327      

TOX2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACTCCTATCAGGCCATGGA
60
GACCATCTCCTGGATCGTG
60
TGCATTTCAAGATCTCGGGA
60
TGAAGAAGAGTGCGTAGGC
60
GAACAGAAGCAGGACTTCC
58
GTAGAGCGATTTGTCCCTG
58
ACTCCTATCAGGCCATGGA
60
GACCATCTCCTGGATCGTG
60
ACTCCTATCAGGCCATGGA
60
GACCATCTCCTGGATCGTG
60
TCTGTGGAATGAGACTCGG
59
TCACCATCAAACTTCTGCG
59
AGGTGTCTCTGCACTTGAG
59
GGACCATCTCCTGGATCTG
59
CTCCTATCAGGCCATGGAC
59
GACCATCTCCTGGATCGTG
60
AACAGAAGCAGGACTTCCC
60
GGTAGAGCGATTTGTCCCT
59
TTCTGTGGAATGAGACTCGG
60
ACCATCAAACTTCTGCGGA
60
      尚未收录相关数据

TOX2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TOX2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001085
Q96NM4 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
Q96NM4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
Q96NM4 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q96NM4 (UniProtKB)
IEA
GO:0008585
Q96NM4 (UniProtKB)
IEA
GO:0034698
Q96NM4 (UniProtKB)
IEA
GO:0045944
Q96NM4 (UniProtKB)
IEA

可能调控 TOX2基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Conduct Disorder 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Lung Neoplasms 0.000271442 1 0 BeFree

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电话: 0531-88819269

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