TOE1 (target of EGR1, exonuclease)

symbol:
TOE1
locus group:
protein-coding gene
location:
1p34.1
gene_family:
alias symbol:
hCaf1z|TOE-1
alias name:
None
entrez id:
114034
ensembl gene id:
ENSG00000132773
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uc009vxq.4
refseq accession:
NM_025077
hgnc_id:
HGNC:15954
approved reserved:
2001-08-24
1p34.1
基因染色体位置图

TOE1(Target of EGR1,也被称为C3orf17)属于TUTase(末端尿苷酸转移酶)家族,主要参与RNA的加工和降解过程。TOE1基因编码的蛋白是一种具有3'-5'核酸外切酶活性的酶,负责修剪小核RNA(snRNA)的3'端,确保其成熟和功能完整性。snRNA是剪接体(spliceosome)的关键组成部分,参与前体mRNA的剪接,因此TOE1的功能直接影响基因表达的准确性。TOE1的突变会导致snRNA加工异常,进而引发剪接缺陷,与多种神经发育疾病相关,如小头畸形(microcephaly)和脑白质病变(leukodystrophy)。这些突变通常表现为功能丧失(loss-of-function),导致TOE1无法正常修剪snRNA,从而影响神经细胞的发育和功能。TOE1过表达的研究较少,但可能干扰snRNA的稳态平衡,导致剪接紊乱或细胞毒性。降低TOE1表达则会导致snRNA成熟障碍,引发广泛的剪接错误,影响细胞尤其是神经细胞的功能。TOE1属于TUTase家族,该家族成员通常具有核苷酸转移酶或修剪酶活性,参与RNA代谢调控。家族共性包括对RNA末端的修饰能力,影响RNA稳定性、定位和功能。TOE1的发现为理解神经发育疾病的分子机制提供了新视角,并可能成为相关疾病的治疗靶点。专业术语解释:剪接体(spliceosome)是由snRNA和蛋白质组成的复合物,负责移除前体mRNA中的内含子;小核RNA(snRNA)是参与剪接的小分子RNA;核酸外切酶(exonuclease)是一种从核酸链末端切除核苷酸的酶。

None

TOE1基因的碱基序列:[NCBI]
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TOE1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2275602       rs3219463       rs3219464       rs3219465       rs3219466       rs3219467       rs3219468       rs3219469       rs3219470       rs3219471       rs3219472       rs3219473       rs3219474       rs3811432       rs7522089       rs17838009       rs28372898      

TOE1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGACAGCTAATTTCGTGGC
58
CCTCAATGCACTGGTTCAG
59
CTTCCGGAAATGTGAACGG
59
AGGATAGTTGCAGAACTCCA
59
CTCATAACGGTGGTGTCAG
58
TTGTTGCTTTGCACATCCA
59
AGACAGCTAATTTCGTGGC
58
CCTCAATGCACTGGTTCAG
59
CAGTTCCTGATACAGCATGG
59
CTCATCACCCTTGTCATTGC
59
GAGTTTGCTGAACCAGGTG
59
TATGACATACTCCTCCATGCA
59
GACACCAAATATGCTGCTGAG
60
TTTCCCGTTCACATTTCCG
59
AGCTCATAACGGTGGTGTC
60
GCTTTGCACATCCACTACG
60
GTTCCTGATACAGCATGGC
59
CTCATCACCCTTGTCATTGC
59
AAGACAGCTAATTTCGTGGC
59
CTCAATGCACTGGTTCAGC
60
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
EGR1
TOE1
Unknown

TOE1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TOE1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000175
Q96GM8 (UniProtKB)
IDA
GO:0003676
Q96GM8 (UniProtKB)
IEA
GO:0004535
Q96GM8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q96GM8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q96GM8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q96GM8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
Q96GM8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q96GM8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q96GM8 (UniProtKB)
IDA
GO:0015030
Q96GM8 (UniProtKB)
IDA
GO:0016607
Q96GM8 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
Q96GM8 (UniProtKB)
IEA
GO:0090503
Q96GM8 (UniProtKB)
IDA

可能调控 TOE1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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