TOB1 (transducer of ERBB2, 1)

symbol:
TOB1
locus group:
protein-coding gene
location:
17q21.33
gene_family:
alias symbol:
TOB|TROB|APRO5
alias name:
None
entrez id:
10140
ensembl gene id:
ENSG00000141232
ucsc gene id:
uc021uad.2
refseq accession:
NM_001243877
hgnc_id:
HGNC:11979
approved reserved:
2000-06-01
17q21.33
基因染色体位置图

TOB1(Transducer of ERBB2, 1)属于TOB基因家族,该家族包括TOB1和TOB2,其成员均具有抗增殖功能,通过调控细胞周期参与信号转导。TOB1编码的蛋白质是一种转录调节因子,通过与细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)抑制剂相互作用,抑制细胞周期从G1期进入S期,从而抑制细胞增殖。TOB1主要作用位点在细胞核,通过与转录因子(如ERBB2/HER2)或RNA结合蛋白(如聚腺苷酸结合蛋白PABPC1)结合,调节靶基因表达。TOB1的突变可能导致其功能丧失,解除对细胞周期的抑制,促进肿瘤发生。研究发现TOB1在多种癌症(如乳腺癌、胃癌)中表达下调,其低表达与肿瘤进展和不良预后相关。TOB1过表达会增强细胞周期阻滞,抑制肿瘤生长,而表达降低则可能加速细胞增殖。TOB基因家族的共性包括:均含有保守的N端TOB结构域,介导蛋白相互作用;C端富含脯氨酸区域,参与信号转导;均具有抗增殖和肿瘤抑制功能。TOB1还通过调节免疫细胞(如T细胞)的活化参与免疫应答,其表达异常可能导致自身免疫疾病。此外,TOB1与病毒感染(如EB病毒)相关,病毒蛋白可能通过降解TOB1逃逸宿主细胞的生长抑制。专业术语解释:CDK(周期蛋白依赖性激酶)是调控细胞周期关键酶;ERBB2/HER2是一种促癌的受体酪氨酸激酶;G1期和S期是细胞周期中DNA合成前的准备阶段和DNA合成阶段。

This gene encodes a member of the transducer of erbB-2 /B-cell translocation gene protein family. Members of this family are anti-proliferative factors that have the potential to regulate cell growth. The encoded protein may function as a tumor suppressor. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2011]

这个基因编码erbB-2的/ B细胞易位基因蛋白家族的换能器的部件。这个家庭的成员是具有调节细胞生长的潜在抗增殖因子。所编码的蛋白质可作为肿瘤抑制基因发挥作用。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2011年8月提供]

TOB1基因的碱基序列:[NCBI]
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TOB1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1134637       rs9898809       rs12601477       rs12949115       rs12950561       rs34700818       rs35220381       rs56406873       rs61745076       rs74741906       rs76008726       rs78420930       rs113347817       rs114954245       rs146677221       rs149089074       rs149665551      

TOB1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCTGTCCTCTGTCCTCAG
59
AAATGTTGACACGTCTCCT
57
CTCTGTCCTCTGTCCTCAG
59
TTGAGTGATCTTGTTCGGG
58
TGCTACCTGAACAAGATCAC
58
TACTTGGATTTCAAGCTGCA
58
CTCTGTCCTCTGTCCTCAG
59
GAGTGATCTTGTTCGGGCT
60
CTCTGTCCTCTGTCCTCAG
59
AATGTTGACACGTCTCCTG
58
TTGCTACCTGAACAAGATCAC
58
ACTTGGATTTCAAGCTGCA
58
CTCTGTCCTCTGTCCTCAG
59
ATGTTGACACGTCTCCTGG
60
CTCTGTCCTCTGTCCTCAG
59
CTTGAGTGATCTTGTTCGGG
59
TGCTACCTGAACAAGATCAC
58
ACTTGGATTTCAAGCTGCA
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
TOB1
IL2
Repression

TOB1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TOB1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003714
P50616 (UniProtKB)
IEA
GO:0005070
P50616 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
P50616 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P50616 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P50616 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P50616 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P50616 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P50616 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P50616 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P50616 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P50616 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P50616 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P50616 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
P50616 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
P50616 (UniProtKB)
IEA
GO:0007184
P50616 (UniProtKB)
IEA
GO:0008285
P50616 (UniProtKB)
IDA
GO:0008285
P50616 (UniProtKB)
IDA
GO:0009967
P50616 (UniProtKB)
IEA
GO:0017148
P50616 (UniProtKB)
IDA
GO:0030014
P50616 (UniProtKB)
IDA
GO:0030514
P50616 (UniProtKB)
IEA
GO:0030971
P50616 (UniProtKB)
IDA
GO:0045668
P50616 (UniProtKB)
IEA
GO:0046332
P50616 (UniProtKB)
IEA
GO:0060212
P50616 (UniProtKB)
IDA
GO:0060213
P50616 (UniProtKB)
IDA
GO:1900153
P50616 (UniProtKB)
IDA
GO:1903507
P50616 (UniProtKB)
IEA

可能调控 TOB1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Endometriosis 0.12 1 0 CTD_human
Neoplasms, Experimental 0.12 1 0 CTD_human
Chloracne 0.12 1 0 CTD_human
Lung Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Malignant neoplasm of stomach 0.001085767 4 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.001085767 4 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Experimental Autoimmune Encephalomyelitis 0.000542884 2 0 BeFree

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