TNFSF13B (TNF superfamily member 13b)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TNFSF13B
locus group:
protein-coding gene
location:
13q33.3
gene_family:
CD molecules|Tumor necrosis factor (ligand) superfamily
alias symbol:
BAFF|THANK|BLYS|TALL-1|TALL1|CD257
alias name:
B-cell-activating factor|TNF and A…
entrez id:
10673
ensembl gene id:
ENSG00000102524
ucsc gene id:
uc001vqr.4
refseq accession:
NM_006573
hgnc_id:
HGNC:11929
approved reserved:
1999-07-19

基因染色体位置

基因染色体位置

13q33.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TNFSF13B（肿瘤坏死因子超家族成员13B，也称为BAFF或BLyS）是一种重要的细胞因子，属于肿瘤坏死因子（TNF）超家族。该基因编码的蛋白质BAFF（B细胞激活因子）主要参与B细胞的存活、增殖和成熟，对免疫系统的正常功能至关重要。BAFF通过与三种受体结合发挥作用：BAFF-R（BAFF受体）、TACI（跨膜激活剂及钙调亲环素配体相互作用分子）和BCMA（B细胞成熟抗原），这些受体主要表达在B细胞表面。BAFF的生物学功能包括促进B细胞的存活和分化，维持外周B细胞库的稳态，并在体液免疫应答中起关键作用。TNFSF13B的突变或异常表达与多种自身免疫性疾病相关，如系统性红斑狼疮（SLE）、类风湿关节炎（RA）和干燥综合征（Sjögren's syndrome）。突变可能导致BAFF过度产生，引发B细胞异常活化和自身抗体产生，从而加剧自身免疫反应。此外，BAFF过表达还与某些B细胞恶性肿瘤（如非霍奇金淋巴瘤）的发生有关。相反，TNFSF13B表达降低可能导致B细胞减少或功能缺陷，增加感染风险。肿瘤坏死因子超家族（TNF superfamily）的共性是其成员均为Ⅱ型跨膜蛋白，可通过蛋白水解切割成为可溶性细胞因子，并通过与特定受体结合调节免疫反应、细胞存活和炎症过程。该家族成员在免疫调控、炎症和细胞凋亡中发挥核心作用。BAFF的过表达会过度激活B细胞，可能导致自身免疫疾病或淋巴瘤，而降低表达则可能削弱体液免疫，增加感染易感性。针对BAFF的靶向药物（如贝利木单抗）已用于治疗某些自身免疫病，通过抑制BAFF信号通路调节异常免疫反应。

The protein encoded by this gene is a cytokine that belongs to the tumor necrosis factor (TNF) ligand family. This cytokine is a ligand for receptors TNFRSF13B/TACI, TNFRSF17/BCMA, and TNFRSF13C/BAFFR. This cytokine is expressed in B cell lineage cells, and acts as a potent B cell activator. It has been also shown to play an important role in the proliferation and differentiation of B cells. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Mar 2011]

由该基因编码的蛋白是属于肿瘤坏死因子（TNF）配体家族的细胞因子。这种细胞因子是受体TNFRSF13B / TACI，TNFRSF17 / BCMA和TNFRSF13C / BAFFR的配体。这种细胞因子是在B细胞谱系细胞中表达，并作为一个有效的B细胞活化剂。它也已显示出在B细胞的增殖和分化中起重要作用。编码不同亚型选择性剪接转录变异体已经确定。 [由RefSeq的，2011年3月提供]

OMIM数据库中对TNFSF13B基因的介绍     Wikipedia数据库中对TNFSF13B基因的介绍

基因序列

基因序列

TNFSF13B基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TNFSF13B基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1020192       rs1224141       rs1224142       rs1224143       rs1224144       rs1237065       rs1470154       rs2391631       rs2893321       rs3075942       rs4000607       rs4421862       rs5806723       rs7337914       rs7985994       rs7990650       rs7990725      

基因表达

基因表达

TNFSF13B基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTATTCAGCTGGCATTGCA
58
TCCATCCAGTGATATTTGTGC
58
GAGAACACAAGGATTTGTGAG
57
TGCAAACTCACTTTCAGTCC
58
CTATTCAGCTGGCATTGCA
58
CCATCCAGTGATATTTGTGCA
58
GAGAACACAAGGATTTGTGAG
57
CAAACTCACTTTCAGTCCCG
59
CTCCAGGAGAAGGCAACTC
59
CAAGCAGTCTTGAGTGACTG
58
GAGAACACAAGGATTTGTGAG
57
AAACTCACTTTCAGTCCCG
57

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
NFKB1
TNFSF13B
Unknown
16497967
STAT1
TNFSF13B
Unknown
23271704

基因本体信息

TNFSF13B基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TNFSF13B基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005102
Q9Y275 (UniProtKB)
TAS
GO:0005125
Q9Y275 (UniProtKB)
IEA
GO:0005164
Q9Y275 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9Y275 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y275 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9Y275 (UniProtKB)
IPI
GO:0005576
Q9Y275 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q9Y275 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q9Y275 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q9Y275 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q9Y275 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q9Y275 (UniProtKB)
TAS
GO:0005615
Q9Y275 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q9Y275 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q9Y275 (UniProtKB)
IEA
GO:0006955
Q9Y275 (UniProtKB)
IEA
GO:0007165
Q9Y275 (UniProtKB)
TAS
GO:0008283
Q9Y275 (UniProtKB)
TAS
GO:0008284
Q9Y275 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
Q9Y275 (UniProtKB)
NAS
GO:0030890
Q9Y275 (UniProtKB)
IMP
GO:0033209
Q9Y275 (UniProtKB)
TAS
GO:0033209
Q9Y275 (UniProtKB)
TAS
GO:0048471
Q9Y275 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TNFSF13B基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Sjogren's Syndrome 0.101708926 9 0 BeFree_GAD_LHGDN_MGD
IgA NEPHROPATHY, SUSCEPTIBILITY TO, 1 0.08 0 0 MGD
Autoimmune Diseases 0.026118009 40 0 BeFree_LHGDN
Lupus Erythematosus, Systemic 0.025217807 39 0 BeFree_GAD_LHGDN
Multiple Myeloma 0.013797385 14 0 BeFree_GAD_LHGDN
Rheumatoid Arthritis 0.012158802 18 0 BeFree_GAD_LHGDN
Lymphoma 0.010887469 10 0 BeFree_LHGDN
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.008348685 13 0 BeFree_GAD_LHGDN
B-Cell Lymphomas 0.006720033 7 0 BeFree_GAD_LHGDN
Inflammation 0.0054487 2 0 LHGDN

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基因相关服务

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