TMX2-CTNND1 (TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate))

symbol:
TMX2-CTNND1
locus group:
other
location:
11q12.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
100528016
ensembl gene id:
ENSG00000254462
ucsc gene id:
uc058boc.1
refseq accession:
NR_037646.1
hgnc_id:
HGNC:41992
approved reserved:
2011-05-31
11q12.1
基因染色体位置图

TMX2-CTNND1是一个融合基因,由TMX2(硫氧还蛋白相关跨膜蛋白2)和CTNND1(连环蛋白δ1,也称为p120-连环蛋白)基因的部分序列融合而成。TMX2属于硫氧还蛋白家族,这类蛋白通常参与氧化还原反应,帮助维持细胞内环境的稳定。CTNND1是连环蛋白家族的一员,主要参与细胞间粘附和信号传导,对维持上皮细胞的完整性和功能至关重要。TMX2-CTNND1融合基因的产生通常是由于染色体易位或重排,导致两个基因的部分序列结合在一起。这种融合可能会改变原有基因的功能,例如影响细胞的粘附、迁移和增殖。CTNND1的突变或异常表达与多种癌症有关,包括乳腺癌、肺癌和结肠癌,因为它参与调控E-钙粘蛋白的稳定性,而E-钙粘蛋白是上皮细胞间粘附的关键分子。如果TMX2-CTNND1融合基因过表达,可能会干扰正常的细胞粘附和信号传导,促进肿瘤细胞的侵袭和转移。相反,如果其表达降低,可能会影响细胞的粘附能力,导致组织完整性受损。TMX2-CTNND1融合基因的具体功能还需进一步研究,但其存在可能为某些疾病的诊断和治疗提供新的靶点。硫氧还蛋白家族的共性包括参与氧化还原反应和维持细胞内氧化还原平衡,而连环蛋白家族的共性则是参与细胞粘附和信号传导,对组织结构和功能至关重要。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring TMX2 (thioredoxin-related transmembrane protein 2) and CTNND1 (catenin, cadherin-associated protein, delta 1) genes on chromosome 11. The read-through transcript is a candidate for nonsense-mediated mRNA decay (NMD), and is therefore unlikely to produce a protein product. [provided by RefSeq, Dec 2010]

此轨迹表示天然存在的相邻TMX2(硫氧还蛋白相关跨膜蛋白2)和CTNND1(连环,钙粘蛋白相关蛋白,增量1)基因之间通读转录11号染色体的通读转录物是一候选为无义介导的mRNA降解(NMD),并且因此不太可能产生的蛋白质产物。 [由RefSeq的,2010年12月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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TMX2-CTNND1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs486995       rs511708       rs546885       rs563345       rs648412       rs2926657       rs3017889       rs11229113       rs11229114       rs11229115       rs12292393       rs12420996       rs12787776       rs12789206       rs12789424       rs35274578       rs35886239      

TMX2-CTNND1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTGTGACTTTGACTGGAGAG
58
TCATGGAAGAAGCATCCCA
59
GTGTGACTTTGACTGGAGAG
58
CATGGAAGAAGCATCCCAG
58
GTGTGACTTTGACTGGAGAG
58
GAGGAAGCAGGAAGGAGAG
59
      尚未收录相关数据

TMX2-CTNND1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TMX2-CTNND1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
H3BSU7 (UniProtKB)
IEA

可能调控 TMX2-CTNND1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Schizophrenia 0.12 1 1 GWASCAT

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