TMEM256-PLSCR3 (TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate))

symbol:
TMEM256-PLSCR3
locus group:
other
location:
17p13.1
gene_family:
alias symbol:
None
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None
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100529211
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None
refseq accession:
NR_037719
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HGNC:49186
approved reserved:
2013-09-25
17p13.1
基因染色体位置图

TMEM256-PLSCR3是一个嵌合基因,由跨膜蛋白256(TMEM256)和磷脂爬行酶3(PLSCR3)基因融合形成。PLSCR3属于磷脂爬行酶(Phospholipid Scramblase)家族,该家族成员的主要功能是介导磷脂在细胞膜双层之间的双向转运,参与细胞膜不对称性的维持和凋亡过程中磷脂酰丝氨酸的外翻。PLSCR3定位于线粒体,在维持线粒体膜稳定性、能量代谢和细胞凋亡调控中发挥重要作用。该基因的突变或表达异常可能导致线粒体功能障碍,影响细胞能量代谢平衡,并与某些癌症(如白血病、乳腺癌)和神经退行性疾病的发生发展相关。PLSCR3过表达会增强线粒体膜磷脂的重分布,可能导致过早的细胞凋亡或自噬激活,而表达降低则可能削弱线粒体对氧化应激的响应能力,加剧细胞损伤。PLSCR家族(包括PLSCR1-4)的共同特点是含有保守的磷脂爬行酶结构域,能响应钙离子信号催化磷脂转运,参与免疫应答、凝血和病毒防御等过程。TMEM256-PLSCR3融合基因可能保留了PLSCR3的部分功能,但其具体生物学效应仍需进一步研究。目前对该嵌合基因的认识尚有限,但PLSCR3作为其组成部分的重要性提示该融合基因可能在肿瘤发生或代谢疾病中具有潜在作用。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring chromosome 17 open reading frame 61 (C17orf61) and phospholipid scramblase 3 (PLSCR3) genes. The read-through transcript is a candidate for nonsense-mediated mRNA decay (NMD), and is unlikely to produce a protein product. [provided by RefSeq, Jan 2011]

这一位点代表自然发生的周边17号染色??体开放阅读框61(C17orf61)和磷脂scramblase 3(PLSCR3)基因之间通读转录。在通读成绩单是无义介导的mRNA降解(NMD)的候选人,是不可能产生的蛋白产物。 [由RefSeq的,2011年1月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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TMEM256-PLSCR3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1113978       rs2075759       rs2075760       rs2277640       rs2277641       rs2277642       rs3744549       rs3785934       rs4613118       rs7214490       rs7216864       rs7219308       rs8073583       rs8075287       rs8078734       rs12947833       rs17856370      

TMEM256-PLSCR3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGTTCTCCATCCAGGATGC
60
AGTCTTCACCTCAAAGTTGGT
60
CTTCTGGCCTCGAATTCCT
60
CAGCCTAGGAACGTTTCCA
60
CCTGGTGCAGATTGATCAG
58
ATCCTGGATGGAGAACTTGG
59
CAACTTTGAGGTGAAGACTCG
59
TCATCTGCATCTGTGAGGG
59
TCCAGGAGTTCTCCATCCA
60
CTCAAAGTTGGTGTCTGTGC
60
CCTGGTGCAGATTGATCAG
58
CAGTTCATACCGATTACAGGT
58
CTCCAGGAGATGGAAGTACAG
59
TCCTGGATGGAGAACTTGG
59
ACACCAACTTTGAGTTCCC
58
TGTAGTCAATGAGGAATGTGG
58
CTTCTGGCCTCGAATTCCT
60
ACCGATTACAGGTCTCCAG
59
TCCTGGTGCAGATTGATCAG
60
CCGATTACAGGTCTCCCAG
59
      尚未收录相关数据

TMEM256-PLSCR3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TMEM256-PLSCR3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016020
I3L3X5 (UniProtKB)
IBA
GO:0017121
I3L3X5 (UniProtKB)
IEA
GO:0017128
I3L3X5 (UniProtKB)
IBA

可能调控 TMEM256-PLSCR3基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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电话: 0531-88819269

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