TMED7-TICAM2 (TMED7-TICAM2 readthrough)

symbol:
TMED7-TICAM2
locus group:
other
location:
5q22.3
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
100302736
ensembl gene id:
ENSG00000251201
ucsc gene id:
uc003kre.4
refseq accession:
NM_001164468
hgnc_id:
HGNC:33945
approved reserved:
2009-11-05
5q22.3
基因染色体位置图

TMED7-TICAM2是一个融合基因,由TMED7(跨膜p24运输蛋白家族成员7)和TICAM2(TIR结构域适配分子2)基因的部分序列组成。TMED7属于p24蛋白家族,该家族成员主要参与内质网到高尔基体的蛋白质运输,调控分泌途径和细胞膜蛋白的定位。TICAM2则属于Toll样受体(TLR)信号通路中的适配蛋白家族,通过其TIR结构域传递免疫信号,激活NF-κB和干扰素调节因子(IRF),从而介导炎症和抗病毒免疫反应。TMED7-TICAM2融合可能导致TICAM2的异常表达或功能改变,影响TLR信号通路的正常调控。研究表明,TICAM2的突变或异常表达可能与自身免疫性疾病、慢性炎症及某些癌症相关。若TMED7-TICAM2过表达,可能过度激活免疫反应,导致炎症因子过量释放,引发组织损伤或自身免疫疾病;若表达降低,则可能削弱先天免疫应答,增加感染风险。此外,该融合基因可能干扰TMED7参与的蛋白质运输,影响其他膜蛋白的定位和功能。TMED7属于p24基因家族,其成员均为跨膜蛋白,参与细胞内囊泡运输和蛋白质分选;TICAM2属于TIR适配蛋白家族,其成员通过TIR结构域介导TLR和IL-1受体家族的信号转导。目前关于TMED7-TICAM2的具体功能仍需进一步研究,但其潜在的免疫调节和运输功能异常可能对疾病发生发展具有重要影响。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring transmembrane emp24 protein transport domain containing 7 (TMED7) and toll-like receptor adaptor molecule 2 (TICAM2) genes. Alternative splicing results in multiple transcript variants, one of which encodes a fusion protein that shares sequence identity with the products of each individual gene. This fusion product functions to negatively regulate the adaptor MyD88-independent toll-like receptor 4 pathway. [provided by RefSeq, Nov 2010]

此轨迹表示天然存在的相邻跨膜emp24蛋白转运结构域含有7(TMED7)和toll样受体衔接分子2(TICAM2)基因之间通读转录。选择性剪接的结果在多个转录变异体,其中一个编码共享与每个基因的产物的序列同一性的融合蛋白。此融合产物的功能到适配器的MyD??88非依赖性toll样受体4通路负调控。 [由RefSeq的,2010年11月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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TMED7-TICAM2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs171773       rs256962       rs256963       rs256964       rs256965       rs256966       rs256967       rs381461       rs400570       rs413059       rs416234       rs424434       rs428191       rs439605       rs698365       rs698366       rs712550      

TMED7-TICAM2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAGTCTGTCATCGATTATCAGAC
59
TCCACACTGTGCCAATAGG
60
AGTGCTCTTACCCAGATGG
59
CGGAAATGAGTCTGATAATCGA
58
GGATCTAAATACAAGAGTGGCC
59
TATCCAAGGCAGAAGAGGA
57
GTGCTCTTACCCAGATGGA
59
ACGGAAATGAGTCTGATAATCG
59
GTCATCGATTATCAGACTCATTTCC
60
TCCACACTGTGCCAATAGG
60
GATCTAAATACAAGAGTGGCCT
58
ATATCCAAGGCAGAAGAGGA
58
CATCGATTATCAGACTCATTTCCG
60
TCCACACTGTGCCAATAGG
60
GTGCTCTTACCCAGATGGA
59
CGGAAATGAGTCTGATAATCGA
58
GATCTAAATACAAGAGTGGCCT
58
TATCCAAGGCAGAAGAGGA
57
      尚未收录相关数据

TMED7-TICAM2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TMED7-TICAM2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006810
A0A0A6YYA0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A0A6YYA0 (UniProtKB)
IEA

可能调控 TMED7-TICAM2基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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