TM4SF1 (transmembrane 4 L six family member 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TM4SF1
locus group:
protein-coding gene
location:
3q25.1
gene_family:
alias symbol:
L6
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None
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4071
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ENSG00000169908
ucsc gene id:
uc003exb.2
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NM_014220
hgnc_id:
HGNC:11853
approved reserved:
1993-12-08

基因染色体位置

基因染色体位置

3q25.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TM4SF1（跨膜4超家族成员1，Transmembrane 4 L six family member 1）属于TM4SF基因家族，该家族成员均为四次跨膜蛋白（tetraspanin），具有四个跨膜结构域，参与细胞膜上的信号传导、细胞黏附、迁移及增殖等过程。TM4SF1编码的蛋白在细胞膜上形成复合物，与其他膜蛋白（如整合素、生长因子受体）相互作用，调节细胞运动、侵袭及肿瘤微环境。其主要作用位点为细胞膜，尤其在血管内皮细胞、肿瘤细胞及免疫细胞中高表达。TM4SF1的突变可能导致其功能异常，例如丧失对细胞迁移的调控能力，与多种癌症（如肝癌、乳腺癌、胶质瘤）的转移和不良预后相关。若TM4SF1过表达，会增强肿瘤细胞的侵袭性，促进血管生成（angiogenesis），并可能激活下游信号通路（如PI3K/AKT），导致化疗耐药；而降低表达则可能抑制肿瘤进展，但可能影响正常组织的血管修复功能。TM4SF基因家族的共性包括：通过形成“四跨膜蛋白网络”（tetraspanin web）调控细胞间相互作用，参与免疫应答、病毒感染及癌症发展。目前TM4SF1的中文译名较统一，无显著争议。

The protein encoded by this gene is a member of the transmembrane 4 superfamily, also known as the tetraspanin family. Most of these members are cell-surface proteins that are characterized by the presence of four hydrophobic domains. The proteins mediate signal transduction events that play a role in the regulation of cell development, activation, growth and motility. This encoded protein is a cell surface antigen and is highly expressed in different carcinomas. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白是跨膜4超家族的成员，也称为四旋家族。大多数这些成员是细胞表面蛋白质的特征在于四个疏水区的存在。蛋白质介导其在细胞发育，活化，生长和运动的调节作用的信号转导事件。这个编码的蛋白是细胞表面抗原，并在不同的癌中高表达。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对TM4SF1基因的介绍     Wikipedia数据库中对TM4SF1基因的介绍

基因序列

基因序列

TM4SF1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TM4SF1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3888874       rs4681502       rs4681503       rs4681504       rs6774052       rs6776898       rs10804736       rs10804737       rs11555556       rs11915607       rs34567733       rs62277704       rs73152606       rs75316751       rs77962836       rs78403820       rs80210997      

基因表达

基因表达

TM4SF1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTCATTGGGCTGGAACAG
59
GGTATCCAGAAGGTACCGC
60
GCAGAAGGACCACTATGTC
57
GTATCCAGAAGGTACTGGC
57
GCAGAAGGACCACTATGTC
58
GTATCCAGAAGGTACTGGC
57
TTTGTCTTCATTGGGCTGG
58
AAGAAAGCATCGCACATCG
59
CTATCCTCTTGGCTCTTGGT
59
AGTCATTTGCTGTTGGTGAG
59
GCAGAAGGACCACTATGTC
58
GTATCCAGAAGGTACTGGC
57
GCAGAAGGACCACTATGTC
58
TATCCAGAAGGTACTGGCC
58
CTTCATTGGGCTGGAACAG
59
GTATCCAGAAGGTACCGCA
59
TATCCTCTTGGCTCTTGGTG
59
AGTCATTTGCTGTTGGTGAG
59
CTTCATTGGGCTGGAACAG
59
ACAGAAGAAAGCATCGCAC
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
HNF1A
TM4SF1
Repression
18697801

基因本体信息

TM4SF1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TM4SF1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
C9J611 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8WBG6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8WF27 (UniProtKB)
IEA
GO:0003674
P30408 (UniProtKB)
ND
GO:0005887
P30408 (UniProtKB)
IDA
GO:0008150
P30408 (UniProtKB)
ND
GO:0016021
Q8NE91 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TM4SF1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Pancreatic carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of pancreas 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Benign Prostatic Hyperplasia 0.000271442 1 0 BeFree
Multiple tumors 0.000271442 1 0 BeFree
Tumor Angiogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Oral Submucous Fibrosis 0.000271442 1 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Mammary Neoplasms 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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