TLX3 (T cell leukemia homeobox 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TLX3
locus group:
protein-coding gene
location:
5q35.1
gene_family:
NKL subclass homeoboxes and pseudogenes
alias symbol:
RNX
alias name:
None
entrez id:
30012
ensembl gene id:
ENSG00000164438
ucsc gene id:
uc003mbf.3
refseq accession:
NM_021025
hgnc_id:
HGNC:13532
approved reserved:
2001-12-17

基因染色体位置

基因染色体位置

5q35.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TLX3（T-cell leukemia homeobox 3，T细胞白血病同源框3）是一种属于NKX（NK homeobox）基因家族的转录因子，该家族以含有高度保守的同源框（homeobox）结构域为特征，这类结构域能够结合DNA并调控下游基因的表达。TLX3主要在神经系统发育中发挥作用，尤其在脊髓背角的感觉神经元分化中起关键作用，它通过激活或抑制特定靶基因的表达来调控神经元的命运决定和功能成熟。TLX3的异常表达与多种疾病相关，例如在T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）中，TLX3因染色体易位（如t(5;14)(q35;q32)）而过表达，导致造血细胞分化阻滞和恶性增殖。TLX3突变可能破坏其DNA结合能力或转录调控功能，进而影响神经元发育或促进肿瘤发生。若TLX3过表达，可能抑制正常细胞分化并激活促癌信号通路（如NOTCH1）；而表达降低则可能导致神经发育缺陷，如感觉神经元功能异常。NKX基因家族的共性包括参与胚胎发育、细胞命运决定及组织特异性基因调控，其成员（如NKX2.1、NKX2.5）常在器官形成（如甲状腺、心脏）中发挥核心作用。TLX3的研究为理解神经发育和白血病机制提供了重要线索，但其在非神经系统中的作用仍需进一步探索。

RNX (HOX11L2, TLX3) belongs to a family of orphan homeobox genes that encode DNA-binding nuclear transcription factors. Members of the HOX11 gene family are characterized by a threonine-47 replacing cytosine in the highly conserved homeodomain (Dear et al., 1993 [PubMed 8099440]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

RNX（HOX11L2，TLX3）属于一个家庭的编码DNA结合的核转录因子孤儿同源基因。所述HOX11基因家族的成员在高度保守的同源域特征在于苏氨酸47取代胞嘧啶（亲爱等人，1993 [搜索PubMed 8099440]）。[由OMIM，2008年3月提供的]

OMIM数据库中对TLX3基因的介绍     Wikipedia数据库中对TLX3基因的介绍

基因序列

基因序列

TLX3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TLX3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs918472       rs966056       rs971007       rs1366433       rs2303742       rs2914335       rs2914336       rs2964536       rs3806930       rs3822663       rs3840521       rs34255055       rs36095128       rs57517331       rs60850132       rs71605798       rs73803317      

基因表达

基因表达

TLX3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGAAGTACCTGGCCTCTG
60
CTGGATGGAGTCGTTGAGG
60
GTGAAAGACCGCTTCACAG
59
CAGAGGCCAGGTACTTCTG
60
GTGAAAGACCGCTTCACAG
59
TACTTCTGGCGATGGAAGC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TLX3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TLX3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001764
O43711 (UniProtKB)
IEA
GO:0002087
O43711 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
O43711 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
O43711 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
O43711 (UniProtKB)
IEA
GO:0007417
O43711 (UniProtKB)
IEA
GO:0007585
O43711 (UniProtKB)
IEA
GO:0043565
O43711 (UniProtKB)
IEA
GO:0045665
O43711 (UniProtKB)
IEA
GO:0048665
O43711 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TLX3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Congenital central hypoventilation 0.080542884 2 0 BeFree_MGD
Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia Lymphoma 0.011983168 8 0 BeFree_LHGDN
Precursor T-Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma 0.010334654 19 0 BeFree_LHGDN
leukemia 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Acute lymphocytic leukemia 0.001357209 5 0 BeFree
T-cell childhood acute lymphoblastic leukemia 0.000542884 2 0 BeFree
Neoplasm, Residual 0.000542884 2 0 BeFree
Lymphoid leukemia 0.000542884 2 0 BeFree
Leukemia, Lymphocytic, Acute, L1 0.000542884 2 0 BeFree
Leukemia, T-Cell 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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