TLX1 (T cell leukemia homeobox 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TLX1
locus group:
protein-coding gene
location:
10q24.31
gene_family:
NKL subclass homeoboxes and pseudogenes
alias symbol:
None
alias name:
Homeo box-11 (T-cell leukemia-3 as…
entrez id:
3195
ensembl gene id:
ENSG00000107807
ucsc gene id:
uc001ksw.4
refseq accession:
NM_005521
hgnc_id:
HGNC:5056
approved reserved:
1991-03-18

基因染色体位置

基因染色体位置

10q24.31
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TLX1（也称为HOX11）是一种同源盒基因，属于HOX基因家族的一部分，该家族在胚胎发育中起关键作用，特别是在身体前后轴的模式形成中。TLX1主要在胚胎发育期间表达，特别是在脾脏和中枢神经系统的发育过程中发挥重要作用。它编码的蛋白质是一种转录因子，能够结合DNA并调控其他基因的表达，从而影响细胞分化、增殖和凋亡。TLX1的主要作用位点包括脾脏原基和脊髓的特定区域，其正常功能对脾脏的发育至关重要。TLX1的突变或异常表达可能导致其功能丧失或获得异常功能，进而影响发育过程。例如，TLX1的异常激活与T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）的发生密切相关，这通常是由于染色体易位导致TLX1的过度表达，进而促进细胞不受控制的增殖。此外，TLX1的过表达还可能干扰正常造血干细胞的发育，导致血液系统疾病。相反，TLX1表达降低可能影响脾脏的正常发育，导致脾脏缺失或功能异常。TLX1属于HOX基因家族，该家族的基因通常含有同源盒结构域，编码的蛋白质能够调控胚胎发育过程中的细胞命运和组织模式。HOX基因家族的成员通常以高度保守的方式排列在染色体上，并在发育过程中表现出时间和空间上的共线性表达模式。TLX1作为该家族的非典型成员，虽然不位于主要的HOX基因簇中，但仍保留了许多HOX基因的特征，如通过调控下游靶基因影响发育过程。总之，TLX1在胚胎发育和疾病发生中扮演重要角色，其异常表达与多种病理状态相关，尤其是血液系统恶性肿瘤。

This gene encodes a nuclear transcription factor that belongs to the NK-linked or NK-like (NKL) subfamily of homeobox genes. The encoded protein is required for normal development of the spleen during embryogenesis. This protein is also involved in specification of neuronal cell fates. Ectopic expression of this gene due to chromosomal translocations is associated with certain T-cell acute lymphoblastic leukemias. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2010]

这个基因编码属于同源基因的NK联或NK样（NKL）亚科核转录因子。该编码的蛋白是必需的胚胎发育过程中脾脏的正常发展。这种蛋白也参与神经元细胞命运的规范。该基因由于染色体易位异位表达与特定的T细胞急性淋巴母细胞白血病相关。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2010年9月提供]

OMIM数据库中对TLX1基因的介绍     Wikipedia数据库中对TLX1基因的介绍

基因序列

基因序列

TLX1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TLX1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs946328       rs1051723       rs1051725       rs1111350       rs1416361       rs2075879       rs2235128       rs2472720       rs2516328       rs2516329       rs2742010       rs2742017       rs2742018       rs2742022       rs2742023       rs2742024       rs2742025      

基因表达

基因表达

TLX1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATACACAAAGGACAGGTTCAC
58
ACCTATACGGCGTGTTACAG
60
AAGGACAGGTTCACAGGTC
59
GTTACCTCCACTTTGTCCG
58
ACAAAGGACAGGTTCACAG
58
GTTACCTCCACTTTGTCCG
58
TCGACCAGATCCTCAACAG
59
CGTATTCTCCGTCCTGGAG
59
TTCCCTGGATCCTAGACCA
59
GACCTGGGCTCAATTTGTG
59
ACAACATTTCTGACGCTGG
59
TTTAGCGTTCCAAGGTCTG
58
CCACAACATTTCTGACGCT
59
TAGCGTTCCAAGGTCTGAG
59
TCCCTGGATCCTAGACCAC
60
GACCTGGGCTCAATTTGTG
59
ATCGACCAGATCCTCAACAG
59
GTATTCTCCGTCCTGGAGG
59
GGACAAAGTGGAGGTAACG
58
TTTGGTCGAGTCGTCAGAC
60

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
MYC
TLX1
Unknown
20618946
TLX1
ALDH1A1
Unknown
18073142; 18082256
TLX1
FHL1
Unknown
18073142
TLX1
MYC
Activation
20618946
TLX1
NR4A3
Activation
15384172

基因本体信息

TLX1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TLX1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000978
P31314 (UniProtKB)
IEA
GO:0001077
P31314 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P31314 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P31314 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P31314 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P31314 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
P31314 (UniProtKB)
IEA
GO:0006366
P31314 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
P31314 (UniProtKB)
IEA
GO:0045944
P31314 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TLX1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Precursor T-Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma 0.129229024 35 0 BeFree_CTD_human
Adult T-Cell Lymphoma/Leukemia 0.120542884 3 0 BeFree_CTD_human
Aneuploidy 0.12 1 0 CTD_human
Splenic Diseases 0.12 1 0 CTD_human
Neoplastic Cell Transformation 0.12 1 0 CTD_human
Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia Lymphoma 0.008987376 6 0 BeFree_LHGDN
leukemia 0.005981653 13 0 BeFree_LHGDN
Leukemogenesis 0.003257302 12 0 BeFree
Leukemia, T-Cell 0.002442977 9 0 BeFree
Acute lymphocytic leukemia 0.002171535 8 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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