TIMP3 (TIMP metallopeptidase inhibitor 3)

symbol:
TIMP3
locus group:
protein-coding gene
location:
22q12.3
gene_family:
Tissue inhibitor of metallopeptidases
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
7078
ensembl gene id:
ENSG00000100234
ucsc gene id:
uc003anb.4
refseq accession:
NM_000362
hgnc_id:
HGNC:11822
approved reserved:
1993-04-12
22q12.3
基因染色体位置图

TIMP3(组织金属蛋白酶抑制剂3,Tissue Inhibitor of Metalloproteinases 3)属于TIMP基因家族,该家族包括TIMP1、TIMP2、TIMP3和TIMP4四个成员,主要功能是抑制基质金属蛋白酶(MMPs)的活性,从而调控细胞外基质(ECM)的降解与重塑。TIMP3与其他家族成员类似,通过结合并抑制MMPs(如MMP2、MMP9等)来维持组织结构的稳定性,但其独特之处在于它能紧密结合在细胞外基质中,而其他TIMPs多为可溶性分泌蛋白。TIMP3的生物学功能包括抑制血管生成(angiogenesis)、调控炎症反应和细胞凋亡,并在肿瘤抑制中发挥重要作用。其表达产物是一种糖蛋白,通过阻断MMPs的活性来防止过度ECM降解,从而抑制肿瘤侵袭和转移。TIMP3的作用位点主要在细胞外基质和细胞表面,通过与MMPs或相关受体(如EGFR)相互作用影响下游信号通路。TIMP3突变或表达异常与多种疾病相关,例如功能丧失性突变可能导致遗传性视网膜疾病(如Sorsby假炎症性眼底营养不良),而表观遗传沉默(如启动子甲基化)常见于多种癌症(如乳腺癌、结肠癌),与肿瘤进展和不良预后相关。若TIMP3过表达,可能过度抑制MMPs,导致ECM沉积异常,引发纤维化疾病(如肺纤维化)或阻碍组织修复;而低表达则可能因MMPs活性失控,促进肿瘤转移、血管过度增生或炎症性疾病(如关节炎)。在基因家族中,TIMPs均含12个保守半胱氨酸残基,形成二硫键维持结构稳定性,但TIMP3因其ECM锚定特性及更广泛的底物特异性(如还能抑制ADAMs和ADAMTS家族蛋白酶)而功能更为多样。研究还发现TIMP3通过非MMP依赖途径(如调节生长因子可用性)影响细胞行为,例如抑制VEGF信号从而抗血管生成。

This gene belongs to the TIMP gene family. The proteins encoded by this gene family are inhibitors of the matrix metalloproteinases, a group of peptidases involved in degradation of the extracellular matrix (ECM). Expression of this gene is induced in response to mitogenic stimulation and this netrin domain-containing protein is localized to the ECM. Mutations in this gene have been associated with the autosomal dominant disorder Sorsby's fundus dystrophy. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因属于TIMP基因家族。由该基因家族编码的蛋白质是基质金属蛋白酶,一组涉及在细胞外基质(ECM)的降解肽酶的抑制剂。这个基因的表达响应于促有丝分裂的刺激被诱导,这导蛋白结构域的蛋白质被定位到ECM。在这种基因突变与常染色体显性遗传疾病索斯比的眼底营养不良相关联。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

TIMP3基因的碱基序列:[NCBI]
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TIMP3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4504       rs9862       rs11287       rs12234       rs16447       rs25027       rs80272       rs107614       rs107615       rs130269       rs130270       rs130271       rs130272       rs130274       rs130275       rs130276       rs130278      

TIMP3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATCAAGCAGATGAAGATGTACC
60
GAGACTCTCGGAAGCTTCC
60
AAGCAGATGAAGATGTACCGA
59
CACAGAGACTCTCGGAAGC
60
AGCAGATGAAGATGTACCGAG
60
CACAGAGACTCTCGGAAGC
60
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
DNMT1
TIMP3
Repression
ELF3
TIMP3
Activation
SP1
TIMP3
Activation
SP1
TIMP3
Unknown

TIMP3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TIMP3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0002020
P35625 (UniProtKB)
IBA
GO:0002576
P35625 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
P35625 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P35625 (UniProtKB)
IPI
GO:0005576
P35625 (UniProtKB)
TAS
GO:0005578
P35625 (UniProtKB)
IBA
GO:0005604
P35625 (UniProtKB)
IEA
GO:0005615
P35625 (UniProtKB)
IBA
GO:0005634
P35625 (UniProtKB)
IDA
GO:0007417
P35625 (UniProtKB)
IEA
GO:0007568
P35625 (UniProtKB)
IEA
GO:0007601
P35625 (UniProtKB)
IEA
GO:0008191
P35625 (UniProtKB)
TAS
GO:0009612
P35625 (UniProtKB)
IEA
GO:0010033
P35625 (UniProtKB)
IBA
GO:0031089
P35625 (UniProtKB)
TAS
GO:0042246
P35625 (UniProtKB)
IEA
GO:0043627
P35625 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
P35625 (UniProtKB)
IEA
GO:0051045
P35625 (UniProtKB)
IMP
GO:0051593
P35625 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
P35625 (UniProtKB)
IDA
GO:0070373
P35625 (UniProtKB)
IMP
GO:0071310
P35625 (UniProtKB)
IEA
GO:1903984
P35625 (UniProtKB)
IMP
GO:1904684
P35625 (UniProtKB)
ISS
GO:0031012
P35625 (UniProtKB)
IDA

可能调控 TIMP3基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
FUNDUS DYSTROPHY, PSEUDOINFLAMMATORY, OF SORSBY 0.32 5 0 CTD_human_MGD_UNIPROT
Sorsby's fundus dystrophy 0.124614512 17 1 BeFree_ORPHANET
Asthma 0.120542884 2 0 BeFree_CTD_human
Colitis 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Liver diseases 0.12 1 0 CTD_human
Neoplasm Invasiveness 0.12 1 0 CTD_human
Urinary Bladder Diseases 0.12 1 0 CTD_human
Neurotoxicity Syndromes 0.12 1 0 CTD_human
Spontaneous abortion 0.12 1 0 CTD_human
Stomach Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human

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