TIMD4 (T cell immunoglobulin and mucin domain containing 4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TIMD4
locus group:
protein-coding gene
location:
5q33.3
gene_family:
V-set domain containing
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TIM4
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None
entrez id:
91937
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ENSG00000145850
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uc003lwh.2
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NM_138379
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HGNC:25132
approved reserved:
2004-07-22

基因染色体位置

基因染色体位置

5q33.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TIMD4（T细胞免疫球蛋白和黏蛋白结构域4）属于T细胞免疫球蛋白和黏蛋白结构域（TIM）基因家族，该家族成员在免疫调节中发挥重要作用，特别是参与T细胞功能调控和自身免疫反应。TIM家族基因的共同特点是编码的蛋白质含有免疫球蛋白可变区（IgV）和黏蛋白样结构域，这些结构域使它们能够与特定配体结合，参与细胞间信号传导。TIMD4主要在免疫细胞如巨噬细胞和树突状细胞中表达，其编码的蛋白作为磷脂酰丝氨酸（PS）受体，参与凋亡细胞的清除（即胞葬作用），这对维持组织稳态和防止自身免疫反应至关重要。TIMD4通过识别凋亡细胞表面的PS，促进巨噬细胞对凋亡细胞的吞噬，从而避免凋亡细胞释放内容物引发炎症。突变或功能异常可能导致TIMD4介导的胞葬作用受损，与自身免疫疾病如系统性红斑狼疮（SLE）和类风湿性关节炎（RA）的发生相关。TIMD4过表达可能增强免疫耐受，减少炎症反应，但过度抑制免疫反应可能增加感染风险；而降低表达可能导致凋亡细胞清除障碍，引发慢性炎症或自身免疫疾病。此外，TIMD4还通过调节T细胞活性影响免疫平衡，其表达水平变化可能间接影响其他免疫相关基因（如TIM1、TIM3）的功能。研究显示TIMD4在肿瘤微环境中可能具有双重作用，既可能通过促进免疫耐受帮助肿瘤逃逸，也可能通过调控巨噬细胞极化影响抗肿瘤免疫。

None

无

OMIM数据库中对TIMD4基因的介绍     Wikipedia数据库中对TIMD4基因的介绍

基因序列

基因序列

TIMD4基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TIMD4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1345616       rs1345617       rs1345618       rs1363232       rs1393207       rs1501908       rs1975026       rs2134231       rs2862057       rs2862058       rs2862059       rs3068098       rs3068099       rs3068101       rs3068125       rs3219322       rs4407617      

基因表达

基因表达

TIMD4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACTACTGATGATCATCGCCC
59
ATGAGTTTCCCTCTCAGGAG
58
AACTACTGATGATCATCGCC
57
TGAGTTTCCCTCTCAGGAG
58
CTACTGATGATCATCGCCC
57
CATGAGTTTCCCTCTCAGG
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TIMD4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TIMD4基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
B5MCV9 (UniProtKB)
IEA
GO:0001786
Q96H15 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q96H15 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TIMD4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Ovarian Cysts 0.12 1 0 CTD_human
Asthma 0.00827274 4 0 BeFree_GAD_LHGDN
Dyslipidemias 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Malaria, Cerebral 0.002367032 1 0 GAD
Dermatitis and eczema 0.002367032 1 0 GAD
Rheumatoid Arthritis 0.000814326 3 1 BeFree
Allergic disposition 0.000542884 2 0 BeFree
Lupus Erythematosus, Systemic 0.000542884 2 0 BeFree
Autoimmune Diseases 0.000542884 2 0 BeFree
Allergic rhinitis (disorder) 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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