TIGD5 (tigger transposable element derived 5)

symbol:
TIGD5
locus group:
protein-coding gene
location:
8q24.3
gene_family:
Helix-turn-helix CENPB type domain containing
alias symbol:
FLJ14926
alias name:
None
entrez id:
84948
ensembl gene id:
ENSG00000179886
ucsc gene id:
uc003yyx.3
refseq accession:
NM_032862
hgnc_id:
HGNC:18336
approved reserved:
2002-07-22
8q24.3
基因染色体位置图

TIGD5(Tigger Transposable Element Derived 5)属于Tigger转座子衍生基因家族(TIGD家族),该家族由转座子衍生基因组成,其成员通常含有DNA结合结构域,可能在基因调控中发挥作用。TIGD5的具体生物学功能尚未完全明确,但研究表明它可能参与转录调控或染色质重塑等过程。TIGD家族基因的共性包括含有保守的锌指结构域,可能与DNA结合相关,并在进化过程中保留了部分转座子的特征序列。TIGD5的表达产物可能作为一种调控因子,影响其他基因的表达水平。目前关于TIGD5突变的研究较少,但转座子衍生基因的异常突变可能导致基因表达紊乱,进而影响细胞功能。TIGD5的异常表达(过表达或低表达)可能干扰正常的基因调控网络,但目前尚未发现与特定疾病的直接关联。由于TIGD家族基因与转座子相关,其表达变化可能影响基因组稳定性。需要注意的是,TIGD5的功能研究仍处于早期阶段,许多细节尚待进一步探索。该基因在不同组织中的表达模式及其精确的分子机制仍需更多实验验证。

The protein encoded by this gene belongs to the tigger subfamily of the pogo superfamily of DNA-mediated transposons in humans. These proteins are related to DNA transposons found in fungi and nematodes, and more distantly to the Tc1 and mariner transposases. They are also very similar to the major mammalian centromere protein B. The exact function of this gene is not known. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白属于人类DNA介导转座子的弹簧单高跷超家族的tigger的亚科。这些蛋白质涉及在真菌和线虫发现DNA转座子,并且更远的Tc1和水手转座。他们也非常相似,主要的哺乳动物着丝粒蛋白B.该基因的确切功能尚不清楚。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

TIGD5基因的碱基序列:[NCBI]
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TIGD5基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2242095       rs4874166       rs10282929       rs10282930       rs34773560       rs58573550       rs62522168       rs75547282       rs77619415       rs79581712       rs112147940       rs112876127       rs113655003       rs116514707       rs117626827       rs138051250       rs138998808      

TIGD5基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACAACCAGGACAAGTTCCC
59
AAATTCCTCAAAGAACCAGCC
59
CACAACCAGGACAAGTTCC
58
ATTCCTCAAAGAACCAGCC
57
ACAACCAGGACAAGTTCCC
59
AATTCCTCAAAGAACCAGCC
58
      尚未收录相关数据

TIGD5基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TIGD5基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003674
Q53EQ6 (UniProtKB)
ND
GO:0003677
Q53EQ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q53EQ6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005575
Q53EQ6 (UniProtKB)
ND
GO:0005634
Q53EQ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0008150
Q53EQ6 (UniProtKB)
ND

可能调控 TIGD5基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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