THBS3 (thrombospondin 3)

symbol:
THBS3
locus group:
protein-coding gene
location:
1q22
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
7059
ensembl gene id:
ENSG00000169231
ucsc gene id:
uc001fix.4
refseq accession:
NM_007112
hgnc_id:
HGNC:11787
approved reserved:
1994-11-18
1q22
基因染色体位置图

THBS3(血小板反应蛋白3,英文全称Thrombospondin 3)属于血小板反应蛋白(Thrombospondin,TSP)基因家族,该家族包含五个成员(TSP1-5),其共性是通过分泌性糖蛋白参与细胞间相互作用、细胞黏附、迁移及信号传导,并在组织发育、血管生成和免疫调节中发挥重要作用。THBS3编码的蛋白是一种细胞外基质蛋白,主要功能是调节细胞与基质的相互作用,影响组织重塑和修复过程。其表达产物通过结合其他基质蛋白(如胶原蛋白和纤连蛋白)或细胞表面受体(如整合素和CD36)来调控细胞行为,例如抑制血管生成(阻止新血管形成)和影响肿瘤微环境。THBS3的主要作用位点包括细胞外基质、发育中的组织及炎症或损伤部位。突变可能导致其功能异常,例如丧失对血管生成的抑制作用,从而促进肿瘤生长或慢性炎症;某些突变还与结缔组织疾病(如埃勒斯-当洛斯综合征)相关。THBS3过表达可能增强基质稳定性但抑制组织修复,而低表达可能导致基质结构缺陷或异常血管增生。在疾病方面,THBS3与多种癌症(如乳腺癌、胃癌)的进展和转移相关,其表达水平常作为预后标志物;此外,它在纤维化疾病(如肺纤维化)中通过调控TGF-β信号通路参与病理过程。THBS3与家族其他成员(如THBS1/2)共享抗血管生成特性,但相比THBS1,它对肿瘤微环境的调控作用更侧重于基质重塑而非直接抑制内皮细胞。专业术语解释:细胞外基质(ECM)是细胞外的结构网络,提供支撑并影响细胞功能;整合素是细胞表面受体,介导细胞与基质的黏附;TGF-β(转化生长因子-β)是一种调控细胞生长和分化的信号蛋白。

The protein encoded by this gene belongs to the thrombospondin family. Thrombospondin family members are adhesive glycoproteins that mediate cell-to-cell and cell-to-matrix interactions. This protein forms a pentameric molecule linked by a single disulfide bond. This gene shares a common promoter with metaxin 1. Alternate splicing results in coding and non-coding transcript variants. [provided by RefSeq, Nov 2011]

由该基因编码的蛋白质属于血小板家族。血小板反应蛋白家族成员是介导细胞 - 细胞和细胞 - 基质相互作用粘合剂的糖蛋白。该蛋白质形成了由单一的二硫键连接的五聚体分子。该基因股与metaxin 1中编码替代剪接的结果和非编码转录本变体的共同启动子。 [由RefSeq的,2011年11月提供]

THBS3基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
THBS3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs406141       rs423144       rs1058189       rs1058195       rs1058197       rs2974937       rs3198800       rs7366775       rs11355526       rs34676899       rs35484178       rs41264915       rs41264917       rs41264919       rs41302117       rs72704114       rs74118415      

THBS3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATCAAGAATGTTGAGGCATCC
60
CCTCATCCCTGTCTGTCTG
59
GTAGTCATGTGGAAGCAGAC
58
CTGATGTCACTGCCTTGAG
58
AGTGTCAGGCTTCCATGAG
59
ACTCGTACACTTCCATGCA
59
AGATCAACAAAGTGACCAATGC
60
TTGAAGAGGGTGAGTTGGG
59
AATCCTACCCAGATGCAGAC
59
AGTTGTCCTTGGTGTCCTG
60
GGCGTATTTGAGGATGCAG
59
CATTGGTCACTGCACTGTG
60
ATCGATGAATGCAACGATGG
59
CACACTTGAAAGAGCCCAC
59
ATCGATGAATGCAACGATGG
59
CACACTTGAAAGAGCCCAC
59
CTACATTCGGGTGAAGCTC
58
AGCAGAATACACCAAGACG
58
TAATGAAGACAGCGATGGG
57
GTTATCAGAGTCCAGCTGG
57
      尚未收录相关数据

THBS3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

THBS3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
B4DQH6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
B4DQH6 (UniProtKB)
IEA
GO:0008201
B4DQH6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
F5H4Z8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
F5H4Z8 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
F5H4Z8 (UniProtKB)
IEA
GO:0008201
F5H4Z8 (UniProtKB)
IEA
GO:0003417
P49746 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
P49746 (UniProtKB)
NAS
GO:0005576
P49746 (UniProtKB)
TAS
GO:0007160
P49746 (UniProtKB)
NAS
GO:0008201
P49746 (UniProtKB)
IDA
GO:0043931
P49746 (UniProtKB)
IEA
GO:0048471
P49746 (UniProtKB)
IDA
GO:0060346
P49746 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q2HIZ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
Q2HIZ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
Q2HIZ1 (UniProtKB)
IEA

可能调控 THBS3基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Tumor Progression 0.000271442 1 0 BeFree
Osteosarcoma of bone 0.000271442 1 0 BeFree
Osteosarcoma 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。