TGIF2 (TGFB induced factor homeobox 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TGIF2
locus group:
protein-coding gene
location:
20q11.23
gene_family:
TALE class homeboxes and pseudogenes
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
60436
ensembl gene id:
ENSG00000118707
ucsc gene id:
uc021wcv.2
refseq accession:
NM_021809
hgnc_id:
HGNC:15764
approved reserved:
2001-05-31

基因染色体位置

基因染色体位置

20q11.23
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TGIF2（TGFB-Induced Factor Homeobox 2）属于TGIF基因家族，该家族成员均为同源盒（homeobox）转录因子，具有保守的DNA结合结构域，参与调控基因表达。TGIF家族蛋白通常通过结合特定DNA序列或与其他转录因子相互作用，影响细胞增殖、分化和发育过程。TGIF2在胚胎发育中起关键作用，尤其在神经管闭合和面部发育中，其异常表达可能导致先天性畸形。TGIF2能抑制TGF-β（转化生长因子-β）信号通路，该通路调控细胞生长、分化和凋亡。当TGIF2突变时，可能导致其功能丧失或异常，进而破坏TGF-β信号平衡，与颅面畸形（如全前脑畸形holoprosencephaly）和某些癌症（如胃癌、乳腺癌）相关。TGIF2过表达可能过度抑制TGF-β通路，促进肿瘤细胞增殖和转移；而表达降低则可能解除对TGF-β的抑制，导致纤维化或细胞周期异常。此外，TGIF2与家族成员TGIF1功能部分冗余，但TGIF2在特定组织（如神经系统）中表达更显著。TGIF2还参与染色质重塑复合物的招募，影响表观遗传修饰。其突变或表达异常可能间接影响下游靶基因（如细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂CDKN1A）的表达，从而干扰细胞稳态。

The protein encoded by this gene is a DNA-binding homeobox protein and a transcriptional repressor, which appears to repress transcription by recruiting histone deacetylases to TGF beta-responsive genes. This gene is amplified and over-expressed in some ovarian cancers. Alternative splicing results in multiple transcript variants. A related pseudogene has been identified on chromosome 1. Read-through transcription also exists between this gene and the neighboring downstream C20orf24 (chromosome 20 open reading frame 24) gene. [provided by RefSeq, Dec 2010]

由该基因编码的蛋白质是DNA结合同源盒蛋白和转录阻遏，这似乎通过招募组蛋白脱乙酰对TGFβ-内响应基因来抑制转录。此基因被扩增并且在一些卵巢癌中过表达。选择性剪接结果在多个抄本变形。一个相关的假基因已被确定1号染色体上通读转录该基因与邻近下游C20orf24（染色体20开放阅读框24）基因之间也存在。 [由RefSeq的，2010年12月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TGIF2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs220074       rs2273191       rs6101329       rs6101334       rs6101335       rs71337977       rs74797010       rs76169709       rs77836086       rs78586592       rs111730622       rs112403261       rs138567734       rs139035460       rs140953151       rs141471092       rs144076016      

基因表达

基因表达

TGIF2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTGCTGCAAATATGTAACTGG
58
ATTAGGGTCTTTGCCATCCT
58
TGCAAAGGTCTTCAACAGGA
59
CAGAGTCAGCAGAGGAGAG
58
ACAGACCAACCTGTCAGTG
59
TGATCCCAATGTTTGGCAG
58
ACAGACCAACCTGTCAGTG
59
GATCCCAATGTTTGGCAGTG
59
GTGCTGCAAATATGTAACTGG
58
ATTAGGGTCTTTGCCATCC
57
TGCAAAGGTCTTCAACAGG
58
CAGAGTCAGCAGAGGAGAG
58
GTGCTGCAAATATGTAACTGG
58
TTAGGGTCTTTGCCATCCT
58
GCAAAGGTCTTCAACAGGA
58
CAGAGTCAGCAGAGGAGAG
58
TTCTGGACAGACCAACCTG
59
AATGTTTGGCAGTGATCCA
57

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
HDAC4
TGIF2
Activation
17610967

基因本体信息

TGIF2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TGIF2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
H0YKN5 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
H0YKN5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
H0YKN5 (UniProtKB)
IDA
GO:0006355
H0YKN5 (UniProtKB)
IEA
GO:0000122
Q9GZN2 (UniProtKB)
IMP
GO:0000122
Q9GZN2 (UniProtKB)
TAS
GO:0003677
Q9GZN2 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
Q9GZN2 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
Q9GZN2 (UniProtKB)
NAS
GO:0005634
Q9GZN2 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q9GZN2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q9GZN2 (UniProtKB)
TAS
GO:0006351
Q9GZN2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q9GZN2 (UniProtKB)
NAS
GO:0010470
Q9GZN2 (UniProtKB)
IEA
GO:0038092
Q9GZN2 (UniProtKB)
IEA
GO:0045666
Q9GZN2 (UniProtKB)
IEA
GO:0060041
Q9GZN2 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
U3KQB5 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
U3KQB5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
U3KQB5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
U3KQB5 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
U3KQS0 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
U3KQS0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
U3KQS0 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
U3KQS0 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TGIF2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Holoprosencephaly 0.000271442 1 0 BeFree
Rectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of bone 0.000271442 1 0 BeFree
Medulloblastoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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