TGFB1I1 (transforming growth factor beta 1 induced transcript 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TGFB1I1
locus group:
protein-coding gene
location:
16p11.2
gene_family:
alias symbol:
Hic-5|TSC-5|ARA55|HIC-5
alias name:
hydrogen peroxide-inducible clone-5
entrez id:
7041
ensembl gene id:
ENSG00000140682
ucsc gene id:
uc021tgx.1
refseq accession:
NM_001042454
hgnc_id:
HGNC:11767
approved reserved:
1998-03-23

基因染色体位置

基因染色体位置

16p11.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TGFB1I1（转化生长因子β1诱导转录本1，英文全称Transforming Growth Factor Beta 1 Induced Transcript 1）属于TGFB1I1基因家族，该家族成员通常参与细胞外基质（ECM，细胞外的蛋白质网络，支撑细胞结构）的调控和细胞黏附过程。TGFB1I1编码的蛋白质是一种细胞骨架相关蛋白，主要通过与肌动蛋白（actin，细胞骨架的主要成分）和其他细胞骨架蛋白相互作用，参与细胞形态维持、迁移和信号转导（细胞内外信息传递的过程）。该基因在多种组织中表达，尤其在心脏、骨骼肌和血管组织中表达较高。TGFB1I1的功能受转化生长因子β1（TGF-β1，一种调控细胞生长和分化的细胞因子）的诱导，参与组织修复、纤维化（器官中异常瘢痕组织形成）和炎症反应。突变或表达异常可能导致细胞迁移和黏附功能紊乱，与多种疾病相关，例如心血管疾病、肿瘤转移和纤维化疾病。过表达TGFB1I1可能增强细胞迁移能力，促进肿瘤侵袭和转移，同时加剧组织纤维化；而降低表达则可能抑制这些病理过程，但也可能影响正常组织修复。TGFB1I1基因家族成员的共性是参与细胞-基质相互作用和细胞运动调控，通常与TGF-β信号通路（调控细胞生长、分化和免疫反应的分子途径）密切相关。

This gene encodes a coactivator of the androgen receptor, a transcription factor which is activated by androgen and has a key role in male sexual differentiation. The encoded protein is thought to regulate androgen receptor activity and may have a role to play in the treatment of prostate cancer. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2009]

该基??因编码的雄激素受体，它是由雄激素活化，并且在男性性分化关键作用的转录因子的辅激活物。所编码的蛋白质被认为是调节雄激素受体活性，并且可以具有一个作用在前列腺癌的治疗中发挥。已发现该基因编码不同亚型的多个抄本变形。 [由RefSeq的，2009年09月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TGFB1I1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs10596       rs13143       rs3813003       rs7188278       rs7196958       rs7200926       rs11646911       rs17552087       rs28411344       rs28612377       rs34081766       rs45453597       rs45455396       rs45455600       rs45456592       rs45471402       rs45471995      

基因表达

基因表达

TGFB1I1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCTGACCTGGAGACTACCA
59
TGATTTCATCTGTACAGGTGGT
60
TCTCTGACCTGGAGACTACC
60
CATACCGTGCTGTACAGGT
60
GACCACCTGTACAGGTGAG
59
CTCACCTGAGACTCAGTTGG
60
CCTCCATTCTCCTCTTCCAG
59
GGAACTGAGACATGATTTCATCTG
60
TCTGACCTGGAGACTACCA
59
GTACAGGTGGTCCTTGTCC
60
CCTCCATTCTCCTCTTCCA
58
CTGAGACATGATTTCATCTGTG
57
TCTGACCTGGAGACTACCA
59
CATACCGTGCTGTACAGGT
60
CTGACCTGGAGACTACCAC
59
ATGATTTCATCTGTACAGGTGG
58
GACCACCTGTACAGGTGAG
59
TCACCTGAGACTCAGTTGG
59
CTGACCTGGAGACTACCAC
59
TGTACAGGTGGTCCTTGTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TGFB1I1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TGFB1I1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003713
O43294 (UniProtKB)
IDA
GO:0003713
O43294 (UniProtKB)
NAS
GO:0005515
O43294 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43294 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43294 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43294 (UniProtKB)
IPI
GO:0005622
O43294 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
O43294 (UniProtKB)
IEA
GO:0005856
O43294 (UniProtKB)
IEA
GO:0005925
O43294 (UniProtKB)
IDA
GO:0006366
O43294 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
O43294 (UniProtKB)
TAS
GO:0008270
O43294 (UniProtKB)
IEA
GO:0008285
O43294 (UniProtKB)
TAS
GO:0009408
O43294 (UniProtKB)
IEA
GO:0010718
O43294 (UniProtKB)
IDA
GO:0016055
O43294 (UniProtKB)
IEA
GO:0016331
O43294 (UniProtKB)
IEA
GO:0016363
O43294 (UniProtKB)
IEA
GO:0030511
O43294 (UniProtKB)
IDA
GO:0030512
O43294 (UniProtKB)
IDA
GO:0030521
O43294 (UniProtKB)
NAS
GO:0030579
O43294 (UniProtKB)
IDA
GO:0030855
O43294 (UniProtKB)
IEA
GO:0045165
O43294 (UniProtKB)
IEA
GO:0045599
O43294 (UniProtKB)
IEA
GO:0045893
O43294 (UniProtKB)
IDA
GO:0045893
O43294 (UniProtKB)
NAS
GO:0048495
O43294 (UniProtKB)
IPI
GO:0050681
O43294 (UniProtKB)
IPI
GO:0050681
O43294 (UniProtKB)
NAS
GO:0070411
O43294 (UniProtKB)
IPI
GO:0031012
O43294 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TGFB1I1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostatic Neoplasms 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Cicatrix, Hypertrophic 0.003267234 2 0 BeFree_LHGDN
Prostate carcinoma 0.002171535 8 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.001900093 7 0 BeFree
Hormone refractory prostate cancer 0.000542884 2 0 BeFree
Atherosclerosis 0.000271442 1 0 BeFree
Azoospermia 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Progesterone Resistance 0.000271442 1 0 BeFree
Endometriosis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

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