TFF3 (trefoil factor 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TFF3
locus group:
protein-coding gene
location:
21q22.3
gene_family:
alias symbol:
HITF|ITF
alias name:
None
entrez id:
7033
ensembl gene id:
ENSG00000160180
ucsc gene id:
uc002zav.4
refseq accession:
NM_003226
hgnc_id:
HGNC:11757
approved reserved:
1995-11-22

基因染色体位置

基因染色体位置

21q22.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TFF3（三叶因子3，Trefoil Factor 3）是一种主要由胃肠道杯状细胞分泌的小分子蛋白，属于三叶因子家族（TFF家族）。该家族包括TFF1、TFF2和TFF3，其共同特点是含有保守的三叶结构域（Trefoil domain），能抵抗胃酸和蛋白酶降解，主要功能是参与黏膜修复、维持上皮屏障完整性及调节炎症反应。TFF3在肠道中高表达，其表达产物通过结合黏蛋白（Mucin）形成凝胶层，保护黏膜免受机械或化学损伤，并促进受损上皮细胞迁移修复。TFF3的作用位点集中在胃肠道黏膜表面，尤其在结肠和空肠中活性显著。若TFF3发生突变，可能导致黏膜防御功能下降，与炎症性肠病（如克罗恩病）、肠易激综合征甚至肿瘤发生相关。研究发现，TFF3过表达会加速伤口愈合，但可能促进某些癌症（如结直肠癌）的侵袭和转移，因其能激活EGFR/ERK等促增殖信号通路；而敲低TFF3则导致黏膜修复延迟、肠道屏障功能受损，增加感染风险。TFF家族成员的共性是具有细胞保护作用，但各成员分布和功能存在差异：TFF1主要在胃，TFF2在胃和十二指肠，TFF3则集中于下消化道。目前"三叶因子"的中文译名存在争议（原英文Trefoil factor直译为"三叶草因子"），但"三叶因子"已成为主流术语。该基因还参与免疫调节，其表达受IL-6等炎症因子调控，与NF-κB信号通路相互作用。在肿瘤中，TFF3可能发挥双重作用：低浓度时促进组织修复，高浓度时则驱动肿瘤进展。

Members of the trefoil family are characterized by having at least one copy of the trefoil motif, a 40-amino acid domain that contains three conserved disulfides. They are stable secretory proteins expressed in gastrointestinal mucosa. Their functions are not defined, but they may protect the mucosa from insults, stabilize the mucus layer and affect healing of the epithelium. This gene is expressed in goblet cells of the intestines and colon. This gene and two other related trefoil family member genes are found in a cluster on chromosome 21. [provided by RefSeq, Jul 2008]

三叶家族成员是由具有三叶主题的至少一个拷贝，包含三个保守的二硫化物有40个氨基酸域为特征。它们在胃肠道粘膜上表达的稳定分泌蛋白。它们的功能没有定义，但是它们可以保护粘膜从辱骂，稳定该粘液层而影响上皮愈合。该基因在肠内和结肠的杯状细胞中表达。这种基因和其他两个相关的三叶家族成员的基因簇中发现[由RefSeq的，2008年7月提供] 21号染色体。

OMIM数据库中对TFF3基因的介绍     Wikipedia数据库中对TFF3基因的介绍

基因序列

基因序列

TFF3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TFF3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs225360       rs225361       rs225362       rs225363       rs225439       rs533093       rs538407       rs2236705       rs2236706       rs2282554       rs4920083       rs9976749       rs11203193       rs11203195       rs11701143       rs11702422       rs57517454      

基因表达

基因表达

TFF3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCTGCTGAGGAGTACGTG
60
TCAGAAGGTGCATTCTGCT
59
CTGTCTGCAAACCAGTGTG
59
ATTCTGCCTGCTTCCTCAG
60
CTTTGACTCCAGGATCCCTG
60
AAGGTGCATTCTGCTTCCT
60
CTCTGCTGAGGAGTACGTG
60
GAAGGTGCATTCTGCTTCC
59
CTCTGCTGAGGAGTACGTG
60
ATTCTGCCTGCTTCCTCAG
60
CTTTGACTCCAGGATCCCT
58
AAGGTGCATTCTGCTTCCT
60
CTGTCTGCAAACCAGTGTG
59
ATTCTGCCTGCTTCCTCAG
60
TTTGACTCCAGGATCCCTG
59
AAGGTGCATTCTGCTTCCT
60
CTCTGCTGAGGAGTACGTG
60
AAGGTGCATTCTGCTTCCT
60

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
CDX2
TFF3
Activation
17182120
CEBPB
TFF3
Unknown
12297725
ERG
TFF3
Unknown
21170267
NFKB1
TFF3
Activation
12912861
NFKB1
TFF3
Unknown
12297725
RELA
TFF3
Activation
12912861
RELA
TFF3
Unknown
12297725

基因本体信息

TFF3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TFF3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0010906
A0A0A6YYJ4 (UniProtKB)
IEA
GO:0030141
A0A0A6YYJ4 (UniProtKB)
IEA
GO:0043434
A0A0A6YYJ4 (UniProtKB)
IEA
GO:0003674
Q07654 (UniProtKB)
ND
GO:0005515
Q07654 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q07654 (UniProtKB)
IPI
GO:0005576
Q07654 (UniProtKB)
TAS
GO:0005578
Q07654 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q07654 (UniProtKB)
IEA
GO:0006952
Q07654 (UniProtKB)
TAS
GO:0007586
Q07654 (UniProtKB)
TAS
GO:0007586
Q07654 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
Q07654 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TFF3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Acute kidney injury 0.12 1 0 CTD_human
Hepatitis, Animal 0.12 1 0 CTD_human
Inflammatory disease of mucous membrane 0.12 1 0 CTD_human
Kidney Diseases 0.12 1 0 CTD_human
Colonic Neoplasms 0.08272435 2 0 LHGDN_RGD
Precancerous Conditions 0.080271442 2 0 BeFree_RGD
Fetal Growth Retardation 0.08 1 0 RGD
Thyroid Neoplasm 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Liver carcinoma 0.003267234 2 0 BeFree_LHGDN
Colorectal Neoplasms 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN

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基因相关服务

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