TFDP3 (transcription factor Dp family member 3)

symbol:
TFDP3
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq26.2
gene_family:
alias symbol:
HCA661|E2F-like|CT30
alias name:
E2F-like protein|cancer/testis ant…
entrez id:
51270
ensembl gene id:
ENSG00000183434
ucsc gene id:
uc004exb.1
refseq accession:
NM_016521
hgnc_id:
HGNC:24603
approved reserved:
2004-07-15
Xq26.2
基因染色体位置图

TFDP3(转录因子Dp家族成员3)属于转录因子Dp(DP)基因家族,该家族还包括TFDP1和TFDP2。DP家族成员通常与E2F转录因子家族形成异源二聚体,共同调控细胞周期相关基因的表达,尤其在G1/S期转换中起关键作用。TFDP3与其他家族成员类似,含有DNA结合结构域和二聚化结构域,但其表达模式和功能存在差异。TFDP3主要在睾丸中高表达,可能参与生殖细胞发育和精子发生过程。研究表明,TFDP3能与E2F1结合,但其具体生物学功能尚未完全阐明。TFDP3的突变或表达异常可能与男性不育症相关,因为其功能受损可能影响精子生成。当TFDP3过表达时,可能干扰正常的E2F/DP调控网络,导致细胞周期紊乱,但具体机制仍需进一步研究。降低TFDP3表达可能影响生殖细胞发育,导致精子发生障碍。值得注意的是,TFDP3在某些癌症中也被检测到异常表达,提示它可能参与肿瘤发生发展,但相关证据仍有限。与TFDP1和TFDP2相比,TFDP3的组织分布更局限,功能更具特异性。该基因家族的主要共性是参与细胞周期调控,通过与E2F因子相互作用影响下游靶基因转录。目前对TFDP3的研究相对较少,其在生理和病理过程中的确切作用仍需深入探索。

This gene encodes a member of the DP family of transcription factors. These factors heterodimerize with E2F proteins to enhance their DNA-binding activity and promote transcription from E2F target genes. This protein functions as a negative regulator and inhibits the DNA binding and transcriptional activities of E2F factors.[provided by RefSeq, May 2010]

该基因编码在DP家族转录因子的成员。这些因素与E2F蛋白异源二聚体,以提高它们的DNA结合活性和从E2F靶基因促进转录。该蛋白质作为负调节和抑制DNA结合和E2F因子转录活性。[通过的RefSeq,2010年5月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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TFDP3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs28455963       rs35745873       rs61732904       rs73638807       rs76002399       rs111884715       rs112164266       rs112692082       rs113383994       rs138184941       rs139589319       rs140423331       rs140543102       rs141896027       rs145651503       rs146717857       rs147545090      

TFDP3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATCAGCAGTAGCAAGAAGAC
58
GATATTCTGATTTGTCGTCGGAG
60
CATCAGCAGTAGCAAGAAGAC
59
ATATTCTGATTTGTCGTCGGAG
59
CAGCACAACAGGAAAGGAG
59
AGACCTTCATGGAAAGACGG
60
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
TFDP3
E2F1
Unknown
TFDP3
MAP1LC3B
Activation

TFDP3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TFDP3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000082
Q5H9I0 (UniProtKB)
IDA
GO:0000981
Q5H9I0 (UniProtKB)
IBA
GO:0003677
Q5H9I0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q5H9I0 (UniProtKB)
IBA
GO:0005667
Q5H9I0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q5H9I0 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q5H9I0 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
Q5H9I0 (UniProtKB)
IBA
GO:0006974
Q5H9I0 (UniProtKB)
IDA
GO:0046982
Q5H9I0 (UniProtKB)
IDA

可能调控 TFDP3基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of testis 0.000271442 1 0 BeFree
Liver neoplasms 0.000271442 1 0 BeFree

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