TFDP1 (transcription factor Dp-1)

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TFDP1
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protein-coding gene
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13q34
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Dp-1|DRTF1|DP1|DILC
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down-regulated in liver cancer ste…
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HGNC:11749
approved reserved:
1995-02-02
13q34
基因染色体位置图

TFDP1(转录因子Dp-1)属于E2F转录因子家族中的DP亚家族,该家族成员(如TFDP1和TFDP2)通常与E2F蛋白形成异源二聚体,共同调控细胞周期相关基因的表达。E2F/DP复合物是细胞周期进程的核心调控因子,主要作用于G1/S期转换,通过结合特定DNA序列激活或抑制下游靶基因(如Cyclin E、CDK2等),从而影响细胞增殖、分化和凋亡。TFDP1的生物学功能依赖于与E2F的结合,其表达产物本身不具备DNA结合能力,但能增强E2F的稳定性和转录活性。 若TFDP1发生突变(如错义突变或缺失),可能导致E2F/DP复合物功能异常,进而扰乱细胞周期调控。例如,某些癌症中TFDP1的扩增或过表达会过度激活E2F靶基因,促进细胞不受控增殖;而TFDP1表达降低则可能阻碍细胞进入S期,导致发育缺陷或组织再生障碍。该基因与多种疾病相关,包括视网膜母细胞瘤(与RB1-E2F通路失调有关)、肺癌和乳腺癌(常伴随TFDP1拷贝数增加)。 在基因家族层面,DP亚家族的共性包括:含有保守的DNA结合域和二聚化域,依赖与E2F合作调控靶基因,且成员间存在功能冗余(例如TFDP2可部分补偿TFDP1缺失)。过表达TFDP1可能通过增强E2F活性加速肿瘤发生,而敲低其表达或使用抑制剂(如小分子干扰E2F/DP相互作用)已成为抗癌策略的研究方向。需注意的是,TFDP1的功能高度依赖细胞类型和上下文,例如在某些干细胞中它对维持静息状态至关重要。术语方面,"异源二聚体"(heterodimer)指由两种不同蛋白组成的复合物,"拷贝数增加"(copy number gain)表示基因在基因组中重复导致过量表达。

This gene encodes a member of a family of transcription factors that heterodimerize with E2F proteins to enhance their DNA-binding activity and promote transcription from E2F target genes. The encoded protein functions as part of this complex to control the transcriptional activity of numerous genes involved in cell cycle progression from G1 to S phase. Alternative splicing results in multiple transcript variants. Pseudogenes of this gene are found on chromosomes 1, 15, and X.[provided by RefSeq, Jan 2009]

该基因编码一个家族的与E2F蛋白异源二聚体,以提高它们的DNA结合活性和从E2F靶基因促进转录的转录因子的成员。所编码的蛋白质的功能,因为这复杂的控制参与细胞周期进展从G1期进入S期众多基因的转录活性的一部分。选择性剪接结果在多个抄本变形。该基因的假基因在染色体15 1,发现和X. [由RefSeq的,2009年1月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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TFDP1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1806586       rs2001275       rs2316118       rs2316119       rs2316120       rs2316121       rs3222185       rs3751451       rs3751452       rs4075532       rs4150686       rs4150687       rs4150688       rs4150689       rs4150690       rs4150691       rs4150692      

TFDP1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGGTTCTCTGCCAGTGAC
59
GTTGAAGTCATCGTCCTCCT
59
ATGCCGGTCTAATTGAAGC
58
CGTACCAATTACCACTTGCT
58
TTCCTACAACGAAGTGGCA
59
GTCATAAGCTGACTCGTTTGG
59
CGGATCTGGTAACATGGCA
59
TCCATCTTTCACCTTCATCCC
59
AAGGTTCTCTGCCAGTGAC
59
TTGAAGTCATCGTCCTCCTC
59
CGGATCTGGTAACATGGCA
59
CCATCTTTCACCTTCATCCC
58
TCCTACAACGAAGTGGCAG
59
GTCATAAGCTGACTCGTTTGG
59
ATGCCGGTCTAATTGAAGC
58
TACCAATTACCACTTGCTGG
57
CGGATCTGGTAACATGGCA
59
CATCTTTCACCTTCATCCCG
58
ATGCCGGTCTAATTGAAGC
58
ACCAATTACCACTTGCTGG
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
RB1
TFDP1
Repression
RBL1
TFDP1
Repression
TFDP1
CAV1
Unknown
TFDP1
CCNE1
Activation
TFDP1
CDK1
Activation
TFDP1
DHFR
Activation
TFDP1
MYBL2
Activation
TFDP1
NRIP1
Activation
TFDP1
PCNA
Activation
TFDP1
RRM1
Activation

TFDP1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TFDP1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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Q5JSB6 (UniProtKB)
IEA

可能调控 TFDP1基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Juvenile arthritis 0.12 1 0 CTD_human
Liver carcinoma 0.006534468 4 0 BeFree_LHGDN
Lymphoma, Non-Hodgkin 0.00272435 1 0 LHGDN
Malignant neoplasm of ovary 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Breast Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000814326 3 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Squamous cell carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree

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电话: 0531-88819269

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