TDRD6 (tudor domain containing 6)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TDRD6
locus group:
protein-coding gene
location:
6p12.3
gene_family:
Tudor domain containing
alias symbol:
NY-CO-45|bA446F17.4|CT41.2|SPATA36
alias name:
cancer/testis antigen 41.2|spermat…
entrez id:
221400
ensembl gene id:
ENSG00000180113
ucsc gene id:
uc010jze.3
refseq accession:
NM_001010870
hgnc_id:
HGNC:21339
approved reserved:
2003-11-27

基因染色体位置

基因染色体位置

6p12.3
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TDRD6基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3799277       rs7750596       rs7750818       rs7751263       rs7754945       rs9369630       rs9472819       rs10948299       rs11961117       rs13196132       rs35028991       rs41273658       rs41273660       rs45610733       rs60607361       rs70996385       rs73471190      

基因表达

基因表达

TDRD6基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTTCTCTGAGGAAGAAAGCAG
59
GTGTTCTGTAGTTGAGCTGAG
59
GTTCTCTGAGGAAGAAAGCAG
58
GTGTTCTGTAGTTGAGCTGAG
58
GTTCTCTGAGGAAGAAAGCAG
59
GTGTTCTGTAGTTGAGCTGAG
59
GGAGGAGATAGTGAACCCT
58
CTTTGGGATACAGCCTCAG
58
TGGAGGAGATAGTGAACCCT
59
TTTGGGATACAGCCTCAGG
59
TGCCTTTGTTCTCTGAGGA
58
GTAGTTGAGCTGAGATATGATCTG
58
TGCCTTTGTTCTCTGAGGA
59
GTAGTTGAGCTGAGATATGATCTG
59
TGCCTTTGTTCTCTGAGGA
59
GTAGTTGAGCTGAGATATGATCTG
59
TGTTCTCTGAGGAAGAAAGC
57
TGTTCTGTAGTTGAGCTGAG
57
AGGAGATAGTGAACCCTGAG
58
CTCTTTGGGATACAGCCTC
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TDRD6基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TDRD6基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005737
O60522 (UniProtKB)
ISS
GO:0007275
O60522 (UniProtKB)
IEA
GO:0007283
O60522 (UniProtKB)
ISS
GO:0030154
O60522 (UniProtKB)
IEA
GO:0033391
O60522 (UniProtKB)
ISS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TDRD6基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant tumor of colon 0.000271442 1 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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