TDRD1 (tudor domain containing 1)

symbol:
TDRD1
locus group:
protein-coding gene
location:
10q25.3
gene_family:
Tudor domain containing
alias symbol:
CT41.1
alias name:
cancer/testis antigen 41.1
entrez id:
56165
ensembl gene id:
ENSG00000095627
ucsc gene id:
uc001lbg.1
refseq accession:
NM_001365891
hgnc_id:
HGNC:11712
approved reserved:
2000-06-16
10q25.3

TDRD1(Tudor domain-containing protein 1)是一种含有Tudor结构域的蛋白质,属于TDRD基因家族。Tudor结构域是一种能够识别并结合甲基化精氨酸或甲基化赖氨酸的蛋白质模块,参与调控RNA代谢、染色质重塑和表观遗传调控等过程。TDRD1主要在哺乳动物的生殖细胞中表达,特别是在精原细胞和精母细胞中高表达,对精子发生(spermatogenesis)至关重要。TDRD1通过与PIWI蛋白(如MILI和MIWI)相互作用,参与piRNA(PIWI-interacting RNA)通路,调控转座子沉默和生殖细胞发育,确保基因组稳定性。TDRD1基因突变可能导致男性不育,表现为精子发生阻滞或精子形态异常,因为其功能受损会影响piRNA介导的转座子抑制,导致生殖细胞DNA损伤和凋亡。此外,TDRD1的异常表达可能与某些睾丸生殖细胞肿瘤相关。TDRD1过表达可能干扰正常的piRNA通路,导致转座子激活和基因组不稳定,而降低表达则可能直接损害精子发生,引发不育。TDRD基因家族的成员通常含有Tudor结构域,并参与生殖细胞发育、RNA代谢和表观遗传调控,其中多个成员(如TDRD5、TDRD7)与piRNA通路或配子形成相关。该家族蛋白的共性是通过识别甲基化修饰的靶蛋白(如PIWI蛋白)形成功能复合物,调控生殖细胞特异性事件。

This gene is similar to a mouse gene that encodes a tudor domain protein. Alternatively spliced transcript variants have been described but their full length sequences have not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因是相似的编码铎域蛋白质的小鼠基因。可变剪接转录物变体已有描述,但它们的全长序列尚未确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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TDRD1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs11196648       rs12767831       rs17091401       rs17091403       rs17776883       rs34933714       rs35517495       rs71484928       rs73355766       rs74397183       rs74904194       rs75407574       rs75907532       rs78097675       rs79557028       rs79965340       rs111397884      

TDRD1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGAAAGAAACCAGTGTTCCCT
60
GGTCAACACCAAGTTCAACC
60
GTGAAAGAAACCAGTGTTCC
57
GTCAACACCAAGTTCAACC
57
GTGAAAGAAACCAGTGTTCCC
60
GTCAACACCAAGTTCAACCC
60
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
ERG
TDRD1
Activation
ERG
TDRD1
Repression

TDRD1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TDRD1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0007275
Q9BXT4 (UniProtKB)
IEA
GO:0007281
Q9BXT4 (UniProtKB)
ISS
GO:0007283
Q9BXT4 (UniProtKB)
ISS
GO:0031047
Q9BXT4 (UniProtKB)
ISS
GO:0034587
Q9BXT4 (UniProtKB)
ISS
GO:0043046
Q9BXT4 (UniProtKB)
ISS
GO:0051321
Q9BXT4 (UniProtKB)
IEA

可能调控 TDRD1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostate carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000814326 3 0 BeFree
Benign Prostatic Hyperplasia 0.000271442 1 0 BeFree
Prostatic Neoplasms 0.000271442 1 0 BeFree
Male infertility 0.000271442 1 0 BeFree

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