TCIRG1 (T cell immune regulator 1, ATPase H+ transporting V0 subunit a3)

symbol:
TCIRG1
locus group:
protein-coding gene
location:
11q13.2
gene_family:
ATPase, H+ transporting subunits
alias symbol:
TIRC7|OC-116|OC116|ATP6N1C|Atp6i|a3|ATP6V0A3
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T-cell immune response cDNA 7|V-AT…
entrez id:
10312
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ENSG00000110719
ucsc gene id:
uc001one.4
refseq accession:
NM_006019
hgnc_id:
HGNC:11647
approved reserved:
1999-02-15
11q13.2
基因染色体位置图

TCIRG1(T细胞免疫调节因子1,T-cell immune regulator 1)是一种重要的免疫相关基因,属于V-ATPase(液泡型ATP酶)基因家族,该家族成员主要参与调控细胞内酸性环境的形成。TCIRG1编码的蛋白质是V-ATPase复合体的关键亚基,负责在溶酶体和破骨细胞中维持酸性环境,这对骨吸收、抗原呈递和细胞内降解过程至关重要。TCIRG1主要在破骨细胞(负责骨吸收的细胞)和免疫细胞中高表达,其功能异常会导致溶酶体酸化障碍,影响破骨细胞的骨吸收能力。TCIRG1突变与人类常染色体隐性遗传病——恶性婴儿型骨硬化症(malignant infantile osteopetrosis)密切相关,患者表现为骨密度异常增高、骨髓腔狭窄及造血功能障碍。若TCIRG1表达降低或功能缺失,会导致破骨细胞无法正常酸化骨基质,进而抑制骨吸收,引发骨硬化;而过表达可能加剧骨吸收,但与疾病关联尚不明确。该基因家族(V-ATPase)的共性是通过水解ATP提供能量,将质子(H+)跨膜转运以调节细胞器或细胞外环境的pH值,影响蛋白质降解、膜运输和信号传导等过程。TCIRG1的功能研究为骨代谢疾病和免疫缺陷提供了潜在治疗靶点。

Through alternate splicing, this gene encodes two proteins with similarity to subunits of the vacuolar ATPase (V-ATPase) but the encoded proteins seem to have different functions. V-ATPase is a multisubunit enzyme that mediates acidification of eukaryotic intracellular organelles. V-ATPase dependent organelle acidification is necessary for such intracellular processes as protein sorting, zymogen activation, and receptor-mediated endocytosis. V-ATPase is comprised of a cytosolic V1 domain and a transmembrane V0 domain. Mutations in this gene are associated with infantile malignant osteopetrosis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

通过选择性剪接,该基因编码两种蛋白质具有相似的液泡ATP酶(V-ATP酶),但编码的蛋白质的亚单位似乎有不同的功能。 V-ATP酶介导的真核细胞内细胞器的酸化多亚基酶。 V-ATP酶依赖性细胞器酸化是必要的,例如细胞内过程如蛋白质排序,酶原活化,和受体介导的内吞作用。 V-ATP酶是由一个胞质V1域和跨膜V0域的。在这种基因突变与婴儿恶性骨硬化症相关联。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

TCIRG1基因的碱基序列:[NCBI]
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TCIRG1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2853037       rs3808973       rs3808974       rs10896289       rs34227834       rs35354504       rs72926459       rs78181205       rs78249208       rs116001129       rs116976394       rs138788660       rs139054835       rs139263189       rs142053937       rs143972555       rs144158792      

TCIRG1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGTTCAGAGACCTCAACGC
60
GAAGGTCTTCTCCAGCTCC
60
TCCACACCATCGAGTTCTG
59
CTTGTTCTGGAATTCCACCG
59
TCCACACCATCGAGTTCTG
59
AACTTGTTCTGGAATTCCACC
59
CCTGGATGATGAAGAGGAGG
59
AACTCGATGGTGTGGATGG
60
ATCTACAACGAGTGCTTCAG
58
CAGGAATGCATCACTCCAG
58
AGAACGAGATCTGGCAGAC
59
GTTGTAGATGAAGCCGGTG
59
TCTGTAAAGTGGGACTGTCC
59
GTTCTGGAATTCCACCCTG
58
CTTCTCACATACCGCTGCT
60
ACAGTCCCACTTTACAGAGG
59
CTGCTCATGTTCCTGTTCG
59
TCTGCCAGATCTCGTTCTG
59
ATCGATCCTATTTGGAGCCTG
60
GTTGAAGACTCCGAGGACC
60
      尚未收录相关数据

TCIRG1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TCIRG1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0015078
E9PM12 (UniProtKB)
IEA
GO:0015991
E9PM12 (UniProtKB)
IEA
GO:0033179
E9PM12 (UniProtKB)
IEA
GO:0015078
E9PMC5 (UniProtKB)
IEA
GO:0015991
E9PMC5 (UniProtKB)
IEA
GO:0033179
E9PMC5 (UniProtKB)
IEA
GO:0015078
E9PNA6 (UniProtKB)
IEA
GO:0015991
E9PNA6 (UniProtKB)
IEA
GO:0033179
E9PNA6 (UniProtKB)
IEA
GO:0015078
H0YCE3 (UniProtKB)
IEA
GO:0015991
H0YCE3 (UniProtKB)
IEA
GO:0033179
H0YCE3 (UniProtKB)
IEA
GO:0015078
H0YEL3 (UniProtKB)
IEA
GO:0015991
H0YEL3 (UniProtKB)
IEA
GO:0033179
H0YEL3 (UniProtKB)
IEA
GO:0000220
Q13488 (UniProtKB)
IEA
GO:0005215
Q13488 (UniProtKB)
TAS
GO:0005739
Q13488 (UniProtKB)
IEA
GO:0005765
Q13488 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q13488 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q13488 (UniProtKB)
TAS
GO:0006968
Q13488 (UniProtKB)
TAS
GO:0007035
Q13488 (UniProtKB)
IBA
GO:0007039
Q13488 (UniProtKB)
ISS
GO:0008284
Q13488 (UniProtKB)
TAS
GO:0008286
Q13488 (UniProtKB)
TAS
GO:0010008
Q13488 (UniProtKB)
TAS
GO:0010008
Q13488 (UniProtKB)
TAS
GO:0010008
Q13488 (UniProtKB)
TAS
GO:0015986
Q13488 (UniProtKB)
IBA
GO:0015991
Q13488 (UniProtKB)
IEA
GO:0015992
Q13488 (UniProtKB)
TAS
GO:0016236
Q13488 (UniProtKB)
ISS
GO:0016324
Q13488 (UniProtKB)
IDA
GO:0016471
Q13488 (UniProtKB)
IBA
GO:0030670
Q13488 (UniProtKB)
TAS
GO:0033572
Q13488 (UniProtKB)
TAS
GO:0034220
Q13488 (UniProtKB)
TAS
GO:0046961
Q13488 (UniProtKB)
IBA
GO:0051117
Q13488 (UniProtKB)
IBA
GO:0070072
Q13488 (UniProtKB)
IBA
GO:0090383
Q13488 (UniProtKB)
TAS
GO:0015078
Q8TCH1 (UniProtKB)
IEA
GO:0015991
Q8TCH1 (UniProtKB)
IEA
GO:0033179
Q8TCH1 (UniProtKB)
IEA

可能调控 TCIRG1基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Osteopetrosis, Autosomal Recessive 1 0.44 2 4 CLINVAR_CTD_human_MGD_UNIPROT
Infantile malignant osteopetrosis 0.121628651 6 0 BeFree_ORPHANET
Congenital neutropenia 0.120271442 1 1 BeFree_CLINVAR
Congenital clubfoot 0.08 0 0 MGD
Osteopetrosis 0.011344477 15 0 BeFree_GAD_LHGDN
Osteoporosis 0.004734064 2 0 GAD
Infection by Cryptococcus neoformans 0.000271442 1 0 BeFree
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.000271442 1 0 BeFree
Encephalitis 0.000271442 1 0 BeFree
Idiopathic pulmonary hypertension 0.000271442 1 0 BeFree

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