TCF7 (transcription factor 7)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TCF7
locus group:
protein-coding gene
location:
5q31.1
gene_family:
alias symbol:
TCF-1
alias name:
T-cell-factor-7
entrez id:
6932
ensembl gene id:
ENSG00000081059
ucsc gene id:
uc003kyt.4
refseq accession:
NM_201634
hgnc_id:
HGNC:11639
approved reserved:
1991-08-18

基因染色体位置

基因染色体位置

5q31.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TCF7（T-cell factor 7，又称TCF1）是T细胞因子/淋巴增强因子（TCF/LEF）基因家族的重要成员，该家族是一类依赖Wnt信号通路的转录调控因子，其共性是通过与β-catenin（β-连环蛋白）结合调控下游靶基因表达，参与细胞增殖、分化和干细胞维持等过程。TCF7主要在免疫系统（尤其是T细胞）和肠道上皮细胞中表达，其编码蛋白通过形成转录复合物调控T细胞发育的关键阶段，如胸腺细胞从双阴性（DN）向双阳性（DP）阶段分化，并影响CD8+ T细胞的记忆形成和功能维持。该基因的突变或功能缺失会导致T细胞发育阻滞、免疫缺陷，甚至促进自身免疫性疾病或肿瘤发生，例如TCF7缺失的小鼠表现为胸腺萎缩和T细胞减少。在疾病关联方面，TCF7异常表达与多种癌症相关，如在肝细胞癌中低表达可能促进肿瘤侵袭，而在某些淋巴瘤中过表达可能通过激活Wnt通路驱动癌变。当过表达时，TCF7可能增强T细胞抗肿瘤活性或导致自身免疫反应过度；而表达降低则可能削弱免疫监视功能或影响组织再生。TCF7还与其他基因（如LEF1、GATA3）协同调控免疫相关通路，其表达水平变化可能间接影响这些基因的功能网络。专业术语解释：Wnt通路（调控胚胎发育和细胞稳态的信号途径）、β-catenin（参与细胞黏附和基因转录的关键蛋白）、胸腺细胞（T细胞发育的中间阶段细胞）。目前中文常将TCF7与TCF1混用，但需注意TCF1可能指代该基因或其蛋白产物。

The protein encoded by this gene is a transcriptional activator that plays an important role in lymphocyte differentiation. This gene is expressed predominantly in T-cells. The encoded protein can bind an enhancer element and activate the CD3E gene, and it also may repress the CTNNB1 and TCF7L2 genes through a feedback mechanism. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2011]

由该基因编码的蛋白质是转录激活，发挥在淋巴细胞分化中起重要作用。该基因是在T细胞中表达。所编码的蛋白质可以结合增强子元件并激活CD3E基因，并且它也可以通过反馈机制抑制的CTNNB1和TCF7L2基因。已发现该基因编码不同亚型的几个抄本变形。 [由RefSeq的，2011年10月提供]

OMIM数据库中对TCF7基因的介绍     Wikipedia数据库中对TCF7基因的介绍

基因序列

基因序列

TCF7基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TCF7基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs30491       rs30492       rs43153       rs173424       rs244656       rs244657       rs737114       rs737115       rs5742913       rs6888307       rs10043685       rs36203382       rs36203383       rs36203744       rs36203745       rs36203746       rs55780420      

基因表达

基因表达

TCF7基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGTTCTGGTGTACCTGGTC
59
CTTGTGTCTTCAGGTTGCG
59
CAGAAGCAAGTTCACAGGC
59
TGTCTATATCCGCAGGAAGG
58
GCCAGAAGCAAGTTCACAG
59
TAGCATCAAGGATGGGTGG
59
GCCAGAAGCAAGTTCACAG
59
CAGGTCTTGGTCTGACCAG
59
CCAAGTACTATGAGCTGGC
57
CTTCTTCCCGTAGTTGTCC
57
TTCTGGTGTACCTGGTCAC
59
GCTTGTGTCTTCAGGTTGC
59
CAGAAGCAAGTTCACAGGC
59
GTCTATATCCGCAGGAAGGG
59
CAAGTACTATGAGCTGGCC
57
CTTCTTCCCGTAGTTGTCC
57
CCAGAAGCAAGTTCACAGG
58
CAGGTCTTGGTCTGACCAG
59
CCAGAAGCAAGTTCACAGG
58
TAGCATCAAGGATGGGTGG
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
CTNNB1
TCF7
Unknown
17724465
TCF7
SNAI2
Unknown
20128911

基因本体信息

TCF7基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TCF7基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016055
B7WNT5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
E5RG34 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
E5RG34 (UniProtKB)
IEA
GO:0008013
E5RG34 (UniProtKB)
IEA
GO:0033153
E5RG34 (UniProtKB)
IEA
GO:0060070
E5RG34 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
E5RG75 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
E5RG75 (UniProtKB)
IEA
GO:0008013
E5RG75 (UniProtKB)
IEA
GO:0033153
E5RG75 (UniProtKB)
IEA
GO:0060070
E5RG75 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
E5RGQ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
E5RGQ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0008013
E5RGQ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0033153
E5RGQ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0060070
E5RGQ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
E5RHL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
E5RHL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0008013
E5RHL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0033153
E5RHL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0060070
E5RHL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
E5RJ51 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
E5RJ51 (UniProtKB)
IEA
GO:0008013
E5RJ51 (UniProtKB)
IEA
GO:0033153
E5RJ51 (UniProtKB)
IEA
GO:0060070
E5RJ51 (UniProtKB)
IEA
GO:0016055
H0YAR8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016055
H0YBC8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
H0YBM1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
H0YBM1 (UniProtKB)
IEA
GO:0008013
H0YBM1 (UniProtKB)
IEA
GO:0033153
H0YBM1 (UniProtKB)
IEA
GO:0060070
H0YBM1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016055
H0YBP2 (UniProtKB)
IEA
GO:0000122
P36402 (UniProtKB)
IEA
GO:0001047
P36402 (UniProtKB)
IEA
GO:0001227
P36402 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P36402 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P36402 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P36402 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P36402 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
P36402 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
P36402 (UniProtKB)
TAS
GO:0005667
P36402 (UniProtKB)
IBA
GO:0005719
P36402 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
P36402 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
P36402 (UniProtKB)
TAS
GO:0006955
P36402 (UniProtKB)
TAS
GO:0008013
P36402 (UniProtKB)
IDA
GO:0021915
P36402 (UniProtKB)
IEA
GO:0030538
P36402 (UniProtKB)
IEA
GO:0033153
P36402 (UniProtKB)
IEA
GO:0042127
P36402 (UniProtKB)
IEA
GO:0043565
P36402 (UniProtKB)
IBA
GO:0044212
P36402 (UniProtKB)
IDA
GO:0044212
P36402 (UniProtKB)
IDA
GO:0044336
P36402 (UniProtKB)
IEA
GO:0046632
P36402 (UniProtKB)
IEA
GO:0048557
P36402 (UniProtKB)
IEA
GO:0048619
P36402 (UniProtKB)
IEA
GO:0060070
P36402 (UniProtKB)
IBA
GO:0071353
P36402 (UniProtKB)
IDA
GO:1904837
P36402 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TCF7基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.010901282 17 0 BeFree_GAD
Inflammation 0.007101096 3 0 GAD
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.006362715 7 1 BeFree_GAD
Colorectal Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Colorectal Cancer 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Maturity onset diabetes mellitus in young 0.002442977 9 0 BeFree
Venous Thromboembolism 0.002367032 1 0 GAD
Trachoma 0.002367032 1 0 GAD
Brain Ischemia 0.002367032 1 0 GAD
Chlamydia Infections 0.002367032 1 0 GAD

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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