TCAM1P (testicular cell adhesion molecule 1, pseudogene)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TCAM1P
locus group:
pseudogene
location:
17q23.3
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
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entrez id:
146771
ensembl gene id:
ENSG00000240280
ucsc gene id:
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refseq accession:
NR_002947
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HGNC:30707
approved reserved:
2005-07-26

基因染色体位置

基因染色体位置

17q23.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TCAM1P（Testicular Cell Adhesion Molecule 1 Pseudogene）是一种假基因，属于细胞粘附分子基因家族。假基因通常是由功能基因复制或逆转录转座产生的非功能性DNA序列，缺乏完整的编码能力或调控元件，因此不产生功能性蛋白。TCAM1P与功能基因TCAM1（Testicular Cell Adhesion Molecule 1）高度同源，后者在睾丸细胞粘附过程中可能发挥作用，参与生殖细胞发育或精子发生。由于TCAM1P是假基因，其本身不表达功能性产物，但可能通过竞争性结合miRNA或转录因子等方式间接调控其他基因的表达。目前关于TCAM1P突变的研究较少，但假基因的突变通常不会直接影响机体功能，除非其干扰了邻近功能基因的调控。假基因的异常表达（如过表达）可能通过“海绵效应”吸附miRNA，从而解除对靶基因的抑制，影响相关通路。例如，某些假基因的过表达与癌症进展相关，但TCAM1P的具体作用尚不明确。降低TCAM1P表达可能对机体无明显影响，因其本身无功能。TCAM1P属于细胞粘附分子基因家族，该家族成员通常编码跨膜蛋白，介导细胞间或细胞与基质间的相互作用，参与组织构建、免疫应答和信号传导等过程。目前尚未发现TCAM1P与特定疾病的直接关联，但假基因的异常调控可能与肿瘤、神经退行性疾病等有关，需进一步研究验证。

This pseudogene is located downstream from the growth hormone locus on chromosome 17. This locus evolved by a series of partial duplications that have disrupted the human gene. A homologous gene in mouse encodes a testis-specific cell adhesion protein that may play a role in germ cell-Sertoli cell interactions. [provided by RefSeq, Apr 2012]

此假从生长激素基因的下游位于17号染色??体上该轨迹由一系列的局部重复的已打乱了人基因进化。在小鼠同源基因编码一个睾丸特异性细胞粘附蛋白可能在生殖细胞，支持细胞相互作用的作用。 [由RefSeq的，2012年4月提供]

OMIM数据库中对TCAM1P基因的介绍     Wikipedia数据库中对TCAM1P基因的介绍

基因序列

基因序列

TCAM1P基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TCAM1P基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2156903       rs2236736       rs2236737       rs2320116       rs2320117       rs2320118       rs2584597       rs2584598       rs2584599       rs2584600       rs2584601       rs2584603       rs2584604       rs2584606       rs2584607       rs2584608       rs2584609      

基因表达

基因表达

TCAM1P基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGTAGAACAAACGGTCTGAG
58
GATAAGAAGGGCCAAAGGC
59
TCACTGTGTATTAGCCACCAG
60
TTCACTGTGAAGGCTTCGT
60
CTGTCATTGTTCAAGGACTGG
59
ATGGTGATGACACCCACTC
59
TCACTGTGTATTAGCCACCA
59
TTCACTGTGAAGGCTTCGT
60
GTAGAACAAACGGTCTGAGC
59
GATAAGAAGGGCCAAAGGC
59
TGTCATTGTTCAAGGACTGGA
60
ATGGTGATGACACCCACTC
59
CTGGAACCTACCGCTACAC
60
CATCCAGTCCTTGAACAATGAC
60
ACTGTGTATTAGCCACCAGAG
60
CTTCACTGTGAAGGCTTCG
59
TAGAACAAACGGTCTGAGC
58
GATAAGAAGGGCCAAAGGC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TCAM1P基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TCAM1P基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TCAM1P基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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