TBX6 (T-box transcription factor 6)

symbol:
TBX6
locus group:
protein-coding gene
location:
16p11.2
gene_family:
T-boxes
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
6911
ensembl gene id:
ENSG00000149922
ucsc gene id:
uc010veh.3
refseq accession:
NM_004608|NM_080758
hgnc_id:
HGNC:11605
approved reserved:
1998-08-10
16p11.2
基因染色体位置图

TBX6(T-box transcription factor 6)属于T-box基因家族,该家族成员均含有一个保守的T-box结构域(一种DNA结合域),能够调控胚胎发育过程中的基因表达,尤其在体节形成、心脏发育及肢体模式建立中起关键作用。TBX6主要在胚胎中胚层(mesoderm)表达,主导体节(somite,未来发育为脊椎、肌肉等结构)的分化,其表达产物是一种转录因子,通过结合特定DNA序列激活或抑制下游靶基因(如MESP2、RIPPLY2等),从而协调体节发育的时序与空间分布。 TBX6功能缺失突变(如无义突变或移码突变)可导致体节分化障碍,引发先天性脊柱畸形,如脊柱肋骨发育不全(Spondylocostal Dysostosis),表现为椎骨融合、肋骨缺失等骨骼异常。此外,TBX6单倍剂量不足(haploinsufficiency,即一个等位基因失活)与中国人常见的先天性脊柱侧凸(Congenital Scoliosis)高度相关。相反,TBX6过表达可能破坏体节分化的平衡,导致体节数量或形态异常,影响脊椎和肋骨的正常发育。 在基因家族层面,T-box家族(如TBX1、TBX5、TBX20等)的共性包括:依赖T-box结构域识别并结合DNA;参与胚胎早期发育的调控;突变常导致器官发育缺陷(如TBX5突变引起Holt-Oram综合征,表现为心脏和上肢畸形)。TBX6与其他家族成员(如TBX4/TBX5)存在功能冗余,但特异性调控体节发生。 研究还发现,TBX6表达水平异常可能影响WNT和Notch信号通路(两类调控细胞命运的经典通路),例如TBX6下调会导致Notch信号过度激活,扰乱体节边界形成。目前针对TBX6的研究为脊柱畸形的基因诊断及潜在靶向治疗提供了方向,但调控其表达的具体机制仍需进一步探索。

This gene is a member of a phylogenetically conserved family of genes that share a common DNA-binding domain, the T-box. T-box genes encode transcription factors involved in the regulation of developmental processes. Knockout studies in mice indicate that this gene is important for specification of paraxial mesoderm structures. [provided by RefSeq, Aug 2008]

这个基因是共享一个公共的DNA结合结构域,所述T-box基因的系统发育保守的家族的??一个成员。 T-box基因编码参与发育过程的调控的转录因子。在小鼠中敲除的研究表明,该基因为近轴中胚层结构的规范重要。 [由RefSeq的,2008年8月提供]

TBX6基因的碱基序列:[NCBI]
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TBX6基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs62057752       rs111939223       rs116476388       rs139445724       rs144256774       rs145072660       rs147365001       rs149966369       rs150159961       rs190164167       rs529170049       rs531039767       rs532969109       rs548923633       rs557551720       rs559713073       rs561677101      

TBX6基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGAACCCACAGATCACAC
58
CTCTTACAGTTTCTGCCGT
58
GTGTCAAGCTCACCAACAG
59
GGTACTTGTGCATGGAGTG
59
ACCAGAACCCACAGATCAC
59
CTTACAGTTTCTGCCGTTCTC
59
GTGTCAAGCTCACCAACAG
59
GTACTTGTGCATGGAGTGC
59
TACCAGAACCCACAGATCAC
59
TTACAGTTTCTGCCGTTCTC
58
GTGTCAAGCTCACCAACAG
59
TACTTGTGCATGGAGTGCA
60
      尚未收录相关数据

TBX6基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TBX6基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
A0A0D9SEK4 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
A0A0D9SEK4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
A0A0D9SEK4 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
A0A0D9SEK4 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
A0A0D9SEK4 (UniProtKB)
IEA
GO:0000122
O95947 (UniProtKB)
ISS
GO:0001085
O95947 (UniProtKB)
ISS
GO:0001102
O95947 (UniProtKB)
ISS
GO:0001191
O95947 (UniProtKB)
ISS
GO:0001707
O95947 (UniProtKB)
IEA
GO:0001708
O95947 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
O95947 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
O95947 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
O95947 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95947 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95947 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95947 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
O95947 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
O95947 (UniProtKB)
IEA
GO:0007498
O95947 (UniProtKB)
TAS
GO:0009653
O95947 (UniProtKB)
TAS
GO:0010977
O95947 (UniProtKB)
IEA
GO:0014043
O95947 (UniProtKB)
IEA
GO:0023019
O95947 (UniProtKB)
IEA
GO:0032525
O95947 (UniProtKB)
IEA
GO:0045944
O95947 (UniProtKB)
IEA

可能调控 TBX6基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Spondylocostal Dysostosis 4, Autosomal Dominant 0.24 0 5 CLINVAR_ORPHANET
Deafness, Autosomal Recessive 67 0.12 0 0 CTD_human
Jarcho-Levin syndrome 0.080271442 1 0 BeFree_MGD
Scoliosis, unspecified 0.002367032 1 0 GAD
Congenital scoliosis 0.000542884 2 0 BeFree
Congenital Abnormality 0.000542884 2 0 BeFree
Mullerian aplasia 0.000271442 1 0 BeFree
Anemia, Sickle Cell 0.000271442 1 0 BeFree

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