TBPL2 (TATA-box binding protein like 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TBPL2
locus group:
protein-coding gene
location:
14q22.3
gene_family:
alias symbol:
TRF3|TBP2
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None
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387332
ensembl gene id:
ENSG00000182521
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NM_199047
hgnc_id:
HGNC:19841
approved reserved:
2003-01-13

基因染色体位置

基因染色体位置

14q22.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TBPL2（TATA-box binding protein like 2）属于TBP相关因子（TBP-related factors, TRF）家族，该家族成员在转录调控中发挥重要作用，尤其是通过与TATA盒结合来启动基因转录。TBPL2与经典的TATA结合蛋白（TBP）结构相似，但功能上存在差异。它主要在生殖细胞和早期胚胎发育中表达，参与调控精子发生和卵母细胞成熟等过程。TBPL2的生物学功能包括替代TBP在某些特定启动子上的作用，尤其是在缺乏TATA盒的启动子上，帮助RNA聚合酶II介导的转录起始。其主要作用位点是细胞核，通过与DNA和其他转录因子相互作用来调节基因表达。TBPL2的突变可能导致生殖功能障碍，如不育或胚胎发育异常，因为它在配子形成和早期胚胎发育中至关重要。研究表明，TBPL2与某些癌症（如卵巢癌和睾丸癌）的发生可能相关，其异常表达可能影响细胞增殖和分化。如果TBPL2过表达，可能干扰正常的转录调控网络，导致基因表达紊乱，进而影响生殖细胞发育或增加肿瘤风险。相反，降低TBPL2表达可能导致生殖细胞发育停滞或凋亡，影响生育能力。TBPL2所在的TRF家族成员通常具有保守的TBP结构域，能够结合DNA并参与转录起始，但各自在组织分布和功能上存在特异性。例如，TBPL1主要在体细胞中表达，而TBPL2则局限于生殖系统。这一家族的共性是通过调控转录影响细胞分化和发育过程。总之，TBPL2是一个关键的生殖细胞特异性转录因子，其表达水平或功能异常可能对生殖健康和疾病发展产生重要影响。

None

无

OMIM数据库中对TBPL2基因的介绍     Wikipedia数据库中对TBPL2基因的介绍

基因序列

基因序列

TBPL2基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TBPL2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs17128452       rs148687359       rs713473       rs713474       rs713475       rs713476       rs713477       rs946055       rs946056       rs1890256       rs1953739       rs1953740       rs1959443       rs2018603       rs2152975       rs2152976       rs2185036      

基因表达

基因表达

TBPL2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTTCTGAGAAAGGATGGCCT
60
CCGGATTGGATGCATTCAG
59
CAGCAGTTCAGTAGTTACGAG
59
GATAAGCAACACAATTCGTGG
58
CAGCAGTTCAGTAGTTACGA
57
GATAAGCAACACAATTCGTGG
58
GTTCTGAGAAAGGATGGCC
58
CCGGATTGGATGCATTCAG
59
GTTGGAAGCTGTGATGTGAG
59
AGGCTCGTAACTACTGAACTG
60
TTCTGAGAAAGGATGGCCT
58
CCGGATTGGATGCATTCAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TBPL2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TBPL2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
Q6SJ96 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
Q6SJ96 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q6SJ96 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q6SJ96 (UniProtKB)
IDA
GO:0006352
Q6SJ96 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
Q6SJ96 (UniProtKB)
IEA
GO:0045892
Q6SJ96 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TBPL2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Leukemia, T-Cell 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant tumor of colon 0.000271442 1 0 BeFree
Leukemogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Arteriosclerosis 0.000271442 1 0 BeFree
Diabetes Mellitus 0.000271442 1 0 BeFree
Hypoglycemia 0.000271442 1 0 BeFree
Atherosclerosis 0.000271442 1 0 BeFree
Metabolic Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Uterine Fibroids 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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