TBC1D21 (TBC1 domain family member 21)

symbol:
TBC1D21
locus group:
protein-coding gene
location:
15q24.1
gene_family:
alias symbol:
MGC34741|MgcRabGAP
alias name:
male germ cell-specific expressed,…
entrez id:
161514
ensembl gene id:
ENSG00000167139
ucsc gene id:
uc002avz.5
refseq accession:
NM_153356
hgnc_id:
HGNC:28536
approved reserved:
2005-01-05
15q24.1
基因染色体位置图

TBC1D21是TBC(Tre-2/Bub2/Cdc16)结构域家族成员之一,该家族基因编码的蛋白质通常具有GTP酶激活蛋白(GAP)活性,参与调控小G蛋白(如Rab家族)的活性,从而影响囊泡运输、膜 trafficking 和细胞信号传导等过程。TBC1D21的具体功能尚未完全阐明,但基于家族共性,它可能通过调控Rab蛋白的GTP/GDP循环参与细胞内物质运输或信号转导。研究表明,TBC结构域蛋白在神经元发育、胰岛素分泌和免疫调节中起重要作用。若TBC1D21发生功能丧失性突变,可能导致Rab蛋白持续活化,扰乱囊泡运输路径,进而影响细胞代谢或突触可塑性;而过度表达可能抑制Rab活性,阻碍膜受体循环或神经递质释放。有文献提示TBC1D21可能与男性不育相关,因其在小鼠精子变形过程中高表达,敲除后导致精子鞭毛结构异常和运动缺陷。该基因家族成员通常具有保守的TBC结构域和可变的其他功能域,使各成员能特异性调控不同Rab蛋白。目前尚未发现TBC1D21与重大疾病的直接关联,但鉴于TBC蛋白在癌症和神经退行性疾病中的调控作用,其潜在临床价值值得关注。表达异常可能通过干扰Rab依赖的分泌途径影响相邻基因功能,例如突触相关蛋白的运输或激素释放。

None

TBC1D21基因的碱基序列:[NCBI]
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TBC1D21基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1452393       rs4886717       rs5813726       rs7163502       rs7166181       rs11072447       rs11631222       rs12592549       rs58309771       rs71137359       rs74023587       rs74828942       rs75221339       rs76616798       rs76721660       rs77649992       rs78009024      

TBC1D21基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCTCATCGACCTTGATGCT
60
CTGAGGAACATCCTTCTGGA
59
CTCCTTCATCCTGGGTCTG
59
CATACATTTGGCATAAGGCCT
59
CGCAATAACATTGCACGTG
59
TAGCCTCTTCTTGTCGATGAG
59
ACTACAAGGCCTTATGCCA
59
GCTGGTACTCAATGTTATTGC
58
CTCCTTCATCCTGGGTCTG
59
GCTCATCCTGGGAACTCTG
60
CTCATCGACCTTGATGCTG
58
TCTGAGGAACATCCTTCTGG
59
GGCCTTATGCCAAATGTATGAG
60
TGCTGGTACTCAATGTTATTGC
59
TCGCAATAACATTGCACGT
59
AGCCTCTTCTTGTCGATGAG
60
CTCGCAATAACATTGCACG
58
GCCTCTTCTTGTCGATGAG
58
CTCATCGACCTTGATGCTG
58
CTGAGGAACATCCTTCTGGA
59
      尚未收录相关数据

TBC1D21基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TBC1D21基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001669
Q8IYX1 (UniProtKB)
IEA
GO:0003779
Q8IYX1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005096
Q8IYX1 (UniProtKB)
IBA
GO:0005622
Q8IYX1 (UniProtKB)
IBA
GO:0006886
Q8IYX1 (UniProtKB)
IBA
GO:0012505
Q8IYX1 (UniProtKB)
IBA
GO:0031338
Q8IYX1 (UniProtKB)
IBA
GO:0070062
Q8IYX1 (UniProtKB)
IDA
GO:0090630
Q8IYX1 (UniProtKB)
IBA
GO:0017137
Q8IYX1 (UniProtKB)
IMP
GO:1902017
Q8IYX1 (UniProtKB)
IMP

可能调控 TBC1D21基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Exfoliation Syndrome 0.120271442 1 1 BeFree_GWASCAT

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