TATDN3 (TatD DNase domain containing 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TATDN3
locus group:
protein-coding gene
location:
1q32.3
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
128387
ensembl gene id:
ENSG00000203705
ucsc gene id:
uc001hjo.3
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NM_001042552
hgnc_id:
HGNC:27010
approved reserved:
2005-07-14

基因染色体位置

基因染色体位置

1q32.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TATDN3（TatD DNase Domain Containing 3）是一种含有TatD脱氧核糖核酸酶（DNase）结构域的基因，属于TATDN基因家族。该家族成员通常具有核酸酶活性，参与DNA或RNA的代谢过程，如DNA修复、重组或降解。TATDN3在多种组织中表达，但其具体生物学功能尚未完全阐明。研究表明，TATDN3可能在维持基因组稳定性中发挥作用，通过其DNase活性参与DNA损伤修复或凋亡过程中的DNA降解。该基因的突变可能影响其核酸酶活性，导致DNA修复缺陷，进而增加基因组不稳定性，可能与某些癌症或遗传性疾病相关。TATDN3的过表达可能增强DNA降解能力，可能对细胞存活产生负面影响，甚至诱导细胞凋亡；而降低表达可能导致DNA损伤积累，增加突变风险。目前关于TATDN3与特定疾病的直接关联研究较少，但因其与DNA代谢相关，推测可能在肿瘤发生或神经退行性疾病中发挥作用。TATDN基因家族的共性在于其成员均含有保守的TatD DNase结构域，具有镁离子依赖的核酸酶活性，参与核酸代谢过程。该家族在进化上较为保守，从细菌到人类均有分布，表明其在细胞功能中的重要性。进一步研究TATDN3的功能及其调控机制，可能为理解DNA代谢相关疾病提供新的视角。

None

无

OMIM数据库中对TATDN3基因的介绍     Wikipedia数据库中对TATDN3基因的介绍

基因序列

基因序列

TATDN3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TATDN3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1046219       rs2792559       rs3738798       rs3738799       rs6686164       rs7552880       rs11808882       rs11809232       rs12064985       rs12143209       rs17856201       rs35464401       rs57451249       rs61736925       rs61736926       rs73083749       rs75418468      

基因表达

基因表达

TATDN3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGCTTGGGTGTTCATCCA
60
TAGTGTGACACTTCTTTGGTC
58
CAAGAAGGCCAATGTTGTG
58
GCTACATCCAAATCCTTTAGTG
57
GACTTTGACCGCGATTTGG
60
CCTGAATGTTCGGCAACTG
60
AGCAAGAAGCAGAAACTTGTG
60
CAGGTGAATCTGTTTCTAAGCA
59
TTGGAGAAAGCCAAGAAGG
58
GCTACATCCAAATCCTTTCTG
57
CATCCAGTTCAAGGACTTCC
58
TGACTGTTACCTTTAGTGTGAC
58
CAAGAAGGCCAATGTTGTG
58
CATCCAAATCCTTTAGTGTGAC
58
GCAAGAAGCAGAAACTTGTG
58
CAGGTGAATCTGTTTCTAAGCA
59
GCAAGAAGCAGAAACTTGTG
58
CAGGTGAATCTGTTTCTAAGC
57
CAAGAAGGCCAATGTTGTG
58
GCTACATCCAAATCCTTTCTG
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TATDN3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TATDN3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016788
E9PP81 (UniProtKB)
IEA
GO:0016788
E9PPF0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016788
E9PQP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016788
E9PRA1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016788
H0YCC7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016788
H0YD82 (UniProtKB)
IEA
GO:0004518
Q17R31 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q17R31 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
Q17R31 (UniProtKB)
IEA
GO:0090305
Q17R31 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TATDN3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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