TARM1 (T cell-interacting, activating receptor on myeloid cells 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TARM1
locus group:
protein-coding gene
location:
19q13.42
gene_family:
Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
441864
ensembl gene id:
ENSG00000248385
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uc010yei.1
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NM_001135686
hgnc_id:
HGNC:37250
approved reserved:
2009-12-14

基因染色体位置

基因染色体位置

19q13.42
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TARM1（T细胞免疫受体相互作用分子1）是一种免疫调节相关基因，属于TARM基因家族。该家族成员通常编码跨膜蛋白，参与免疫细胞间的相互作用，尤其在T细胞激活和炎症反应中发挥重要作用。TARM1主要在髓系细胞（如巨噬细胞、树突状细胞）和部分T细胞中表达，其编码的蛋白通过结合T细胞表面的受体（如CD3或TCR复合物）调控免疫应答。它的生物学功能包括促进炎症因子的释放（如IL-6、TNF-α）和增强吞噬细胞的杀菌能力。TARM1的作用位点集中在免疫突触区域，通过激活下游信号通路（如Syk激酶途径）影响细胞功能。突变可能导致免疫失调：功能丧失性突变与免疫缺陷相关，表现为感染易感性增加；而功能获得性突变可能引发过度炎症，与自身免疫疾病（如类风湿关节炎）有关。该基因过表达会增强促炎反应，可能加剧炎症性疾病或自身免疫病的病理过程；反之，低表达可能导致免疫监视功能下降，增加感染风险或肿瘤发生概率。TARM1与TLR信号通路存在交叉作用，其表达水平变化可能间接影响其他免疫相关基因（如NF-κB靶基因）的活性。在疾病方面，TARM1的异常表达已报道与败血症、炎症性肠病和某些癌症的免疫逃逸相关。TARM基因家族的共性包括：均含有免疫受体酪氨酸抑制基序（ITIM）或免疫受体酪氨酸激活基序（ITAM），通过调控淋巴细胞和髓系细胞的相互作用参与先天与适应性免疫的桥梁作用。

None

无

OMIM数据库中对TARM1基因的介绍     Wikipedia数据库中对TARM1基因的介绍

基因序列

基因序列

TARM1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TARM1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs166209       rs166209       rs166209       rs166209       rs166209       rs166209       rs166209       rs166209       rs166209       rs166209       rs254245       rs254245       rs254245       rs254245       rs254245       rs254245       rs254245      

基因表达

基因表达

TARM1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGAGTACACCTGTGAATACTACAG
60
GATAAATGTCCTGTCACCAACAG
60
AAAGAAATGGACTGTGCGT
58
AACAAAGCTCACACCTCTG
58
CTCTGTTTCAGACTGTGCG
59
AACAAAGCTCACACCTCTG
58
AGAGTACACCTGTGAATACTACAG
60
ATAAATGTCCTGTCACCAACAG
59
AAGAAATGGACTGTGCGTG
59
GAACAAAGCTCACACCTCTG
59
TCTGTTTCAGACTGTGCGT
60
GAACAAAGCTCACACCTCTG
59
CTGTTTCAGACTGTGCGTG
60
GAACAAAGCTCACACCTCTG
59
GAGTACACCTGTGAATACTACAG
58
ATAAATGTCCTGTCACCAACAG
59
AAGAAATGGACTGTGCGTG
59
AACAAAGCTCACACCTCTG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TARM1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TARM1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
A0A087X1Q6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
B6A8C7 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TARM1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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