TAF7L (TATA-box binding protein associated factor 7 like)

symbol:
TAF7L
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq22.1
gene_family:
alias symbol:
CT40
alias name:
cancer/testis antigen 40
entrez id:
54457
ensembl gene id:
ENSG00000102387
ucsc gene id:
uc004ehb.4
refseq accession:
NM_001168474
hgnc_id:
HGNC:11548
approved reserved:
2000-06-29
Xq22.1
基因染色体位置图

TAF7L(TATA-box binding protein associated factor 7-like)属于TAF(TATA-box binding protein associated factors)基因家族,该家族成员是转录因子TFIID的组成部分,参与RNA聚合酶II介导的基因转录起始。TAF家族蛋白的共同特点是能与TBP(TATA结合蛋白)结合,协助识别启动子区域的TATA盒(一段DNA序列),从而调控基因表达。TAF7L主要在睾丸中高表达,其表达产物是一种核蛋白,通过与TBP和其他TAF蛋白相互作用,参与精子发生过程中的特异性转录调控。TAF7L的功能特点是具有组织特异性,尤其在男性生殖系统中发挥关键作用。其主要作用位点是精子发生相关基因的启动子区域,通过调节这些基因的转录影响精子形成。TAF7L突变可能导致男性不育,因为其功能异常会干扰精子发生过程中的基因表达程序。研究表明,TAF7L与某些男性不育症相关,其表达水平异常可能影响精子数量或质量。当TAF7L过表达时,可能扰乱睾丸中正常的转录调控网络,导致精子发生异常;而降低表达则可能直接损害精子形成相关基因的激活,造成生精障碍。TAF7L与TAF7高度同源,两者可能在某些功能上存在冗余或互补。TAF家族蛋白普遍参与基础转录机制的构建,但TAF7L等旁系同源基因(paralogous genes,即通过基因复制产生的相似基因)往往演化出组织特异性功能。专业术语解释:TATA盒是基因启动子中一段保守序列(通常为TATAAA),被TBP识别以启动转录;TFIID是由TBP和TAF蛋白组成的复合物,负责招募RNA聚合酶II;旁系同源基因指同一物种内因基因复制而产生的功能相似基因。目前TAF7L的中文译名较为统一,无需额外标注英文。

This gene is similar to a mouse gene that encodes a TATA box binding protein-associated factor, and shows testis-specific expression. The encoded protein could be a spermatogenesis-specific component of the DNA-binding general transcription factor complex TFIID. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2009]

该基因是相似的编码TATA盒结合蛋白相关因子的小鼠基因,并显示出睾丸特异??性的表达。所编码的蛋白质可以是DNA结合通用转录因子复合TFIID的特定精子组分。已发现该基因编码不同亚型选择性剪接转录变异体。 [由RefSeq的,2009年12月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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TAF7L基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs764757       rs2180271       rs3761514       rs3788764       rs3788765       rs4986641       rs4986657       rs5951328       rs5966746       rs5966747       rs5967286       rs5967287       rs5967288       rs5967289       rs5967290       rs5991903       rs5991925      

TAF7L基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCTTGTACTGTCAGGAACC
58
GCCCATCAGGCAATAAGTC
59
AGACATTTCTCAGATGCTTGTG
59
GGATCAGTAGAGGCAGCTG
60
TGCCTTGTGTTATTGAAAGCC
60
ACACAAGCATCTGAGAAATGTC
59
      尚未收录相关数据

TAF7L基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TAF7L基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003674
Q5H9L4 (UniProtKB)
ND
GO:0003713
Q5H9L4 (UniProtKB)
IBA
GO:0005669
Q5H9L4 (UniProtKB)
IBA
GO:0005737
Q5H9L4 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
Q5H9L4 (UniProtKB)
IBA
GO:0007275
Q5H9L4 (UniProtKB)
IEA
GO:0007283
Q5H9L4 (UniProtKB)
IEA
GO:0008134
Q5H9L4 (UniProtKB)
IBA
GO:0008150
Q5H9L4 (UniProtKB)
ND
GO:0030154
Q5H9L4 (UniProtKB)
IEA
GO:0035035
Q5H9L4 (UniProtKB)
IBA
GO:0044212
Q5H9L4 (UniProtKB)
IBA
GO:0051123
Q5H9L4 (UniProtKB)
IBA

可能调控 TAF7L基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Male infertility 0.00272435 1 0 LHGDN

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