TAF5 (TATA-box binding protein associated factor 5)

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TAF5
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protein-coding gene
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10q24.33
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WD repeat domain containing
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TAFII100
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1995-07-07
10q24.33
基因染色体位置图

TAF5(TATA-box binding protein associated factor 5)是转录因子IID(TFIID)复合体的核心组成部分,属于TAF(TATA-box binding protein-associated factors)基因家族。该家族成员均与TBP(TATA结合蛋白)结合形成TFIID复合体,共同参与RNA聚合酶II介导的基因转录起始。TAF5在转录调控中发挥关键作用,其通过与其他TAF蛋白及TBP结合,帮助招募RNA聚合酶II到基因启动子区域,从而启动转录过程。TAF5的表达产物是一种多功能蛋白,不仅参与基础转录机制的组装,还通过与组蛋白修饰酶(如组蛋白乙酰转移酶)相互作用影响染色质结构,进一步调节基因表达。TAF5的主要作用位点是细胞核,尤其在需要精确转录调控的发育和分化过程中至关重要。TAF5突变可能导致TFIID复合体功能异常,影响全局基因表达模式,进而引发发育缺陷或疾病。例如,TAF5突变与某些癌症(如白血病)和神经发育障碍相关,因其破坏细胞增殖或分化的关键基因调控网络。若TAF5过表达,可能通过异常激活促增殖基因导致肿瘤发生;而表达降低则可能削弱转录效率,引发细胞功能紊乱。TAF基因家族的共性在于所有成员均参与TFIID复合体组装,并具有保守的结构域(如组蛋白折叠模体),这些结构域介导蛋白间相互作用以维持转录起始复合体的稳定性。TAF5的异常表达还可能通过影响其他TAF蛋白的稳定性产生级联效应,例如干扰TAF6或TAF12的功能,从而放大转录调控缺陷。研究TAF5有助于理解真核生物转录机制的精细调控及其在疾病中的作用。

Initiation of transcription by RNA polymerase II requires the activities of more than 70 polypeptides. The protein that coordinates these activities is transcription factor IID (TFIID), which binds to the core promoter to position the polymerase properly, serves as the scaffold for assembly of the remainder of the transcription complex, and acts as a channel for regulatory signals. TFIID is composed of the TATA-binding protein (TBP) and a group of evolutionarily conserved proteins known as TBP-associated factors or TAFs. TAFs may participate in basal transcription, serve as coactivators, function in promoter recognition or modify general transcription factors (GTFs) to facilitate complex assembly and transcription initiation. This gene encodes an integral subunit of TFIID associated with all transcriptionally competent forms of that complex. This subunit interacts strongly with two TFIID subunits that show similarity to histones H3 and H4, and it may participate in forming a nucleosome-like core in the TFIID complex. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由RNA聚合酶II转录起始需要70多个多肽的活动。它协调这些活动的蛋白质是转录因子的IID(TFIID),其结合到核心启动子正确定位聚合酶,作为支架的转录复合物的其余部分的组件,并作为调节信号的信道。 TFIID是由TATA结合蛋白(TBP)和一组被称为TBP相关因子或TAFS进化保守的蛋白质的。 TAFS可能参与基础转录,作为共激活因子,功能的启动子识别或修改一般转录因子(基转移酶),以方便复杂的组装和转录起始。该基因编码与复杂的转录一切形式的主管相关TFIID的一个组成亚基。此亚基具有两个TFIID亚基,显示相似的组蛋白H3和H4强烈地相互作用,并且它可以参与形成在TFIID络合物的核小体样核心。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

TAF5基因的碱基序列:[NCBI]
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TAF5基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs954347       rs1052183       rs1052184       rs2176448       rs4918008       rs4918010       rs4918011       rs4918012       rs7069667       rs7071418       rs7099480       rs7893168       rs7894768       rs7905968       rs7913980       rs10883856       rs10883857      

TAF5基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTACCAGGGTCTCACTGC
60
ACTCTGACAGTTGAATCTGCA
60
CCGGGTAAAGTTGGAAGTG
59
GATCTCCTTGTTGGTTGTAGG
59
TGTGCACATGTACTTGGAG
58
CTGATCTCCATGGAACTTCTC
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
TAF5
CDKN1A
Unknown

TAF5基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TAF5基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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IMP
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GO:0004402
Q15542 (UniProtKB)
IDA

可能调控 TAF5基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

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