TACC1 (transforming acidic coiled-coil containing protein 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TACC1
locus group:
protein-coding gene
location:
8p11.22
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
6867
ensembl gene id:
ENSG00000147526
ucsc gene id:
uc010lwp.3
refseq accession:
NM_006283
hgnc_id:
HGNC:11522
approved reserved:
1998-07-10

基因染色体位置

基因染色体位置

8p11.22
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This locus may represent a breast cancer candidate gene. It is located close to FGFR1 on a region of chromosome 8 that is amplified in some breast cancers. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Apr 2009]

这一位点可能是一个乳腺癌候选基因。它位于靠近FGFR1上在某些乳腺癌扩增8号染色体的一个区域。已发现该基因编码不同亚型三个抄本变形。 [由RefSeq的，2009年4月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TACC1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs11467       rs14128       rs15455       rs869471       rs895622       rs908558       rs908559       rs932160       rs959560       rs1034523       rs1058409       rs1058583       rs1135990       rs1136120       rs1607101       rs1609514       rs1665513      

基因表达

基因表达

TACC1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTTACTGGCTCGGATTCTG
57
GATGGATCACAGGACTCCT
58
CCATGCTACTGATGAGGAG
57
TTCTCTATGCCTTTCACCTC
57
AAAGCAAAGGCTGAGAGTG
58
CAATTTCTTGGTTCTTCTGCTG
59
AGCCAGAGTTAAACAAGAGGA
59
TCTTCATTGGCTTTGTCCAG
59
CCACTTCACACTTATTGAGCA
59
AGCTCCTTTAGGCAGTCAC
59
AGTTTCAGCTCGGATTCTG
58
ACAGGACTCCTTGAAAGGT
58
TTAACTCTGTGGAAAGGTCC
57
CTTCTTCATTCTTCTTGAACCC
57
CCGATCACCTTTCAAGGAG
58
GCTTCTTGTGATTCTTGGCT
59
TGGGAAATGGTGGTCTCTG
59
TACCTTCAGAATCCGAGCTG
59
CTGAATAGGCTCCTTGCAC
58
CTTCTTGTGATTCACCAGCA
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TACC1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TACC1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005737
E5RFM9 (UniProtKB)
IDA
GO:0015630
E5RFM9 (UniProtKB)
IDA
GO:0045111
E5RFM9 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
E7ET87 (UniProtKB)
IDA
GO:0015630
E7ET87 (UniProtKB)
IDA
GO:0045111
E7ET87 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
E7EVI4 (UniProtKB)
IDA
GO:0015630
E7EVI4 (UniProtKB)
IDA
GO:0045111
E7EVI4 (UniProtKB)
IDA
GO:0000226
O75410 (UniProtKB)
IBA
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75410 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
O75410 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
O75410 (UniProtKB)
IBA
GO:0005737
O75410 (UniProtKB)
IDA
GO:0005815
O75410 (UniProtKB)
IEA
GO:0007049
O75410 (UniProtKB)
IEA
GO:0008283
O75410 (UniProtKB)
IBA
GO:0015630
O75410 (UniProtKB)
IBA
GO:0015630
O75410 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
O75410 (UniProtKB)
IEA
GO:0021987
O75410 (UniProtKB)
IBA
GO:0030496
O75410 (UniProtKB)
IEA
GO:0045111
O75410 (UniProtKB)
IDA
GO:0051301
O75410 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
R4GMT7 (UniProtKB)
IDA
GO:0015630
R4GMT7 (UniProtKB)
IDA
GO:0045111
R4GMT7 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TACC1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
gliosarcoma 0.12 0 0 ORPHANET
Giant Cell Glioblastoma 0.12 0 0 ORPHANET
Malignant neoplasm of breast 0.003995683 7 0 BeFree_GAD
Stomach Neoplasms 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Breast Carcinoma 0.001357209 5 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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