SYNJ2BP-COX16 (SYNJ2BP-COX16 readthrough)

symbol:
SYNJ2BP-COX16
locus group:
other
location:
14q24.2
gene_family:
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None
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100529257
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ENSG00000258644
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NM_001202547
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HGNC:48350
approved reserved:
2013-09-30
14q24.2
基因染色体位置图

SYNJ2BP-COX16是一个双功能基因,其名称来源于它与两个不同基因的融合:SYNJ2BP(突触结合蛋白2结合蛋白)和COX16(细胞色素c氧化酶组装因子16)。SYNJ2BP是一种线粒体外膜蛋白,参与线粒体与内质网的接触以及线粒体动力学调控,而COX16是线粒体内膜蛋白,参与细胞色素c氧化酶(复合物IV)的组装,对线粒体电子传递链功能至关重要。该基因的融合可能导致两种功能的结合或干扰。SYNJ2BP通过与突触结合蛋白2(SYNJ2)相互作用参与突触小泡回收和神经递质释放调控,而COX16通过稳定COX组装中间体确保呼吸链正常功能。突变可能影响线粒体功能或神经传递,例如导致线粒体疾病或神经系统异常。过表达可能扰乱线粒体动力学或呼吸链效率,而低表达可能导致能量代谢缺陷或突触功能障碍。该基因属于线粒体相关基因家族,其成员多参与能量代谢、氧化磷酸化和细胞器互作。目前关于SYNJ2BP-COX16的研究较少,但基于其组成基因的功能推测,它可能在神经退行性疾病(如帕金森病)或线粒体疾病中起作用,具体机制仍需进一步探索。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring SYNJ2BP (synaptojanin 2 binding protein) and COX16 (COX16 cytochrome c oxidase assembly homolog (S. cerevisiae)) genes on chromosome 14. The read-through transcript produces a fusion protein that shares sequence identity with each individual gene product. Alternate splicing results in multiple transcript variants that encode different isoforms. [provided by RefSeq, Feb 2011]

这一位点代表自然发生的邻国之间SYNJ2BP通读转录(synaptojanin 2结合蛋白)和COX16(COX16细胞色素氧化酶组装同源物(酿酒酵母))基因在染色体14通读转录产生融合蛋白共享序列同一性与每个单独基因产物。交替剪接产生多个转录变异体编码不同的亚型。 [由RefSeq的,2011年2月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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SYNJ2BP-COX16基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3839       rs4749       rs2332362       rs2332363       rs2332364       rs2332365       rs2332418       rs2332419       rs2332420       rs2332421       rs2332422       rs2332423       rs2877656       rs2877657       rs2877658       rs2877659       rs2877670      

SYNJ2BP-COX16基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AACATGAACGGAAGAGTGG
58
TCCAACAATCAGCAACTGAG
59
ATCCTTTCGGTAAATGGCCA
60
AGCATAGCCTGCATTACGA
59
ATAGGACATCGAGGTGAAGG
59
AGGATCCATCATGGTGAGG
59
CTAAAGAACCTGCTGCACC
59
CAATCAGCAACCTGTGCTG
60
TATTTGGTCACTGAGGAAGAG
57
GTCTTGGCCATTTACCTGAG
59
CTAAAGAACCTGCTGCACC
59
AAGCTCAGGATCCATCCTG
59
TAAAGAACCTGCTGCACCA
60
CAAGCTCAGGATCCATCCT
59
AAGATCCTTTCGGTAAATGGC
59
ATAGCCTGCATTACGAAAGAG
58
ACATGAACGGAAGAGTGGA
59
TCCAACAATCAGCAACTGAG
59
TTATTTGGTCACTGAGGAAGAG
58
TCTTGGCCATTTACCTGAG
57
      尚未收录相关数据

SYNJ2BP-COX16基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SYNJ2BP-COX16基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0031966
A0A087WUM0 (UniProtKB)
IEA
GO:0031966
A0A087WX56 (UniProtKB)
IEA
GO:0031966
A0A087WYV9 (UniProtKB)
IEA
GO:0031966
A0A087X1F5 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SYNJ2BP-COX16基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Blood pressure finding 0.12 1 1 GWASCAT
Systemic arterial pressure 0.12 1 1 GWASCAT

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