SYCP1 (synaptonemal complex protein 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SYCP1
locus group:
protein-coding gene
location:
1p13.2
gene_family:
alias symbol:
HOM-TES-14|SCP1|CT8
alias name:
cancer/testis antigen 8
entrez id:
6847
ensembl gene id:
ENSG00000198765
ucsc gene id:
uc001efr.5
refseq accession:
NM_003176
hgnc_id:
HGNC:11487
approved reserved:
1997-01-14

基因染色体位置

基因染色体位置

1p13.2
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SYCP1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs360650       rs360651       rs360652       rs360653       rs474584       rs591544       rs1286571       rs7522275       rs7522281       rs11102850       rs12057904       rs12084097       rs12139020       rs72694094       rs72694095       rs75717821       rs77174529      

基因表达

基因表达

SYCP1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAGAAAGAGACTCAGAATTAGGAC
59
AGTTCAATCTCCAAAGATGCTC
59
GTACAGAAGCTGAACTGAGAC
59
CATTTCCAAATTGCAGTTCCTG
59
TTGGTCTTCTCCAAGCCAG
60
TGTGGTAATGGCAGTTAACTG
59
CATTGCCAAAGAGCATGGT
59
CAAAGATGAGAAGCTGGTGG
59
AGAAATCACAGACACCTATCAG
58
TTGCTTTCTCAACCTCTTCC
58
AGAAATCACAGACACCTATCAG
58
TTGCTTTCTCAACCTCTTCC
58
CAAAGAAATTGCCTGCTATGTC
59
GTGGCACATATACACCATGG
59
AAGAGAATAATGCCACAAGGC
59
CATAGCAGGCAATTTCTTTGTC
59
GAAGAAAGAGACTCAGAATTAGGAC
59
AGTTCAATCTCCAAAGATGCTC
59
GAAGAAAGAGACTCAGAATTAGGAC
59
AGTTCAATCTCCAAAGATGCTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SYCP1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SYCP1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000795
A0A087WZC3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007130
A0A087WZC3 (UniProtKB)
IEA
GO:0000711
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0000775
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0000795
Q15431 (UniProtKB)
ISS
GO:0000801
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0000802
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0001673
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0007129
Q15431 (UniProtKB)
ISS
GO:0007130
Q15431 (UniProtKB)
ISS
GO:0007130
Q15431 (UniProtKB)
ISS
GO:0007131
Q15431 (UniProtKB)
ISS
GO:0007283
Q15431 (UniProtKB)
TAS
GO:0032880
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0035092
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0051026
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0051301
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0051878
Q15431 (UniProtKB)
IEA
GO:0000795
Q5VXJ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0007130
Q5VXJ5 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SYCP1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Pancreatic Neoplasm 0.12 1 0 CTD_human
Adenocarcinoma 0.12 1 0 CTD_human
Azoospermia 0.002367032 1 0 GAD
Oligospermia 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of testis 0.001085767 4 0 BeFree
Lymphoma, T-Cell, Cutaneous 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Myeloid Leukemia, Chronic 0.000271442 1 0 BeFree
Xeroderma Pigmentosum 0.000271442 1 0 BeFree
Myeloid Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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