SURF1 (SURF1 cytochrome c oxidase assembly factor)

symbol:
SURF1
locus group:
protein-coding gene
location:
9q34.2
gene_family:
Mitochondrial respiratory chain complex assembly factors
alias symbol:
SHY1
alias name:
surfeit locus protein 1
entrez id:
6834
ensembl gene id:
ENSG00000148290
ucsc gene id:
uc004cdh.3
refseq accession:
NM_003172
hgnc_id:
HGNC:11474
approved reserved:
1989-11-29
9q34.2
基因染色体位置图

SURF1(Surfeit locus protein 1)是一种位于线粒体内膜的核基因编码蛋白,属于SURF基因家族成员之一。该家族包含SURF1至SURF6共6个基因,特点是紧密连锁且功能多样,但均与细胞基本生理过程相关。SURF1主要参与线粒体呼吸链复合体IV(细胞色素c氧化酶,COX)的组装和稳定性维持,这是能量代谢中氧化磷酸化的关键步骤。其表达产物通过与其他组装因子(如COX10、COX15)相互作用,促进COX亚基的正确组装。SURF1突变会导致严重的线粒体疾病,最常见的是Leigh综合征(亚急性坏死性脑脊髓病),表现为进行性神经退化、肌张力低下和乳酸酸中毒,因COX活性缺陷引发能量代谢障碍。突变类型包括无义突变、错义突变或剪切位点突变,均会破坏SURF1的分子伴侣功能,使COX组装失败。过表达SURF1可能通过稳定COX复合体提升线粒体呼吸效率,但异常高表达可能干扰其他组装因子的平衡;而表达降低则直接导致COX缺陷,影响ATP生成并增加活性氧(ROS)积累,进而触发细胞凋亡。此外,SURF1表达变化可能间接影响依赖线粒体功能的基因网络,如糖酵解相关基因(如HK2)或抗氧化基因(如SOD2)的上调补偿能量缺失。目前未发现SURF1与癌症直接相关,但其功能紊乱可能通过代谢重编程影响肿瘤微环境。诊断上可通过基因测序或COX活性检测筛查突变,治疗策略集中于对症支持和实验性线粒体替代疗法。

This gene encodes a protein localized to the inner mitochondrial membrane and thought to be involved in the biogenesis of the cytochrome c oxidase complex. The protein is a member of the SURF1 family, which includes the related yeast protein SHY1 and rickettsial protein RP733. The gene is located in the surfeit gene cluster, a group of very tightly linked genes that do not share sequence similarity, where it shares a bidirectional promoter with SURF2 on the opposite strand. Defects in this gene are a cause of Leigh syndrome, a severe neurological disorder that is commonly associated with systemic cytochrome c oxidase deficiency. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码定位于线粒体内膜和被认为参与了细胞色素C氧化酶复合物的生物合成的蛋白质。该蛋白质是SURF1家族,包括相关的酵母蛋白SHY1和立克次体蛋白RP733的成员。该基因位于过量基因簇中,一组不共享序列相似性,其中,这股与SURF2在相对链上的双向启动子非常紧密连锁的基因。在这个基因的缺陷是利综合症,也就是通常与全身的细胞色素C氧化酶缺乏症相关联的严重的神经性疾病的原因。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

SURF1基因的碱基序列:[NCBI]
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SURF1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs484248       rs484248       rs599924       rs599924       rs4962133       rs4962133       rs45598732       rs45598732       rs71503340       rs71503340       rs73660479       rs73660479       rs76574453       rs76574453       rs113814131       rs113814131       rs138050767      

SURF1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATTGAAATGAACCAACTGCC
59
AATACGGAACTTGTCACTCC
58
TCCTGGTAAATAGAGGGTTCG
59
CCACTTCTCCCTCAATCTGG
60
GAAGTGGAAGCTGAACCTG
59
TTTCAGTTCCATTGGGTCG
58
TCCTGGTAAATAGAGGGTTCG
59
CCACTTCTCCCTCAATCTGG
60
TCCTGGTAAATAGAGGGTTCG
59
CCACTTCTCCCTCAATCTGG
60
GAAGTGGAAGCTGAACCTG
59
TTTCAGTTCCATTGGGTCG
58
CAACTTCCAGAGCACAGTC
59
ATGTACTGCAGATGCTCGT
59
CAACTTCCAGAGCACAGTC
59
ATGTACTGCAGATGCTCGT
59
CAACTTCCAGAGCACAGTC
59
ATGTACTGCAGATGCTCGT
59
GAAGCTGAACCTGATTGCA
59
TTTCAGTTCCATTGGGTCG
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
MYC
SURF1
Activation
YY1
SURF1
Activation
YY1
SURF1
Unknown

SURF1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SURF1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016020
A0A087WYS9 (UniProtKB)
IEA
GO:0004129
Q15526 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q15526 (UniProtKB)
IPI
GO:0005746
Q15526 (UniProtKB)
TAS
GO:0006119
Q15526 (UniProtKB)
IMP
GO:0006754
Q15526 (UniProtKB)
IMP
GO:0008535
Q15526 (UniProtKB)
TAS
GO:0009060
Q15526 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
Q15526 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
Q15526 (UniProtKB)
TAS
GO:1902600
Q15526 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SURF1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Leigh Disease 0.585469386 58 1 BeFree_CLINVAR_CTD_human_GAD_LHGDN_MGD_ORPHANET_UNIPROT
Cytochrome-c Oxidase Deficiency 0.13758764 36 0 BeFree_CLINVAR_GAD_LHGDN
Leigh syndrome , French Canadian type 0.12 1 0 CTD_human
Craniofacial Abnormalities 0.12 1 0 CTD_human
Intellectual Disability 0.12 1 0 CTD_human
Myasthenic Syndrome due to Mutation in SCN4A 0.12 0 5 CLINVAR
Alcoholic Intoxication, Chronic 0.002367032 1 0 GAD
Crohn Disease 0.002367032 1 0 GAD
Neurodegenerative Disorders 0.001085767 4 0 BeFree
Mitochondrial Diseases 0.001085767 4 0 BeFree

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