SUMO1P1 (SUMO1 pseudogene 1)

symbol:
SUMO1P1
locus group:
pseudogene
location:
20q13.2
gene_family:
alias symbol:
PIC1L
alias name:
None
entrez id:
391257
ensembl gene id:
ENSG00000241721
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refseq accession:
NR_002189
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HGNC:33148
approved reserved:
2006-10-16
20q13.2
基因染色体位置图

SUMO1P1(Small Ubiquitin-like Modifier 1 Pseudogene 1)是一个假基因,属于SUMO基因家族。假基因通常是由功能基因复制或逆转录而来,但由于突变积累失去了编码功能蛋白的能力。SUMO基因家族的主要成员(如SUMO1、SUMO2、SUMO3)编码小泛素样修饰蛋白(SUMO),这些蛋白通过共价结合靶蛋白(SUMO化修饰)参与调控多种细胞过程,包括转录调控、DNA修复、蛋白质定位和信号转导等。SUMO1P1作为假基因,目前没有证据表明它能编码功能性蛋白,但它可能通过转录本或作为竞争性内源RNA(ceRNA)影响SUMO家族功能基因的表达调控。由于假基因的突变通常不会直接影响机体功能,但某些情况下可能通过干扰正常基因的表达或调控网络产生间接影响。SUMO1P1的过表达或降低表达可能通过竞争性结合miRNA或其他调控因子,间接影响SUMO化修饰相关通路,进而影响细胞应激反应、增殖或凋亡等过程。SUMO化修饰的异常与神经退行性疾病、癌症和免疫疾病等相关,但SUMO1P1在这些疾病中的具体作用尚不明确。研究假基因的功能挑战较大,但它们在基因表达调控网络中的潜在作用正逐渐受到关注。

None

SUMO1P1基因的碱基序列:[NCBI]
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SUMO1P1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs6068699       rs6068700       rs6068702       rs6097643       rs6126997       rs6126998       rs6126999       rs11699573       rs12151887       rs13039214       rs16998496       rs16998499       rs17535481       rs35079884       rs57593448       rs61603831       rs66507739      

SUMO1P1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAGAACTGGGAATGGAGGA
59
GACCTCCGATTTGTTCCTG
58
GAAGAACTGGGAATGGAGG
58
GACCTCCGATTTGTTCCTG
58
TCAAGAAATCGTACTGTCAGAG
58
TCAAAGAGAAACCTGAGGGA
58
      尚未收录相关数据

SUMO1P1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SUMO1P1基因的本体(GO)信息:

可能调控 SUMO1P1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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