STON1-GTF2A1L (STON1-GTF2A1L readthrough)

symbol:
STON1-GTF2A1L
locus group:
other
location:
2p16.3
gene_family:
alias symbol:
SALF
alias name:
stoned B/TFIIA alpha/beta like fac…
entrez id:
286749
ensembl gene id:
ENSG00000068781
ucsc gene id:
uc061jag.1
refseq accession:
NM_001198593
hgnc_id:
HGNC:30651
approved reserved:
2007-07-31
2p16.3
基因染色体位置图

STON1-GTF2A1L是一个融合基因,由STON1基因和GTF2A1L基因通过染色体易位或重排形成。STON1基因编码stonin 1蛋白,参与突触小泡的内吞和循环过程,在神经递质释放中起重要作用。GTF2A1L基因编码通用转录因子IIA亚基1样蛋白,是转录起始复合物TFIIA的一个亚基,参与调控基因转录。STON1-GTF2A1L融合基因可能导致两种蛋白功能的异常结合,影响正常的细胞过程。目前关于该融合基因的研究较少,但类似的基因融合事件在癌症中较为常见,可能通过干扰正常基因功能或产生新的致癌功能促进肿瘤发生。STON1属于stonin基因家族,该家族成员主要参与内吞和膜运输过程;GTF2A1L属于通用转录因子家族,成员参与基础转录机制的调控。STON1-GTF2A1L融合基因的过表达可能同时影响突触功能和基因转录调控,导致细胞信号传导和基因表达异常,而表达降低可能影响正常的神经传递和转录过程。由于研究有限,该融合基因与特定疾病的关联尚不明确,但基因融合事件通常与肿瘤发生相关,未来研究需要进一步探索其生物学功能和临床意义。

STON1-GTF2A1L mRNAs are infrequent but naturally occurring read-through products of the neighboring STON1 and GTF2A1L genes. These transcripts encode fusion proteins composed of the vast majority of each of the individual elements, stonin 1 and general transcription factor IIA, 1-like. Alternative splicing results in multiple transcript variants. The significance of these read-through variants and the function of the resulting protein products have not yet been determined. [provided by RefSeq, Oct 2010]

STON1-GTF2A1L的mRNA是很少的,但自然产生的周边STON1和GTF2A1L基因通读产品。这些转录编码绝大多数每个单独元件,stonin 1和通用转录因子IIA,1-等组成的融合蛋白。选择性剪接结果在多个抄本变形。这些读通过变体的意义和所得蛋白质产物的功能还没有被确定。 [由RefSeq的,2010年10月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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STON1-GTF2A1L基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1404054       rs1404055       rs1464726       rs1464727       rs1464728       rs1464729       rs1524151       rs1524152       rs1524153       rs1524155       rs1524157       rs1524158       rs1524159       rs1554613       rs1589748       rs1589749       rs1608567      

STON1-GTF2A1L基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACAGACTGTATCTGGTCACC
59
TGAAGAATACCTGCTCTTCCA
59
TTTGGATGTGCAGAGTTGAG
59
CTGGTATCTCCCTGGTGAG
59
ACAGACTGTATCTGGTCACC
59
TGAAGAATACCTGCTCTTCCA
59
CAATCGTCAACAGGTCACC
59
CTGAAGAATACCTGCTCTTCC
58
TGATTTGCAGAAGTGCTGAG
59
ATCTCCCTGCTCAACTCTG
59
GATGATGTTAGTGAACAGGATGTG
60
TATCTCCCTGCTTATCATACTGAC
60
ACAGACTGTATCTGGTCACC
59
TGAAGAATACCTGCTCTTCCA
59
CTACAACATCCAGCCTAAACTC
58
CCTTCTTCAGCAAATAGATTCCG
59
AAACATTGTAGAAGAGGACCC
57
TTATCCGTGTCAAACAGGTC
58
GCTGAAATACACTCACCAGG
59
TAGGGCCTCTATCTTCTTGTC
59
      尚未收录相关数据

STON1-GTF2A1L基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

STON1-GTF2A1L基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005672
A0A0A6YYG5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006367
A0A0A6YYG5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006897
A0A0A6YYG5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005672
A0A0A6YYH4 (UniProtKB)
IEA
GO:0006367
A0A0A6YYH4 (UniProtKB)
IEA
GO:0006897
A0A0A6YYH4 (UniProtKB)
IEA

可能调控 STON1-GTF2A1L基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Polycystic Ovary Syndrome 0.12 2 1 GWASCAT

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