ST6GALNAC5 (ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 5)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ST6GALNAC5
locus group:
protein-coding gene
location:
1p31.1
gene_family:
Sialyltransferases
alias symbol:
MGC3184|ST6GalNAcV
alias name:
None
entrez id:
81849
ensembl gene id:
ENSG00000117069
ucsc gene id:
uc001dhi.4
refseq accession:
NM_030965
hgnc_id:
HGNC:19342
approved reserved:
2003-12-05

基因染色体位置

基因染色体位置

1p31.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ST6GALNAC5（ST6 N-乙酰氨基半乳糖胺α-2,6-唾液酸转移酶5）是ST6GALNAC基因家族的一员，属于唾液酸转移酶家族。该基因家族主要负责催化α-2,6-唾液酸转移至N-乙酰半乳糖胺（GalNAc）残基上，参与糖蛋白和糖脂的糖基化修饰，影响细胞表面分子的结构和功能。ST6GALNAC5主要在神经系统中高表达，特别是在大脑中，其表达产物参与神经细胞粘附、信号传导和突触可塑性等过程。研究表明，ST6GALNAC5在乳腺癌和肺癌等癌症中异常表达，可能与肿瘤转移相关，特别是促进癌细胞向脑部转移。该基因的突变可能导致糖基化异常，影响神经发育或肿瘤进展。过表达ST6GALNAC5可能增强癌细胞的侵袭性和转移能力，尤其是促进血脑屏障穿透，而降低表达则可能抑制这些过程。此外，ST6GALNAC5的调控异常可能与神经系统疾病如阿尔茨海默病有关，因其影响神经细胞表面分子的功能。ST6GALNAC基因家族的其他成员（如ST6GALNAC1-6）也参与类似的糖基化过程，但各自具有组织特异性表达和功能差异。该家族的共性在于调节细胞表面糖链结构，进而影响细胞间相互作用、免疫识别和疾病发展。ST6GALNAC5的深入研究有助于理解神经系统疾病和癌症转移的分子机制，并为相关治疗提供潜在靶点。

ST6GALNAC5 belongs to a family of sialyltransferases that modify proteins and ceramides on the cell surface to alter cell-cell or cell-extracellular matrix interactions (Tsuchida et al., 2003 [PubMed 12668675]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

ST6GALNAC5属于家族唾液酸转移酶修改蛋白质和神经酰胺在细胞表面上以改变细胞 - 细胞或细胞 - 细胞外基质相互作用的（土田等人，2003 [搜索PubMed 12668675]）[由OMIM，三月供给2008]

OMIM数据库中对ST6GALNAC5基因的介绍     Wikipedia数据库中对ST6GALNAC5基因的介绍

基因序列

基因序列

ST6GALNAC5基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ST6GALNAC5基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs175318       rs199717       rs199718       rs199719       rs7532720       rs12732408       rs28702615       rs59425853       rs60825482       rs61122362       rs73005335       rs75230566       rs76156443       rs114219105       rs116739078       rs140813681       rs141508065      

基因表达

基因表达

ST6GALNAC5基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAATGAAGACCCTGATGCG
58
TACACTAGCAACAAGCTGG
58
CCTTCATGATTACTCGCCAC
59
TGGATATCTTCCTGTCTTTGC
58
GATTACTCGCCACAAGATGC
60
GAGCCAAGTGTTGGATATCTG
59
GGCCTTCATGATTACTCGC
59
GTTGGATATCTGTCTTTGCCAG
60
CCTTCATGATTACTCGCCA
57
TGGATATCTTCCTGTCTTTGC
58
AAATGAAGACCCTGATGCG
58
ACACTAGCAACAAGCTGGT
60
GCCTTCATGATTACTCGCC
59
GGATATCTTCCTGTCTTTGCC
59
CCTTCATGATTACTCGCCA
57
GTGTTGGATATCTGTCTTTGC
57
AAATGAAGACCCTGATGCG
58
CACTAGCAACAAGCTGGTG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ST6GALNAC5基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ST6GALNAC5基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005794
F2Z2C8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006486
F2Z2C8 (UniProtKB)
IEA
GO:0008373
F2Z2C8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F2Z2C8 (UniProtKB)
IEA
GO:0097503
F2Z2C8 (UniProtKB)
IEA
GO:0000139
Q9BVH7 (UniProtKB)
TAS
GO:0001574
Q9BVH7 (UniProtKB)
IBA
GO:0001665
Q9BVH7 (UniProtKB)
ISS
GO:0001665
Q9BVH7 (UniProtKB)
IBA
GO:0001665
Q9BVH7 (UniProtKB)
TAS
GO:0006688
Q9BVH7 (UniProtKB)
ISS
GO:0008373
Q9BVH7 (UniProtKB)
ISS
GO:0009311
Q9BVH7 (UniProtKB)
IBA
GO:0009312
Q9BVH7 (UniProtKB)
ISS
GO:0016021
Q9BVH7 (UniProtKB)
IEA
GO:0018279
Q9BVH7 (UniProtKB)
IBA
GO:0097503
Q9BVH7 (UniProtKB)
IEA
GO:0097503
Q9BVH7 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ST6GALNAC5基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Rheumatoid Arthritis 0.12 2 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Metastatic malignant neoplasm to brain 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Glioma 0.000542884 2 0 BeFree
Coronary heart disease 0.000271442 1 0 BeFree
Coronary Artery Disease 0.000271442 1 0 BeFree
Coronary Arteriosclerosis 0.000271442 1 0 BeFree
Hypercholesterolemia 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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