SSX7 (SSX family member 7)

symbol:
SSX7
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp11.22
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
280658
ensembl gene id:
ENSG00000187754
ucsc gene id:
uc004dqx.2
refseq accession:
NM_173358
hgnc_id:
HGNC:19653
approved reserved:
2002-11-19
Xp11.22

SSX7属于SSX基因家族,该家族是一组在多种癌症中异常表达的癌症/睾丸抗原(CTA)基因,尤其在睾丸和某些肿瘤组织中特异性表达。SSX家族成员(如SSX1-SSX9)具有高度保守的结构特征,包括一个N端的KRAB样结构域(可能参与转录抑制)和一个C端的SSXRD结构域(与染色质重塑相关)。SSX7基因位于X染色体短臂(Xp11.23),其编码的蛋白可能通过表观遗传调控影响基因表达,并与SYT蛋白形成融合基因(如SYT-SSX),这是滑膜肉瘤的关键分子标志(约90%病例由SYT-SSX1/SSX2融合驱动)。SSX7的正常功能尚未完全阐明,但家族成员通常参与胚胎发育和生殖细胞功能,在成人组织中表达沉默。当SSX7异常表达(如去甲基化导致激活)可能触发免疫原性反应,因其编码的抗原可被免疫系统识别。突变或融合事件可能破坏其转录调控功能,促进肿瘤发生。过表达SSX7可能干扰正常染色质结构,影响细胞周期相关基因(如CDKN1A),而表达降低对机体的影响尚不明确。值得注意的是,SSX家族成员在多种癌症(如黑色素瘤、乳腺癌)中呈现异质性表达模式,可能作为免疫治疗靶点。目前针对SSX7的特异性研究较少,其功能多通过家族共性推断,需进一步探索其分子机制及临床相关性。

The product of this gene belongs to the family of highly homologous synovial sarcoma X (SSX) breakpoint proteins. These proteins may function as transcriptional repressors. They are also capable of eliciting spontaneously humoral and cellular immune responses in cancer patients, and are potentially useful targets in cancer vaccine-based immunotherapy. SSX1, SSX2 and SSX4 genes have been involved in the t(X;18) translocation characteristically found in all synovial sarcomas. This gene appears not to be involved in this type of chromosome translocation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因的产物属于家庭高度同源的滑膜肉瘤X(SSX)断点蛋白质。这些蛋白质可以充当转录抑制。它们也能够引发癌症患者自发的体液和细胞免疫应答,且是潜在的癌症基于疫苗免疫治疗的目标。 SSX1,SSX2和SSX4基因参与了T(X; 18)易位在所有的滑膜肉瘤特征性发现。该基因似乎没有参与这种类型的染色体易位。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

SSX7基因的碱基序列:[NCBI]
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SSX7基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs782818633       rs782818348       rs782815709       rs782810812       rs782810039       rs782803891       rs782808510       rs782800248       rs782801274       rs782798805       rs782797072       rs782798094       rs782788410       rs782794278       rs782784831       rs782783042       rs782781463      

SSX7基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CGTAACCAAGGGAATCAGG
58
TTCTTGGGCATGATCTTCG
58
GATTAACAAGACATCCGGACC
59
ATAAATCACCAGCTGCTTTCTC
59
GATTAACAAGACATCCGGACC
59
TAAATCACCAGCTGCTTTCTC
59
      尚未收录相关数据

SSX7基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SSX7基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006351
Q7RTT5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q7RTT5 (UniProtKB)
IEA
GO:1903507
Q7RTT5 (UniProtKB)
IBA

可能调控 SSX7基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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