SSX2IP (SSX family member 2 interacting protein)

symbol:
SSX2IP
locus group:
protein-coding gene
location:
1p22.3
gene_family:
alias symbol:
hMsd1
alias name:
None
entrez id:
117178
ensembl gene id:
ENSG00000117155
ucsc gene id:
uc001dkj.4
refseq accession:
NM_014021
hgnc_id:
HGNC:16509
approved reserved:
2001-11-12
1p22.3

SSX2IP(也称为ADIP或AFADIN-like protein 1)是一种参与细胞黏附和迁移调控的基因,属于AFADIN(AF-6)蛋白家族。该家族成员通常含有PDZ结构域(一种介导蛋白质相互作用的模块),并在细胞连接和信号转导中发挥作用。SSX2IP的主要功能是通过与细胞骨架蛋白(如肌动蛋白)相互作用,维持细胞形态并调控细胞运动。它在神经元突触形成、免疫细胞迁移及肿瘤转移等过程中起关键作用。SSX2IP的表达产物是一种支架蛋白,能连接膜受体(如E-钙黏蛋白)与细胞内信号分子,影响Rho GTP酶通路(调控细胞运动的分子开关)。突变可能导致其无法正常结合下游蛋白,引发细胞黏附缺陷,与癌症转移(如黑色素瘤)和神经系统发育异常相关。过表达SSX2IP会增强细胞迁移能力,促进肿瘤侵袭性,而低表达则可能破坏突触稳定性,影响神经元通讯。该基因家族(AFADIN家族)的共性是通过PDZ结构域介导多种蛋白复合物组装,参与细胞极性建立和细胞间连接。目前研究还发现SSX2IP与SSX基因家族(癌症/睾丸抗原家族)存在相互作用,但具体机制仍需进一步探索。

This gene encodes a protein that binds the cancer-testis antigen Synovial Sarcoma X breakpoint 2 protein. The encoded protein may regulate the activity of Synovial Sarcoma X breakpoint 2 protein in malignant cells. Alternate splicing results in multiple transcript variants. A pseudogene of this gene is found on chromosome 3. [provided by RefSeq, Oct 2009]

该基因编码能结合的癌 - 睾丸抗原滑膜肉瘤点?x断点2蛋白的蛋白质。所编码的蛋白质可调节在恶性细胞中滑膜肉瘤点?x断点2蛋白的活性。选择性剪接结果在多个抄本变形。该基因的假基因是在[由RefSeq的,2009年10月提供] 3号染色体发现

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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SSX2IP基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1927       rs3782       rs722789       rs1057746       rs1340523       rs1340524       rs1340525       rs1538848       rs2288079       rs2298076       rs2911560       rs2911561       rs2911562       rs2911563       rs2911564       rs2911565       rs2911566      

SSX2IP基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGGTCTGTCTTCAGAAAGC
59
ACATAGCACTTGCTGTGAG
58
GATTGGAGATTGGCTTTCTCC
59
TGACACCACACCTACTGAC
59
AGTACAGGAACTGTTATTTCCG
58
TTTCACAGGAAAGGTCCCA
59
CTAAATATGACTACCTTTGACCACC
59
TGTCCCAATCAGAACTTCCT
59
AGGTCTGTCTTCAGAAAGC
57
ACATAGCACTTGCTGTGAG
58
GTACAGGAACTGTTATTTCCGA
58
GTTTCACAGGAAAGGTCCC
58
ATATGACTACCTTTGACCACCA
59
GATTGTCCCAATCAGAACTTCC
59
GGATTGGAGATTGGCTTTCTC
59
GACACCACACCTACTGACC
60
AATATGACTACCTTTGACCACC
58
ATTGTCCCAATCAGAACTTCC
58
GATTGGAGATTGGCTTTCTCC
59
GACACCACACCTACTGACC
60
      尚未收录相关数据

SSX2IP基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SSX2IP基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0007155
Q9Y2D8 (UniProtKB)
IEA
GO:0035020
Q9Y2D8 (UniProtKB)
IEA
GO:0035735
Q9Y2D8 (UniProtKB)
IMP
GO:0042384
Q9Y2D8 (UniProtKB)
IMP
GO:0051297
Q9Y2D8 (UniProtKB)
IMP
GO:2000145
Q9Y2D8 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SSX2IP基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human

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