SSH3 (slingshot protein phosphatase 3)

symbol:
SSH3
locus group:
protein-coding gene
location:
11q13.2
gene_family:
Slingshot protein phosphatases
alias symbol:
FLJ20515|FLJ10928
alias name:
None
entrez id:
54961
ensembl gene id:
ENSG00000172830
ucsc gene id:
uc001okj.4
refseq accession:
NM_018276
hgnc_id:
HGNC:30581
approved reserved:
2004-06-15
11q13.2
基因染色体位置图

SSH3(Slingshot Protein Phosphatase 3)属于Slingshot(SSH)基因家族,该家族包括SSH1、SSH2和SSH3三个成员,主要功能是通过去磷酸化调控肌动蛋白细胞骨架的动态重组。SSH家族蛋白是肌动蛋白解聚因子(ADF)/丝切蛋白(cofilin)家族的关键调节因子,通过去除ADF/cofilin的抑制性磷酸化(Ser-3位点)激活其功能,从而促进肌动蛋白丝的切断和解聚,影响细胞迁移、形态维持和突触可塑性等过程。SSH3主要在神经系统、免疫细胞和某些上皮组织中表达,其功能与神经元发育、免疫细胞趋化及肿瘤转移密切相关。SSH3的突变或表达异常可能导致ADF/cofilin活性失调,进而影响肌动蛋白动力学。例如,SSH3功能丧失可能减少细胞迁移能力,而过度激活可能增加侵袭性,与癌症转移或神经系统疾病(如阿尔茨海默病)相关。SSH3过表达会增强cofilin介导的肌动蛋白重组,促进细胞运动,可能加剧肿瘤细胞的转移潜能;而表达降低则可能抑制细胞迁移,影响伤口愈合或免疫应答。SSH家族成员的共性是均含有保守的磷酸酶结构域,但各成员的组织分布和调控机制存在差异,SSH3相比SSH1/2可能更倾向于特定细胞类型的功能调控。研究还发现SSH3与Rho GTPase信号通路交互,进一步扩展其在细胞运动中的调控网络。

None

SSH3基因的碱基序列:[NCBI]
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SSH3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4930192       rs11227761       rs11826864       rs74736063       rs75299026       rs112865164       rs138195189       rs138807212       rs139186990       rs141392969       rs145025950       rs146192337       rs149238471       rs149514380       rs150429952       rs183935393       rs191800510      

SSH3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGAACAGGAGCAGATGGA
59
GAAGAGAAGACCTCTGGCA
59
GTCACTTCCAAAGAGATCCG
58
GTTGTCGATGAAGTCACGG
59
GAGGTCCATCAGTCTTCTGG
60
GAAGAGAAGACCTCTGGCA
59
GAGGTCCATCAGTCTTCTGG
60
GAAGAGAAGACCTCTGGCA
59
TCATGGTACAGCTGCTGAG
60
AGAAACTACCAGCAGGTAGC
60
CACCAGGCCAGAGATAGTC
59
AGCCAGATACTGTAAGGCT
58
GGAAAGTGTTGGATCTGGAG
58
CTTCATGTGAAGACTCGTGG
59
ATGAAGCAGTACGAATGCAG
59
TTTCTGCTCCCAGACATGG
60
GTCACTTCCAAAGAGATCCG
58
GTTGTCGATGAAGTCACGG
59
GTCACTTCCAAAGAGATCCG
58
GTTGTCGATGAAGTCACGG
59
      尚未收录相关数据

SSH3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SSH3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
A0A087WWG1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005856
A0A087WWG1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006470
A0A087WWG1 (UniProtKB)
IEA
GO:0008138
A0A087WWG1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005856
C9JUG3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006470
C9JUG3 (UniProtKB)
IEA
GO:0008138
C9JUG3 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
E9PIT5 (UniProtKB)
IEA
GO:0004725
E9PIT5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005856
E9PIT5 (UniProtKB)
IEA
GO:0008138
E9PIT5 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
E9PIT5 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
Q8TE77 (UniProtKB)
IEA
GO:0003779
Q8TE77 (UniProtKB)
IBA
GO:0004725
Q8TE77 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q8TE77 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q8TE77 (UniProtKB)
IBA
GO:0005856
Q8TE77 (UniProtKB)
IEA
GO:0008064
Q8TE77 (UniProtKB)
IBA
GO:0008138
Q8TE77 (UniProtKB)
IEA
GO:0010591
Q8TE77 (UniProtKB)
IBA
GO:0035335
Q8TE77 (UniProtKB)
IEA
GO:0050770
Q8TE77 (UniProtKB)
IBA

可能调控 SSH3基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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