SRP72 (signal recognition particle 72)

symbol:
SRP72
locus group:
protein-coding gene
location:
4q12
gene_family:
Tetratricopeptide repeat domain containing
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
6731
ensembl gene id:
ENSG00000174780
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uc003hbv.4
refseq accession:
NM_001267722
hgnc_id:
HGNC:11303
approved reserved:
1991-12-05
4q12
基因染色体位置图

SRP72(信号识别颗粒72)是信号识别颗粒(SRP)复合体的一个重要组成部分,属于SRP基因家族。SRP是一种核糖核蛋白复合物,负责在蛋白质合成过程中将新生肽链引导至内质网(ER)进行翻译后修饰和膜定位。SRP72与其他SRP蛋白(如SRP9、SRP14、SRP19、SRP54、SRP68)及7S RNA共同组成SRP复合体,其家族共性在于参与共翻译转运(cotranslational translocation),确保分泌蛋白和膜蛋白正确靶向至内质网。SRP72的主要功能是稳定SRP复合体的结构,并协助SRP54与核糖体-新生链复合物结合,从而暂停翻译并引导其至ER膜上的SRP受体(SRPR)。若SRP72发生突变(如错义突变或截短突变),可能导致SRP复合体功能障碍,影响蛋白质的分泌和膜定位,进而引发疾病。例如,SRP72突变与先天性中性粒细胞减少症(SCN)和骨髓衰竭综合征相关,表现为造血功能异常和免疫缺陷。SRP72过表达可能干扰SRP复合体的正常组装,导致蛋白质转运效率下降或错误定位,引发内质网应激(ER stress)和未折叠蛋白反应(UPR);而表达降低则可能减少SRP复合体的稳定性,削弱共翻译转运能力,影响细胞分泌途径。此外,SRP72的表达异常还可能间接影响其他依赖ER的基因或通路,如脂质代谢、免疫球蛋白分泌等。该基因的突变或表达失调与某些癌症(如白血病)和遗传性疾病有关,突显其在细胞稳态中的关键作用。专业术语解释:共翻译转运指蛋白质在核糖体上合成的同时被转运至内质网的过程;内质网应激是ER内未折叠或错误折叠蛋白积累导致的细胞应激反应。

This gene encodes the 72 kDa subunit of the signal recognition particle (SRP), a ribonucleoprotein complex that mediates the targeting of secretory proteins to the endoplasmic reticulum (ER). The SRP complex consists of a 7S RNA and 6 protein subunits: SRP9, SRP14, SRP19, SRP54, SRP68, and SRP72, that are bound to the 7S RNA as monomers or heterodimers. SRP has at least 3 distinct functions that can be associated with the protein subunits: signal recognition, translational arrest, and ER membrane targeting by interaction with the docking protein. Mutations in this gene are associated with familial bone marrow failure. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2012]

该基因编码信号识别颗粒(SRP),核糖核蛋白复合介导的分??泌蛋白的至内质网(ER)的定位的72 kDa的亚基。 SRP的复合物由一个7S RNA和6蛋白质亚基:SRP9,SRP14,SRP19,SRP54,SRP68,和SRP72,绑定到的7S RNA为单体或异二聚体。 SRP具有能够与蛋白质亚基相关联的至少3个不同的功能:信号识别,平移逮捕和ER膜的相互作用与对接蛋白定位。在这个基因的突变与家族性骨髓衰竭相关联。已发现该基因编码不同亚型选择性剪接转录变异体。 [由RefSeq的,2012年6月提供]

SRP72基因的碱基序列:[NCBI]
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SRP72基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1142851       rs28503748       rs55915354       rs78331644       rs147698741       rs182198020       rs183733089       rs189110763       rs192226722       rs529185530       rs534074112       rs534827198       rs535338317       rs542523906       rs546193953       rs554243661       rs556567468      

SRP72基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCTTCATCTGAACTGGATGC
59
CAGATACTGTTGCAGCACTG
59
AGTGGTTCCAGAGAACCTG
59
ACAAACTTCCAACCTTCAGC
59
AAGACACTGATGGGACTGAG
59
GAAGCTGCAGAATATAAGCCA
59
TCATTATCAGAAGACACTGACC
58
TAAACTCTACTCCTTCCGCA
58
AGTGGTTCCAGAGAACCTG
59
CTTCTGATAATGAACGGCGG
59
GACAAGTGTTATACCGTTTGGA
59
AATCATCTTGGGAGTTTCGGA
60
CATTAACAAGGCTGAACAATGC
59
GGATTAACACAGGTAAGAGATGC
59
CATTATCAGAAGACACTGACCA
58
TAAACTCTACTCCTTCCGCA
58
CTTGAAGACAATAGAAAGTGCC
58
CGTTCCAAACGGTATAACAC
57
TTCATCTGAACTGGATGCCA
60
GCAGATACTGTTGCAGCAC
60
      尚未收录相关数据

SRP72基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SRP72基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005622
D6RDY6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006614
D6RDY6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005047
O76094 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O76094 (UniProtKB)
IPI
GO:0005730
O76094 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
O76094 (UniProtKB)
IDA
GO:0005783
O76094 (UniProtKB)
IDA
GO:0005786
O76094 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
O76094 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
O76094 (UniProtKB)
IDA
GO:0006614
O76094 (UniProtKB)
TAS
GO:0008312
O76094 (UniProtKB)
IEA
GO:0042493
O76094 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
O76094 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
O76094 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
R4GNC1 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
R4GNC1 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
R4GNC1 (UniProtKB)
IDA
GO:0006614
R4GNC1 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SRP72基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
BONE MARROW FAILURE SYNDROME 1 0.36 1 2 CLINVAR_ORPHANET_UNIPROT
Myelodysplasia 0.000271442 1 0 BeFree
Preleukemia 0.000271442 1 0 BeFree

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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