SPOCK3 (SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SPOCK3
locus group:
protein-coding gene
location:
4q32.3
gene_family:
alias symbol:
testican-3
alias name:
None
entrez id:
50859
ensembl gene id:
ENSG00000196104
ucsc gene id:
uc063auj.1
refseq accession:
NM_001040159
hgnc_id:
HGNC:13565
approved reserved:
2003-01-24

基因染色体位置

基因染色体位置

4q32.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SPOCK3（也称为Testican-3）属于SPOCK基因家族，该家族编码一类富含半胱氨酸的钙结合蛋白，具有调节细胞外基质（ECM）和细胞间相互作用的功能。SPOCK家族成员（SPOCK1/2/3）的共同特点是含有类似硫酸乙酰肝素蛋白聚糖（HSPG）的结构域，能影响细胞黏附、迁移和信号传导。SPOCK3主要在神经系统高表达，尤其在发育中的大脑和成年海马区，其蛋白产物通过调控神经突触可塑性（即神经元连接强度的动态调整能力）和轴突导向（神经纤维生长方向的引导）参与神经发育与修复。该基因的突变可能导致神经发育异常，如智力障碍或自闭症谱系障碍（ASD），因其功能涉及神经元网络的形成。过表达SPOCK3可能增强神经突触形成，但异常高表达与神经母细胞瘤等肿瘤的侵袭性相关，可能通过激活基质金属蛋白酶（MMP）促进癌细胞转移；而表达降低则可能损害神经再生能力，与阿尔茨海默病（AD）中突触退化有关。SPOCK3还通过调节Wnt/β-catenin信号通路（影响细胞增殖和分化的关键通路）参与骨代谢，其表达异常可能关联骨质疏松。目前SPOCK3的中文译名“斯波克3”或“睾丸蛋白聚糖-3”尚未统一，建议在学术文献中保留英文原名以避免歧义。

This gene encodes a member of a novel family of calcium-binding proteoglycan proteins that contain thyroglobulin type-1 and Kazal-like domains. The encoded protein and may play a role in adult T-cell leukemia by inhibiting the activity of membrane-type matrix metalloproteinases. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2011]

该基因编码的新的家族包含甲状腺球蛋白1型和Kazal样结构域的钙结合蛋白多糖的蛋白质的成员。所编码的蛋白质，并且可以通过抑制膜型基质金属蛋白酶的活性发挥成人T细胞白血病的作用。编码多种亚型选择性剪接的转录物变体已经观察到这种基因。 [由RefSeq的，2011年10月提供]

OMIM数据库中对SPOCK3基因的介绍     Wikipedia数据库中对SPOCK3基因的介绍

基因序列

基因序列

SPOCK3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SPOCK3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs714067       rs728112       rs745244       rs765749       rs815211       rs815212       rs815213       rs815214       rs815215       rs815216       rs815217       rs815218       rs815219       rs815220       rs815221       rs815222       rs815223      

基因表达

基因表达

SPOCK3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GACAGTGGAACAAATTCCGAG
60
CTGGATCTAAAGCCTGATCGA
60
AAGGCCCTTCATGAAAGTG
58
ATGCTGGTATCGAATCTGC
58
GATAAACAATGGCTCACCAC
57
GGAAATAATCATCGTCTCGGA
58
CAATGGCTCACCACAATCTC
59
AAGTGCGGAAATAATCATCGTC
60
GACAGTGGAACAAATTCCGA
59
CTGGATCTAAAGCCTGATCGA
60
CAAGGCCCTTCATGAAAGTG
60
TGCTGGTATCGAATCTGCT
59
AAGGCCCTTCATGAAAGTG
58
TGCTGGTATCGAATCTGCT
59
CAATGGCTCACCACAATCTC
59
AGTGCGGAAATAATCATCGTC
59
GACAGTGGAACAAATTCCGA
59
CTGGATCTAAAGCCTGATCG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SPOCK3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SPOCK3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
A0A0A0MTJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005578
A0A0A0MTJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0007165
A0A0A0MTJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
E7ENT7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005578
E7ENT7 (UniProtKB)
IEA
GO:0007165
E7ENT7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q9BQ16 (UniProtKB)
IEA
GO:0005539
Q9BQ16 (UniProtKB)
IEA
GO:0005578
Q9BQ16 (UniProtKB)
IEA
GO:0005615
Q9BQ16 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
Q9BQ16 (UniProtKB)
IDA
GO:0007165
Q9BQ16 (UniProtKB)
IEA
GO:0008191
Q9BQ16 (UniProtKB)
IEA
GO:0008191
Q9BQ16 (UniProtKB)
IDA
GO:0010951
Q9BQ16 (UniProtKB)
IEA
GO:0010951
Q9BQ16 (UniProtKB)
IDA
GO:0019800
Q9BQ16 (UniProtKB)
IEA
GO:0031012
Q9BQ16 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SPOCK3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Obesity 0.12 1 1 GWASCAT
Attention deficit hyperactivity disorder 0.002638474 1 1 BeFree_GAD
Fibrinogen Adverse Event 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Leukemia, T-Cell 0.000271442 1 0 BeFree
Personality Disorders 0.000271442 1 0 BeFree
Adult T-Cell Lymphoma/Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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