SPN (sialophorin)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SPN
locus group:
protein-coding gene
location:
16p11.2
gene_family:
CD molecules
alias symbol:
LSN|CD43|GPL115|LEU-22
alias name:
leukosialin
entrez id:
6693
ensembl gene id:
ENSG00000197471
ucsc gene id:
uc002dtn.5
refseq accession:
NM_001030288
hgnc_id:
HGNC:11249
approved reserved:
1988-08-31

基因染色体位置

基因染色体位置

16p11.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SPN（Sialophorin，也称为CD43）是一种高度糖基化的跨膜蛋白，属于白细胞表面抗原家族（CD分子家族）。它主要表达于T细胞、B细胞、中性粒细胞和血小板等造血细胞表面，通过其胞外段的大量唾液酸修饰（一种糖分子）参与细胞间相互作用和免疫调节。SPN的生物学功能包括调节T细胞活化、黏附和迁移，并通过其带负电的唾液酸残基排斥其他细胞或分子，防止免疫细胞过度聚集。其作用位点集中在免疫突触（免疫细胞间信号传递的连接区域）和炎症部位，通过与其他受体（如ICAM-1）或配体相互作用影响免疫应答。SPN基因突变可能导致其糖基化异常，与自身免疫疾病（如系统性红斑狼疮）和免疫缺陷相关，突变后可能削弱细胞间信号传导或导致异常免疫激活。若SPN过表达，可能抑制T细胞受体信号通路，降低免疫反应，与某些淋巴瘤的免疫逃逸有关；而表达降低则可能增加细胞黏附，促进炎症或自身免疫反应。SPN属于CD分子基因家族，该家族成员多为细胞表面标记物，参与免疫识别、细胞通讯和信号转导。其共性包括跨膜结构域、可变糖基化修饰及免疫调控功能。目前中文常将Sialophorin音译为“唾液酸蛋白”，但更准确的意译应为“唾液酸载体蛋白”（原英文：Sialophorin）。

The protein encoded by this gene is a major sialoglycoprotein found on the surface of thymocytes, T lymphocytes, monocytes, granulocytes, and some B lymphocytes. It may be part of a physiologic ligand-receptor complex involved in T-cell activation. During T-cell activation, this protein is actively removed from the T-cell-APC (antigen-presenting cell) contact site, suggesting a negative regulatory role in adaptive immune response. [provided by RefSeq, Sep 2011]

由该基因编码的蛋白质是胸腺细胞，T淋巴细胞，单核细胞，粒细胞，和一些B淋巴细胞表面上发现的主要唾液酸糖蛋白。它可能是参与T细胞活化的生理配体 - 受体复合物的一部分。在T细胞活化，该蛋白质积极从T细胞的APC（抗原呈递细胞）的接触位点去除，这表明在适应性免疫应答的负调节作用。 [由RefSeq的，2011年9月提供]

OMIM数据库中对SPN基因的介绍     Wikipedia数据库中对SPN基因的介绍

基因序列

基因序列

SPN基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SPN基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs10537821       rs12596477       rs12598980       rs12928754       rs12929333       rs12932957       rs34539498       rs57632597       rs62059023       rs62059024       rs66637335       rs71962532       rs75478826       rs75935454       rs78850123       rs80140499       rs111730200      

基因表达

基因表达

SPN基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGTGCTGCGTCCTTATCAG
60
CCCAAGGAGAAGGAGAAGC
60
AATTGCTTGAAACCGGGAG
59
CTAGAGTGCAATGACACGA
57
ATCCTGATTCCAGATCCCAC
59
AAGGAGAAGGAGAAGCGTG
59
AGTGCTGCGTCCTTATCAG
60
CCCAAGGAGAAGGAGAAGC
60
TAAGTGTCGGTGAATAGTGAG
57
GGAGTCTTGCTTCTGTCTC
58
AGTGCTGCGTCCTTATCAG
60
CAAGGAGAAGGAGAAGCGT
59
AGTGCTGCGTCCTTATCAG
60
CAAGGAGAAGGAGAAGCGT
59
AAGTGTCGGTGAATAGTGAG
57
GGAGTCTTGCTTCTGTCTC
58
TCCTGATTCCAGATCCCAC
59
CAAGGAGAAGGAGAAGCGT
59
CTCATGCCTGTAATCCCAG
58
TCCTAGACTCAAGCAATCCTC
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
SP1
SPN
Activation
8055899

基因本体信息

SPN基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SPN基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
C9JUK7 (UniProtKB)
IEA
GO:0001562
P16150 (UniProtKB)
IEA
GO:0001808
P16150 (UniProtKB)
IEA
GO:0001931
P16150 (UniProtKB)
IEA
GO:0001934
P16150 (UniProtKB)
IEA
GO:0004888
P16150 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
P16150 (UniProtKB)
IPI
GO:0005604
P16150 (UniProtKB)
IEA
GO:0005615
P16150 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
P16150 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P16150 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
P16150 (UniProtKB)
IEA
GO:0006935
P16150 (UniProtKB)
TAS
GO:0006955
P16150 (UniProtKB)
TAS
GO:0006968
P16150 (UniProtKB)
TAS
GO:0007162
P16150 (UniProtKB)
TAS
GO:0007163
P16150 (UniProtKB)
TAS
GO:0007165
P16150 (UniProtKB)
TAS
GO:0007166
P16150 (UniProtKB)
IEA
GO:0009897
P16150 (UniProtKB)
IEA
GO:0009986
P16150 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
P16150 (UniProtKB)
IDA
GO:0031295
P16150 (UniProtKB)
IEA
GO:0042102
P16150 (UniProtKB)
IEA
GO:0042130
P16150 (UniProtKB)
IEA
GO:0042535
P16150 (UniProtKB)
IDA
GO:0042742
P16150 (UniProtKB)
IDA
GO:0045060
P16150 (UniProtKB)
IEA
GO:0050688
P16150 (UniProtKB)
IEA
GO:0050900
P16150 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
P16150 (UniProtKB)
IDA
GO:0097190
P16150 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SPN基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Calcinosis 0.12 1 0 CTD_human
Heart valve disease 0.12 1 0 CTD_human
Arthritis, Experimental 0.08 1 0 RGD
Mucosa-Associated Lymphoid Tissue Lymphoma 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Adenoid Cystic Carcinoma 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Wiskott-Aldrich Syndrome 0.002985861 11 0 BeFree
Adenoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Immunologic Deficiency Syndromes 0.001085767 4 0 BeFree
Tuberculosis 0.000542884 2 0 BeFree
Ki-1+ Anaplastic Large Cell Lymphoma 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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