SPINK7 (serine peptidase inhibitor Kazal type 7)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SPINK7
locus group:
protein-coding gene
location:
5q32
gene_family:
Serine peptidase inhibitors, Kazal type
alias symbol:
ECG2|ECRG2
alias name:
esophagus cancer related gene 2
entrez id:
84651
ensembl gene id:
ENSG00000145879
ucsc gene id:
uc003lpd.4
refseq accession:
NM_032566
hgnc_id:
HGNC:24643
approved reserved:
2006-02-20

基因染色体位置

基因染色体位置

5q32
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SPINK7基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1862431       rs2303056       rs2303057       rs3214447       rs3749689       rs3749690       rs3815730       rs3815731       rs6580542       rs6860471       rs6875252       rs7700389       rs7703281       rs7707119       rs7707167       rs7713986       rs7720843      

基因表达

基因表达

SPINK7基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGCATGAAGATCACTGGG
58
TAAATGCTGCAGTCCACCT
59
TCTGTAGCAGCTCAGAAGC
59
ACTGGTAGGTATGTGATGGG
58
CAGCATGAAGATCACTGGG
58
GACAGACTAGCAGCTTCTG
57
ACCAGTTTGTGGTTCTGAC
57
TTTCAAGCTCTCGGTACAC
57
TCTCCTTCTGCTCTGTACAG
58
GTAAATGCTGCAGTCCACC
59
TTTGTGGTTCTGACTACATCAC
58
TTTCAAGCTCTCGGTACAC
57
TGTAGCAGCTCAGAAGCTG
59
AACTGGTAGGTATGTGATGGG
59
TCCAGCATGAAGATCACTG
57
CAGACTAGCAGCTTCTGAG
57
CCAGCATGAAGATCACTGG
58
ACAGACTAGCAGCTTCTGAG
59
TCTCCTTCTGCTCTGTACAG
58
TAAATGCTGCAGTCCACCT
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SPINK7基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SPINK7基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004867
P58062 (UniProtKB)
IBA
GO:0005515
P58062 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P58062 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P58062 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P58062 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P58062 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P58062 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P58062 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P58062 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P58062 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P58062 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P58062 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P58062 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P58062 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P58062 (UniProtKB)
IPI
GO:0005576
P58062 (UniProtKB)
IEA
GO:1900004
P58062 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SPINK7基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Esophageal Neoplasms 0.013254501 10 0 BeFree_GAD_LHGDN
Malignant neoplasm of esophagus 0.010086957 11 0 BeFree_GAD
Squamous cell carcinoma 0.005362824 2 0 BeFree_GAD_LHGDN
Adenocarcinoma 0.004734064 2 0 GAD
Esophageal carcinoma 0.002985861 11 0 BeFree
Pancreatitis, Chronic 0.002638474 1 0 BeFree_GAD
Pancreatic Neoplasm 0.002367032 1 0 GAD
Squamous cell carcinoma of esophagus 0.000814326 3 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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